[发明专利]CC2D2A基因突变体及其应用有效
| 申请号: | 201310184623.4 | 申请日: | 2013-05-17 |
| 公开(公告)号: | CN104164424A | 公开(公告)日: | 2014-11-26 |
| 发明(设计)人: | 江泓;孙占芳;陈召;唐北沙;肖晶晶;呙军;张建国 | 申请(专利权)人: | 中南大学湘雅医院;深圳华大基因科技有限公司 |
| 主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C07K14/47;C12Q1/68;C12M1/34;C12N5/10 |
| 代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 李志东 |
| 地址: | 410008*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | cc2d2a 基因 突变体 及其 应用 | ||
1.一种分离的编码CC2D2A基因突变体的核酸,其特征在于,与SEQ ID NO:1相比,所述核酸具有选自下列的至少一种突变:c.2999A>T,c.3688C>T。
2.一种分离的多肽,其特征在于,与SEQ ID NO:2相比,所述分离的多肽具有选自下列的至少一种突变:p.Glu1000Val、p.Arg1230X,
任选地,所述多肽是由权利要求1所述的核酸编码的。
3.一种筛选易患Joubert综合征的生物样品的方法,其特征在于,包括以下步骤:
从所述生物样品提取核酸样本;
确定所述核酸样本的核酸序列;
所述核酸样本的核酸序列与SEQ ID NO:1相比,具有选自c.2999A>T,c.3688C>T的至少一种突变是所述生物样品易患Joubert综合征的指示,
任选地,所述生物样品为选自人体血液,
任选地,所述核酸样本为全基因组DNA,
任选地,所述Joubert综合征是常染色体隐性遗传疾病。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,从所述生物样品提取核酸样本进一步包括:
从所述生物样品提取RNA样本,优选所述RNA样本为mRNA;以及
基于所述RNA样本,通过反转录反应,获得cDNA样本,所述cDNA样本构成所述核酸样本。
5.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,确定所述核酸样本的核酸序列进一步包括:
针对所述核酸样本,构建核酸测序文库;以及
对所述核酸测序文库进行测序,以便获得由多个测序数据构成的测序结果,任选地,采用选自Hiseq2000、SOLiD、454和单分子测序装置的至少一种对所述核酸测序文库进行测序,
任选地,针对所述核酸样本,构建核酸测序文库进一步包括:
利用CC2D2A基因外显子特异性引物,对所述核酸样本进行PCR扩增;以及
针对所得到的扩增产物,构建所述核酸测序文库,
任选地,所述CC2D2A基因外显子特异性引物具有如SEQ ID NO:3-6所示的核苷酸序列。
6.一种筛选易患Joubert综合征的生物样品的系统,其特征在于,包括:
核酸提取装置,所述核酸提取装置用于从所述生物样品提取核酸样本;
核酸序列确定装置,所述核酸序列确定装置与所述核酸提取装置相连,用于对所述核酸样本进行分析,以便确定所述核酸样本的核酸序列;
判断装置,所述判断装置与所述核酸序列确定装置相连,以便基于所述核酸样本的核酸序列与SEQ ID NO:1相比,是否具有c.2999A>T,c.3688C>T的至少一种突变,判断所述生物样品是否易患Joubert综合征;
任选地,所述Joubert综合征是常染色体隐性遗传疾病。
7.根据权利要求6所述的系统,其特征在于,所述核酸提取装置进一步包括:
RNA提取单元,所述RNA提取单元用于从所述生物样品提取RNA样本;以及
反转录单元,所述反转录单元与所述RNA提取单元相连,用于对所述RNA样本进行反转录反应,以便获得cDNA样本,所述cDNA样本构成所述核酸样本。
8.根据权利要求6所述的系统,其特征在于,所述核酸序列确定装置进一步包括:
文库构建单元,所述文库构建单元用于针对所述核酸样本,构建核酸测序文库;以及
测序单元,所述测序单元与所述文库构建单元相连,用于对所述核酸测序文库进行测序,以便获得由多个测序数据构成的测序结果,
任选地,所述文库构建单元进一步包括:
PCR扩增模块,所述PCR扩增模块中设置有CC2D2A基因外显子特异性引物,以便利用所述特异性引物,对所述核酸样本进行PCR扩增,
任选地,所述特异性引物具有如SEQ ID NO:3-6所示的核苷酸序列,
任选地,所述测序单元包括选自HISEQ2000、SOLiD、454和单分子测序装置的至少一种。
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