[发明专利]来源于灰盖鬼伞菌的漆酶2基因及其应用无效

专利信息
申请号: 201210592335.8 申请日: 2012-12-31
公开(公告)号: CN103045620A 公开(公告)日: 2013-04-17
发明(设计)人: 田永生;许晶;彭日荷;金晓芬;韩洪娟;韩静;王波;王丽娟 申请(专利权)人: 上海市农业科学院
主分类号: C12N15/53 分类号: C12N15/53;C12N9/02;C12N15/81;C02F3/00
代理公司: 上海开祺知识产权代理有限公司 31114 代理人: 费开逵
地址: 201106 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 来源于 灰盖鬼伞菌 基因 及其 应用
【说明书】:

技术领域

发明属微生物基因工程领域,涉及一种来源于灰盖鬼伞菌(Coprinopsis cinereaokayama)的漆酶2基因及其应用。

背景技术

漆酶(EC1.10.3.2)是一种含铜的氧化还原酶,属于氧化酶的蓝铜家族(Eur J Biochem187:341-352)。漆酶的应用范围很广,目前研究它的应用主要集中在它降解各种化工染料(J Ind Microbiol Biotechnol31:127-132)、芳香族类化合物(Microbial Cell Factories5:31)以及二酚、多酚类化合物(Process Biochemistry45:507-513)的功能。除此之外,漆酶在不同的物种发挥不同的功能:在昆虫中,它们参与甲壳的硬化;在植物中,参与细胞壁形成,还与木质素化和去木质素有关;在芽孢杆菌中,则是和抗紫外线的孢子组装有关;在一些植物致病性真菌利用这类酶免除植物抗毒素和鞣酸的作用。众所周知,漆酶给工业生产方面带来了巨大的贡献。大量的漆酶基因从植物(J Chem Soc43:472)、动物(万云洋,博士论文,武汉大学)和微生物(Microbiology148:4003–4014)中分离出来,进行了系统的研究。

在NCBI数据库中,收集了很多微生物的全基因组的信息,其中编码蛋白的序列都被注释了。但是大部分的蛋白的生化功能和生理功能都是未知的。因此研究注释蛋白的功能可以完善这些酶学,并运用到工业应用中去。

灰盖鬼伞菌属于层菌纲家族,是亚洲很受欢迎的药用菌类。它的化学成分已经研究的相当透彻。虽然灰盖鬼伞菌有8个漆酶基因,但是来自灰盖鬼伞菌的漆酶2的生理生化特性研究和对染料的脱色效果的研究目前还没有报道。

发明内容

本发明所要解决的技术问题在于提供一种来源于灰盖鬼伞菌(Coprinopsis cinereaokayama)的漆酶2基因及其应用。即通过化学合成方法得到所述的漆酶2基因,并将其应用于真核生物中进行表达和纯化,研究其生理生化特性和对甲基橙、结晶紫和孔雀石绿的脱色效果。

所述的漆酶2基因,其核苷酸序列如SEQ ID No1所示,它是根据毕氏酵母密码子偏爱通过化学合成方法制得的。即采用大量重叠的引物通过两步PCR进行全基因的合成(PTDS)(Nucleic Acids Research,2004,32:e98)。该方法是通过重叠延伸获得合成基因的片段,再通过最外侧的引物将全长的基因扩增得到。该方法的一个明显优势就是不需要对引物进行磷酸化处理。而且通过高通量的DNA合成仪器,可以较为便利地获得大量的引物。

所述的漆酶2基因,其具体合成方法如下:

1、根据毕氏酵母密码子偏爱设计引物

设计长度大概为60mer左右的覆盖整个漆酶2基因的寡核苷酸的序列50个,作为引物。利用PCR进行漆酶2基因扩增,在100μl反应体系中,P2~P29共48个引物的添加量为2ng,外侧引物P1和P50添加量为30ng,扩增条件为:94℃预热1min;94℃30s,52℃30s,72℃1.5min,72℃10min,使用的Taq DNA聚合酶为KOD FX taq酶(Toyobo公司,日本),共30个循环。

PCR结束后,1%琼脂糖胶回收片段,取10μl直接与T/A克隆载体相连(大连宝生物公司)。4℃连接过夜,高效转化于DH5α感受态中,获得长度为1500bp的阳性克隆,即为本发明的漆酶2基因,其核苷酸序列如SEQ ID No1所示,其编码的蛋白质的氨基酸序列如SEQID No2所示。

将上述制得的漆酶2基因转入真核生物细胞中。即将该漆酶2基因直接与真核表达载体pYM7909(Molecular Biology Report,2012Apr;39(4):3807-14)相连,经过DH5α克隆过的环形质粒单酶切使其线性化,取约1μl的线性DNA与80μl毕赤酵母感受态细胞混合后进行点击转化,然后涂布于固体SD山梨醇培养基(20g/L琼脂,20g/L葡萄糖,146g/L山梨醇,SD)上,28℃继续培养3天后获得白色菌落。挑取经测活呈阳性的毕赤酵母进行细胞外分泌表达纯化,即获得纯化后的漆酶2基因蛋白。然后对其进行酶动力学特性分析和生理生化特性分析。

实验结果证明,本发明合成的漆酶2基因是一类应用非常广泛的生物用酶,通过克隆,可以高效人工合成,通过对该基因真核表达和纯化,可以将其应用于染料脱色工业生产中。

附图说明

图1为本发明的以pYM7909质粒构建DNA表达单元的结构示意图。

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