[发明专利]用于确定癌症治疗的可编程细胞模型在审
申请号: | 201280069883.0 | 申请日: | 2012-12-14 |
公开(公告)号: | CN104160400A | 公开(公告)日: | 2014-11-19 |
发明(设计)人: | 韦恩·R·丹特 | 申请(专利权)人: | 克里帝奥成果技术公司 |
主分类号: | G06F19/12 | 分类号: | G06F19/12;C12Q1/00;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 余刚;吴孟秋 |
地址: | 加拿大*** | 国省代码: | 加拿大;CA |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 确定 癌症 治疗 可编程 细胞 模型 | ||
1.一种给细胞状态建模的计算机实现方法,所述方法包括:
使用细胞模型基于模糊认知图来给健康细胞的至少一部分建模,所述细胞模型限定因子之间的关系,所述细胞模型存储在至少一台计算机中;
将疾病状态向量应用于所述细胞模型,所述疾病状态向量被配置成表示影响细胞的疾病;
基于所应用的所述疾病状态向量来获得所述细胞模型的病变细胞状态向量;以及
提供指示所述细胞模型的所述病变细胞状态向量的第一输出。
2.根据权利要求1所述的方法,还包括经由连接至至少一台计算机的网络接收所述疾病状态向量的指示。
3.根据权利要求1或2所述的方法,还包括通过连接至所述至少一台计算机的网络发送所述第一输出。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法,其中,所述疾病状态向量被作为策略通过一系列迭代应用的状态向量应用于所述细胞模型以获得所述病变细胞状态向量。
5.根据权利要求4所述的方法,还包括选择稳定的状态向量作为所述病变细胞状态向量。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的方法,其中,所述疾病状态向量建立在肿瘤的基因档案基础上。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的方法,其中,所述疾病状态向量表示细胞的基因突变。
8.根据权利要求1至7中任一项所述的方法,其中,所述疾病状态向量表示癌症的影响。
9.根据权利要求1至8中任一项所述的方法,其中,所述细胞模型包括矩阵,将所述疾病状态向量应用于所述细胞模型包括以迭代方式将所述矩阵乘以疾病状态向量以获得稳定的病变细胞状态向量。
10.根据权利要求1至9中任一项所述的方法,还包括:
修改所述病变细胞状态向量以获得被配置成表示疾病的提议治疗的治疗状态向量;
将所述治疗状态向量应用于所述细胞模型;
基于所应用的所述治疗状态向量来获得所述细胞模型的治疗细胞状态向量;以及
提供指示所述细胞模型的所述治疗细胞状态向量的第二输出。
11.根据权利要求10所述的方法,还包括经由连接至所述至少一台计算机的网络接收所述治疗状态向量的指示。
12.根据权利要求10或11所述的方法,其中,所述第二输出指示提议治疗的疗效。
13.根据权利要求10至12中任一项所述的方法,还包括通过连接至所述至少一台计算机的网络发送所述第二输出。
14.根据权利要求10至13中任一项所述的方法,其中,所述治疗状态向量表示针对至少一个细胞信号传导流程或途径的给予药物、放射治疗、免疫治疗或激素治疗中的一个或多个。
15.根据权利要求10至14中任一项所述的方法,其中,所述治疗状态向量被作为策略通过一系列迭代应用的状态向量应用于所述细胞模型以获得所述治疗细胞状态向量。
16.根据权利要求15所述的方法,还包括选择稳定的状态向量作为所述治疗细胞状态向量。
17.根据权利要求10至16中任一项所述的方法,其中,所述细胞模型包括矩阵,将所述治疗状态向量应用于所述细胞模型包括以迭代方式将所述矩阵乘以治疗状态向量以获得稳定治疗的细胞状态向量。
18.根据权利要求1至17中任一项所述的方法,其中,所述细胞模型至少表示细胞信号传导途径。
19.根据权利要求18所述的方法,其中,所述细胞模型至少部分建立在所述细胞信号传导途径的经验数据基础上。
20.根据权利要求18或19所述的方法,其中,所述疾病状态向量被配置成表示影响所述细胞信号传导途径的疾病。
21.根据权利要求1至20中任一项所述的方法,其中,所述第一输出指示标记基因的状态。
22.根据权利要求1至21中任一项所述的方法,其中,所述细胞模型建立在三价态或五价态模糊认知图基础上。
23.根据权利要求1至21中任一项所述的方法,其中,所述细胞模型建立在连续态模糊认知图基础上。
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