[发明专利]使用纳米通道阵列的大分子分析方法

权利要求书

1.一种能够操作单个伸长的大分子的纳米流体装置，包括：

基体，包含表面和一个或多个基本平行于表面布置的流体纳米通道区段，其中至少一个流体纳米通道区段能够容纳并伸长驻留在流体纳米通道区段的至少一部分内的大分子的至少一部分，并且其中每个流体纳米通道区段具有小于大约1000nm的横截面直径和至少大约10nm的长度；以及

至少一个观察窗，其中观察窗能够允许对一个或多个流体纳米通道区段的至少一部分内含物进行光学检查。

2.权利要求1的装置，包含多个彼此不流体连接的流体纳米通道区段。

3.权利要求2的装置，其中多个流体纳米通道区段基本上平行。

4.权利要求1的装置，包含多个流体纳米通道区段，其中流体纳米通道区段的至少一部分彼此流体连接。

5.权利要求4的装置，其中多个彼此流体连接的流体纳米通道区段布置成分支的样式。

6.权利要求1的装置，其中一个或多个流体纳米通道区段的特征为曲折的形式。

7.权利要求1的装置，其中一个或多个流体纳米通道区段被描述为具有变化的横截面尺寸。

8.权利要求1的装置，其中至少一个流体纳米通道区段包含凸起、膨胀、隆起、柱杆、阻塞，或其任一组合。

9.权利要求1的装置，其中至少一个流体纳米通道区段具有小于大约200nm的特征性横截面直径。

10.权利要求1的装置，其中至少一个流体纳米通道区段具有小于大约50nm的特征性横截面直径。

11.权利要求1的装置，其中至少一个流体纳米通道区段具有小于大分子回转半径的大约2倍的特征性横截面直径。

12.权利要求1的装置，其中至少一个流体纳米通道区段具有至少大约大分子的持久长度的特征性横截面直径。

13.权利要求1的装置，其中至少一个流体纳米通道区段具有至少大约100nm的长度。

14.权利要求1的装置，其中流体纳米通道区段以每立方厘米至少1个流体纳米通道区段的密度存在。

15.权利要求1的装置，其中观察窗含有狭缝。

16.权利要求1的装置，其中观察窗是可移除的。

17.权利要求1的装置，其中一个或多个流体纳米通道区段的特征为沟槽。

18.权利要求17的装置，还包含能够覆盖至少一个沟槽的至少一部分的盖子。

19.权利要求18的装置，其中盖子是透光的。

20.权利要求1的装置，其中一个或多个流体纳米通道区段的特征为管道。

21.权利要求1的装置，其中一个或多个流体纳米通道的特征为由一个或多个具有表面化学物质的区域分界的区带。

22.权利要求21的装置，其中表面化学物质包括疏水物质、亲水物质、表面活性剂、硫醇、胺、羟基、醇、羰基，或其任一组合。

23.权利要求1的装置，其中大分子是双链DNA、单链DNA、RNA，或其任一组合。

24.检测目标基因组中的拷贝数异常的方法，所述方法包括：

提供包含目标基因组的分离的核酸分子的第一样品；

标记目标基因组的核酸分子的一个或多个区域；

将目标基因组的核酸分子的至少第一区域的至少一部分移位通过基本上平行于基体表面布置的流体纳米通道区段，其中流体纳米通道区段能够容纳核酸区域的至少一部分，并且其中第一个流体纳米通道区段具有小于大约1000nm的特征性横截面尺寸和至少大约10nm的长度；

捕获对应于目标基因组的第一区域的信号以确定目标基因组的特征性的标记样式；

将目标基因组的标记样式与相应的对照的标记样式进行比较；以及

从所述比较确定目标基因组的核酸分子的至少一个区域的拷贝数。

25.权利要求24的方法，其中所述对照是目标基因组的第二区域。

26.权利要求25的方法，其还包括确定第一区域和第二区域的拷贝数，然后比较第一区域和第二区域的拷贝数。

27.权利要求26的方法，其中第一区域是与三体连锁的区域，并且第二区域不同于所述三体连锁的区域。