[发明专利]一种基于遗传信息和优良性状的凡纳滨对虾基础群体的构建方法

说明书

技术领域

本发明属于遗传育种技术领域，具体地说涉及一种基于遗传信息和优良性状的凡纳滨对虾基础群体的构建方法。

背景技术

在育种中要实施选育进行改良，必须具备完善的基础群体，这也是育种的重要基础。而作为基础群体必须具有丰富的遗传变异和具有需要改良性状的优良基因。实践证明建立遗传基础丰富的群体是提高选育效果的关键因素，但是并不是群体越大越好，因为组群材料越多不良基因混入群体的机会越大，势必影响基础群体的种质。为了保证基础群体的遗传多样性，减少不良基因的渗入，节省财力和人力，有必要综合考虑各项因素。

凡纳滨对虾，是世界上养殖产量最高的虾类之一。自20世纪90年代引进我国以来，因为其具有生长快、适应范围广、抗病抗逆性强、对食物要求不高、容易养殖等特点得到了快速的发展。但是目前我国优良的凡纳滨对虾种质主要靠从美国和厄瓜多尔等地的先进育种公司引入，而进口的原种只能满足养殖苗种需求的20%，剩余的是来源于其多代自繁苗种。这种苗种提供的方式已经使我国养殖的凡纳滨对虾出现了发病率与死亡率上升、生长速度下降、规格参差不齐、形态畸形等种质衰退的现象，严重影响了对虾养殖业的经济效益，已经制约了其养殖产业的可持续发展。

发明内容

本发明的目的在于提供一种基于遗传信息和优良性状的凡纳滨对虾基础群体的构建方法，本发明获得了具有较高遗传多样性以及较多优良基因的凡纳滨基础群体，解决了在选择育种过程中，由于引进群体的遗传背景不清楚导致基础群体近交水平高、遗传变异不够丰富而造成凡纳滨对虾选育进展有限的问题。

为实现上述发明目的，本发明采用下述技术方案予以实现：

一种基于遗传信息和优良性状的凡纳滨对虾基础群体的构建方法，所述方法包括以下步骤：

（1）、选用多个具有不同优良性状的凡纳滨对虾群体，并对群体内所有个体进行编号；

（2）、利用分子标记对所述凡纳滨对虾个体进行遗传分析，检测个体间的亲缘关系，具体包括下述子步骤：

a、从凡纳滨对虾的大量微卫星位点中筛选出具备重复性好、稳定性好、符合哈代温伯格平衡定律、无连锁关系、不存在无效等位基因、多态信息含量值大于0.60的高多态性微卫星位点，以便于精确地计算个体间的亲缘关系；

b、分别提取所有个体的基因组DNA，每个个体的基因组DNA均使用筛选出的高多态性微卫星位点的正反向引物，分别进行PCR扩增；

所述PCR扩增体系为：100ng每个个体的基因组DNA；10×PCR Buffer，2.5μL；Mg²⁺，1.5mmol/L；5U/μL的rTaq，0.2μL；10mmol/L的dNTP，0.5μL；10μmol/L的所述正反向引物各0.5μL；加双蒸水补体系到25μL；

所述PCR扩增程序为：94℃预变性5min，94℃预变性30s，退火30s，延伸40s，循环32次，72℃延伸10min，4℃保存；

c、通过对PCR产物检测获得每个个体在每对正反向引物的遗传变异图谱信息；

d、利用图谱分析软件对所有的遗传变异图谱信息进行数字化处理；

e、将数字化数据信息导入亲缘分析软件计算，获得亲缘关系信息；

（3）、根据个体间的亲缘关系以及个体的优良性状制定配种方案，建立大量家系，构建出基于遗传信息和优良性状的凡纳滨对虾基础群体。

进一步的，所述步骤（1）中优良性状为生长快、抗病性强、出肉率高、抗逆性强或存活率高中的一种或几种。

进一步的，所述步骤（3）中亲缘关系的度量指标采取亲缘系数，所述亲缘系数保持在0.050及以下。

进一步的，所述步骤c中将PCR产物经8%非变性聚丙烯酰胺凝胶-EB染色系统进行检测，在凝胶成像系统下观察，在不同个体间获得的多态性等位基因，就是本位点的遗传变异图谱信息。

进一步的，所述步骤d中使用的图谱分析软件为Quantity One4.5软件。

进一步的，所述步骤e中使用的亲缘分析软件为POPGEN软件和PHYLIP软件。