[发明专利]基于随机优化的老年痴呆致病机理的分析方法有效

专利信息
申请号: 201210576323.6 申请日: 2012-12-26
公开(公告)号: CN103902851A 公开(公告)日: 2014-07-02
发明(设计)人: 彭丰斌;魏彦杰;张慧玲 申请(专利权)人: 中国科学院深圳先进技术研究院
主分类号: G06F19/12 分类号: G06F19/12
代理公司: 深圳市科进知识产权代理事务所(普通合伙) 44316 代理人: 宋鹰武
地址: 518055 广东省深圳*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 基于 随机 优化 老年痴呆 致病 机理 分析 方法
【权利要求书】:

1.一种基于随机优化的老年痴呆致病机理的分析方法,其特征在于,包括以下步骤:

S1、确定能量模型:采用ECEPP能量力场模型以及角度坐标系;

S2、搜索最小自由能蛋白质构型:包括

主进程,

S211、局部最小化方法获得能量上界Emin和能量下界Emax,初始化蛋白质系统的态密度对数S(E)、修正因子df,df|E=(κΘ(E0-E)+1)lnf,

其中,Θ(E0-E)为Heaviside分段函数,κ、E0、f是模型的参数;

S212、进行Metropolis式的随机变动,构建新构型,计算能量Enew、并修改Emin或Emax为Enew

S213、重复步骤S212,完成进程间通信,计算全局S(E);广播全局S(E)至所有从进程;

S214、执行步骤S212至步骤S213的迭代,Emin三次保持,迭代终止;

从进程,

S221、局部最小化方法获得能量上界Emin和下界Emax,初始化蛋白质系统的态密度对数S(E)、修正因子df,df|E=(κΘ(E0-E)+1)lnf,

其中,Θ(E0-E)为Heaviside分段函数,κ、E0、f是模型的参数;

S222、进行Metropolis式的随机变动,构建新构型,计算能量Enew、并修改Emin或Emax为Enew

S223、重复步骤S222,完成进程间通信,接收步骤S213计算的全局S(E);

S224、执行步骤S222、步骤S223,接收步骤S214迭代终止信息,停机;

S3、计算蛋白质的态密度:

主进程,

S311、初始化蛋白质系统的态密度对数S(E),直方图H(E),修正因子df,df|E=(κΘ(E0-E)+1)lnf,

其中,Θ(E0-E)为Heaviside分段函数,κ、E0、f是模型的参数;

S312、进行Metropolis式的随机变动,构建新构型,计算能量Enew

S313、重复步骤S312,完成进程间通信,计算全局S(E)、H(E);判断直方图平缓阈值,当满足是执行步骤S314,否则重复执行步骤S312、步骤S313迭代;

S314、改变df,并执行步骤S312至步骤S313的迭代,直至df小于第二阈值,获得蛋白质系统的相对的态密度

从进程,

S321、初始化蛋白质系统的态密度对数S(E),直方图H(E),修正因子df,df|E=(κΘ(E0-E)+1)lnf,

其中,Θ(E0-E)为Heaviside分段函数,κ、E0、f是模型的参数;

S322、进行Metropolis式的随机变动,构建新构型,计算能量Enew

S323、重复步骤S322,完成进程间通信,接收步骤S313计算的全局S(E)、H(E),即更新原S(E)、H(E);判断直方图平缓阈值,当满足是执行步骤S324,否则重复执行步骤S322、步骤S323迭代;

S324、改变df,并执行步骤S322至步骤S323的迭代,直至df小于第二阈值。

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