[发明专利]一种基于遗传信息和优良性状的凡纳滨对虾基础群体的构建方法有效
申请号: | 201310329920.3 | 申请日: | 2013-07-31 |
公开(公告)号: | CN103416333A | 公开(公告)日: | 2013-12-04 |
发明(设计)人: | 卢霞;栾生;王伟继;孔杰 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院黄海水产研究所 |
主分类号: | A01K61/00 | 分类号: | A01K61/00;C12Q1/68 |
代理公司: | 青岛联智专利商标事务所有限公司 37101 | 代理人: | 王晓晓 |
地址: | 266071 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 遗传信息 优良 性状 凡纳滨 对虾 基础 群体 构建 方法 | ||
1.一种基于遗传信息和优良性状的凡纳滨对虾基础群体的构建方法,其特征在于所述方法包括以下步骤:
(1)、选用多个具有不同优良性状的凡纳滨对虾群体,并对群体内所有个体进行编号;
(2)、利用分子标记对所述凡纳滨对虾个体进行遗传分析,检测个体间的亲缘关系,具体包括下述子步骤:
a、从凡纳滨对虾的大量微卫星位点中筛选出具备重复性好、稳定性好、符合哈代温伯格平衡定律、无连锁关系、不存在无效等位基因、多态信息含量值大于0.60的高多态性微卫星位点,以便于精确地计算个体间的亲缘关系;
b、分别提取所有个体的基因组DNA,每个个体的基因组DNA均使用筛选出的高多态性微卫星位点的正反向引物,分别进行PCR扩增;
所述PCR扩增体系为:100 ng每个个体的基因组DNA;10×PCR Buffer,2.5 mL;Mg2+,1.5 mmol/L;5U/mL 的rTaq,0.2 mL;10 mmol/L 的dNTP,0.5 mL;10 mmol/L的所述正反向引物各0.5 mL;加双蒸水补体系到25 mL;
所述PCR扩增程序为:94 ℃预变性5 min,94 ℃预变性30 s,退火30 s,延伸40 s,循环32次,72 ℃延伸10min,4 ℃保存;
c、通过对PCR产物检测获得每个个体在每对正反向引物的遗传变异图谱信息;
d、利用图谱分析软件对所有的遗传变异图谱信息进行数字化处理;
e、将数字化数据信息导入亲缘分析软件计算,获得亲缘关系信息;
(3)、根据个体间的亲缘关系以及个体的优良性状制定配种方案,建立大量家系,构建出基于遗传信息和优良性状的凡纳滨对虾基础群体。
2.根据权利要求1所述的一种基于遗传信息和优良性状的凡纳滨对虾基础群体的构建方法,其特征在于:所述步骤(1)中优良性状为生长快、抗病性强、出肉率高、抗逆性强或存活率高中的一种或几种。
3.根据权利要求1或2所述的一种基于遗传信息和优良性状的凡纳滨对虾基础群体的构建方法,其特征在于:所述步骤(3)中亲缘关系的度量指标采取亲缘系数,所述亲缘系数保持在0.050及以下。
4.根据权利要求1所述的一种基于遗传信息和优良性状的凡纳滨对虾基础群体的构建方法,其特征在于:所述步骤c中将PCR产物经8%非变性聚丙烯酰胺凝胶-EB染色系统进行检测,在凝胶成像系统下观察,在不同个体间获得的多态性等位基因,就是本位点的遗传变异图谱信息。
5.根据权利要求1所述的一种基于遗传信息和优良性状的凡纳滨对虾基础群体的构建方法,其特征在于:所述步骤d中使用的图谱分析软件为Quantity One 4.5软件。
6.根据权利要求1所述的一种基于遗传信息和优良性状的凡纳滨对虾基础群体的构建方法,其特征在于:所述步骤e中使用的亲缘分析软件为POPGEN软件和PHYLIP软件。
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