[发明专利]南方红豆杉SSR-PCR反应体系及其应用在审
| 申请号: | 201310117573.8 | 申请日: | 2013-04-07 |
| 公开(公告)号: | CN104099319A | 公开(公告)日: | 2014-10-15 |
| 发明(设计)人: | 付伟;任鹤;朱振营;黄新 | 申请(专利权)人: | 中国检验检疫科学研究院 |
| 主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王朋飞;张庆敏 |
| 地址: | 100029 北京市朝*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 南方 红豆杉 ssr pcr 反应 体系 及其 应用 | ||
1.南方红豆杉SSR-PCR反应体系,其特征在于,所述反应体系总体积20uL,其中,上、下游引物各2μM、dNTP 40μM、Taq DNA聚合酶1U、Mg2+1.0mM和模板DNA 75ng,以ddH2O配制;
其中,上游引物F:5′-TGCGGAGTCATGTACAACTTAA-3′;下游引物R:5′-CCCTTGCTTTGTACCATATGTGA-3′。
2.根据权利要求1所述的SSR-PCR反应体系,其特征在于,PCR扩增程序为:94℃ 5min;94℃ 45s,56℃ 45s,72℃ 45s,35个循环;60℃ 30min。
3.根据权利要求1或2所述的SSR-PCR反应体系,其特征在于,模板DNA的提取包括以下步骤:
(1)取-70℃保存的南方红豆杉嫩叶0.5~1g,放入经液氮预冷的研钵中,加入液氮研磨成粉末;
(2)将粉末快速转移到2mL离心管中,加入1mL 65℃预热的CTAB提取液,充分混匀,65℃水浴30~45min。其间不时摇动离心管使之混匀;
(3)取出离心管,4℃ 12000rpm离心10min,取上清到新离心管中;
(4)加入等体积的Tris平衡酚/氯仿/异戊醇轻轻地颠倒混匀,放置10min,4℃ 12000rpm离心10min;其中,Tris平衡酚、氯仿、异戊醇的体积比为25:24:1;
(5)重复步骤(4);
(6)吸上清到新离心管中,加入2-3倍体积的-20℃预冷无水乙醇和1/10体积醋酸钠,混匀,-20℃放置30min以上,沉淀DNA;
(7)4℃ 12000rpm离心10min,70%乙醇洗涤沉淀两次,自然风干,加入300-500μL去离子水和2μL RNase溶解DNA,并于37℃水浴30min-1h;
(8)溶解后的DNA再用氯仿/异戊醇抽提一次;其中,氯仿、异戊醇的体积比为24:1;
(9)沉淀用70%乙醇洗涤沉淀两次,然后自然风干后加入50μL去离子水;
(10)1%琼脂糖凝胶电泳检测其纯度及完整性,-20℃保存。
4.权利要求1-3任一项所述SSR-PCR反应体系在南方红豆杉SSR分子标记及辅助育种中的应用。
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