[发明专利]一种基于妊娠糖尿病人血清LC/MS代谢组学分析方法无效
申请号: | 201310568472.2 | 申请日: | 2013-11-15 |
公开(公告)号: | CN103592389A | 公开(公告)日: | 2014-02-19 |
发明(设计)人: | 钟婧;郑淑莺;戴利成 | 申请(专利权)人: | 湖州市中心医院 |
主分类号: | G01N30/02 | 分类号: | G01N30/02 |
代理公司: | 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 | 代理人: | 汤东凤 |
地址: | 313000 浙江省*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 妊娠 糖尿病人 血清 lc ms 代谢 分析 方法 | ||
1.一种基于妊娠糖尿病人血清LC/MS代谢组学分析方法,包括:
(1)样品制备:收集正常孕妇及妊娠糖尿病孕妇的血清样本,经处理后准备进行LC/MS检测分析;
(2)LC/MS检测分析:将血清样本经色谱柱分离,并采用质谱检测分析;
(3)数据分析:提取并对齐仪器原始数据,获得无噪音干扰、可用于统计分析的数据,通过建立多维统计模型可视化地显示两组之间的代谢谱差异,获得两组之间的差异性代谢物,并对这些物质进行初步鉴定。
2.根据权利要求1所述的代谢组学分析方法,其特征在于,所述步骤(1)中处理方法为:取冷冻储存的样本,置室温下解冻15min,涡漩震荡5s;分别取100μL的样本加入300 μL HPLC级甲醇,涡漩震荡30s,4°C静置20min;所有样本进行冷冻离心,取200 μL上清液,转入进样小瓶。
3.根据权利要求1所述的代谢组学分析方法,其特征在于,所述步骤(1)中冷冻离心条件为12000rpm、 4°C、15min。
4.根据权利要求1所述的代谢组学分析方法,其特征在于,步骤(2)中LC/MS检测分析的仪器分析平台为LC-Q/TOF-MS,分离色谱柱为C18色谱柱(Agilent, 100 mm × 2.1 mm,1.8 μm);色谱分离条件为:柱温为40℃;流速0.4 mL/min;流动相组成A:水+0.1%甲酸,B:乙腈+0.1%甲酸;梯度洗脱;进样量为4 μL,自动进样器温度4℃。
5.根据权利要求1所述的代谢组学分析方法,其特征在于,步骤(2)质谱条件:正离子模式条件:以氮气作为雾化、锥孔气;飞行管检测模式V型;正离子模式条件为:毛细管电压4 kV、锥孔电压35 kV、离子源温度100 ℃;脱溶剂气温度350 ℃、反向锥孔气流50 L/h、脱溶剂气600 L/h、萃取锥孔4 V;离子扫描时间0.03 s、扫描时间间隔0.02 s、数据采集范围:50-1000 m/z;应用亮氨酸-脑啡肽作为锁定质量,正离子模式下产生[M+H]+离子556.2771 Da。
6.根据权利要求1所述的代谢组学分析方法,其特征在于,所述步骤(3)中提取并对齐仪器原始数据,获得无噪音干扰、可用于统计分析的数据为:采用Agilent MassHunter 工作站采集总离子流图(TIC)进行可视化检查,通过多个样本图谱的重叠,判断仪器在分析样本时是否符合代谢组学分析要求,进行稳定性和重复性的考察。
7.根据权利要求1所述的代谢组学分析方法,其特征在于,步骤(3)中在建立多维统计模型具体为:在R软件平台下采用自写的程序代码提取原始数据信号(峰识别和积分),然后进行保留时间校正、峰对齐和反卷积分析(质谱碎片归属),最后在EXCEL软件中进行后期编辑,将结果组织为二维数据矩阵,包括变量保留时间Rt,质荷比m/z、观察量(样本)和积分面积;将编辑后的数据矩阵导入Simca-P软件(版本11.0)分别进行主成分分析(PCA),偏最小二乘方判别分析(PLS-DA),正交偏最小二乘方分析(OPLS)并且按照OPLS的VIP值挖掘差异代谢物质。
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