[发明专利]与黄瓜果瘤基因Tu共分离的显性分子标记有效
申请号: | 201210382888.0 | 申请日: | 2012-10-10 |
公开(公告)号: | CN102925434A | 公开(公告)日: | 2013-02-13 |
发明(设计)人: | 蔡润;杨绪勤;何欢乐;潘俊松;任国良 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12N15/29 |
代理公司: | 上海科盛知识产权代理有限公司 31225 | 代理人: | 杨元焱 |
地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 瓜果 基因 tu 分离 显性 分子 标记 | ||
技术领域
本发明涉及基因工程技术领域的分子标记,特别涉及两个与黄瓜果瘤基因Tu共分离的显性分子标记。
背景技术
黄瓜(Cucumis sativus L.)是葫芦科(Cucurbitaceae)甜瓜属(Cucumis)一年蔓生的草本植物,黄瓜作为世界十大重要的蔬菜作物之一,也是我国主栽蔬菜作物之一。
果实是黄瓜经济性状最重要的部分,黄瓜果实属于瓠果,由子房和花托共同发育而成。在黄瓜果实上有一个重要的性状是果瘤,果瘤是黄瓜果实表面的瘤状突起。果瘤基因的研究始于1913年,有果瘤是黄瓜的野生性状,果瘤性状是由Tu(Tuberculate fruit)基因调控,有果瘤(Tu)为显性,无果瘤(Tu)为隐性。在经典遗传图谱上,果瘤基因(Tu,Tuberculate fruit)和无光泽果皮基因(D)及一致果皮颜色基因(u,uniform immature fruit color)紧密连锁在一起。曹辰兴通过分离群体的遗传分析结果表明控制茎、叶、果实表皮毛性状的无毛基因对控制果瘤性状的果瘤基因存在隐性上位作用(曹辰兴等.黄瓜茎叶无毛性状与果实瘤刺性状的遗传关系.园艺学报,2001,28(6):565-566)。因此,果瘤基因Tu的研究将有助于揭示黄瓜果刺基因形成的分子机制,为黄瓜遗传和育种工作奠定基础。
2009年张微微等得出黄瓜果瘤性状属于单基因显性性状,利用247个F2群体将果瘤基因初步定位于第五染色体SSR标记16203和SCAR标记C_SC933之间,遗传距离分别为1.3cM和5.9cM,详细结果可以参看:Zhang W W等在《Theoretical and Applied Genetics》(理论应用遗传学)2009年第120卷第3期645-654页发表的题为《Identification and mapping of molecular markers linked to the tuberculate fruit gene in the cucumber(Cucumis sativus L.)》(黄瓜果瘤基因紧密连锁分子标记初步定位)一文,上述标记还存在分析群体相对较小,连锁距离相对较远等问题,候选区 间存在100多个候选基因,也没有对候选基因分析。
随着人们生活水平的提高,品质育种已提到重要位置。黄瓜果实刺瘤性状属于感观品质范畴。欧美温室类型的黄瓜为无果瘤、少刺的果皮,称其为水果黄瓜,其市场价格为普通黄瓜的2-3倍。外观光滑黄瓜污染少,清洗方便,食用卫生,是无公害蔬菜的理想品种。经检测表明:无瘤少刺黄瓜果肉农药残留量比有刺黄瓜低27%,果皮农药残留量低18%。黄瓜果瘤基因Tu控制果瘤的形成,它的研究将会推动品质育种进程。用与目的性状紧密连锁的分子标记进行标记辅助选择在黄瓜遗传育种中是十分有效的方法,分子标记是在DNA水平上对目标性状进行选择,具有高效、快速、不受环境条件限制等优点,可在苗期进行选择,加快育种的进程。
发明内容
本发明的目的,在于克服现有技术的不足,提供两个与黄瓜果瘤基因Tu共分离的显性分子标记。
本发明是通过以下技术方案实现的:
本发明涉及的第一个与黄瓜果瘤基因Tu共分离的显性分子标记,命名为DT-1,由序列表中SEQ ID NO.1所示的236个核苷酸组成,无果瘤基因不含有这236个核苷酸。世界各地有瘤黄瓜品种均含有该显性分子标记,无瘤黄瓜品种(除了突变体无毛无瘤品种gl)不含有该显性分子标记,该显性分子标记可以简便、快速、高通量地应用于世界各地黄瓜有瘤/无瘤类型(除了突变体无毛无瘤品种gl)的筛选。
上述与果瘤基因Tu共分离的显性分子标记,由SEQ ID NO.3所示的上游引物和SEQ ID NO.4所示的下游引物扩增得到。引物由上海生工合成。
本发明涉及的第二个与黄瓜果瘤基因Tu共分离的显性分子标记,命名为DT-2,由序列表中SEQ ID NO.2所示的468个核苷酸组成,无果瘤基因不含有这468个核苷酸。世界各地有瘤黄瓜品种均含有该显性分子标记,无瘤黄瓜品种(除了突变体无毛无瘤品种gl)不含有该显性分子标记,该显性分子标记可以简便、快速、高通量地应用于世界各地黄瓜有瘤/无瘤类型(除了突变体无毛无瘤品种gl)的筛选。
上述与果瘤基因Tu共分离的显性分子标记,由SEQ ID NO.5所示的上游引物和SEQ ID NO.6所示的下游引物扩增得到。引物由上海生工合成。
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