[发明专利]基于小波分析法处理溶解曲线的方法、装置和电子终端

说明书

技术领域

本发明涉及筛查突变（mutation scanning）、基因分型（MutationGenotyping）、SSR分析、检测甲基化等领域，具体涉及一种基于小波分析法处理溶解曲线的方法、装置和电子终端。

背景技术

在溶解曲线的有效温度范围内，由于SNPs（Single-nucleotide ploymorphisms，单核苷酸多态性）的基因型是“成对”检测的，因此纯合型时，就会发生其中的一个峰缺失（形成峰谷)，而另一峰抬高的情形。

以下描述产生SNPS或实验数据的设备/仪器的相关工作过程：

1、在实验过程中首先提取样本。

2、将提取的样本放入到毛细管中。

3、在毛细管中加入内标、模版、荧光染料以及DNA扩增酶等。

4、放入仪器，首先进行PCR（Polymerase Chain Reaction，聚合酶链式反应），通过温度的调节和扩增酶的作用将需要分析的STR（short tandem repeat，短串联重复序列）片段进行扩增。同时，此过程也是一个荧光染料与其相对应的DNA片段充分结合的过程。

5、扩增反应完成后，通过逐渐增加温度，随着反应中双链DNA变性，荧光染料又回复到游离状态导致荧光信号降低，实验仪器将自动检测该过程中荧光强度随时间的变化细节，也就是在整个检测过程中，单位时间所对应的荧光强度数值。

6、最后使用的是荧光信号改变的负的一次导数与温度的关系进行原始DNA分型图的绘制。

这个设备与计算机通信，把实验数据传给计算机的过程如下：整个实验完成后，相关的实验数据可以通过用户的设置，存储到与该实验仪器联网的任意一台计算机上。相关的实验数据可以通过机器自带的软件进行相关的输出，其格式具有多样性，比如excel，xml或txt等。

图1为现有技术的溶解曲线图，关于图1中的术语解释如下：A：Adenine腺嘌呤；C：Cytosine胞嘧啶；G：Guanine鸟嘌呤；T：Thymine胸腺嘧啶。纯合型：指两条染色体在同一位点上拥有相同的核苷酸；杂合型：指两条染色体在同一位点上拥有不同的核苷酸。CC纯合型：两条染色体在该位点上具有相同的核苷酸，该核苷酸为胞嘧啶。就峰图而言，CC纯合型表示在标准参考序的某个C下面出现了一个峰，并且这个峰具备纯合型峰的特征（比如强度较高，以及在其参考序左右相邻的核苷酸下没有出峰等）。TT纯合型：两条染色体在该位点上具有相同的核苷酸，该核苷酸为胸腺嘧啶。就峰图而言，TT纯合型表示在标准参考序的某个T下面出现了一个峰，并且这个峰具备纯合型峰的特征（比如强度较高，以及在其参考序左右相邻的核苷酸下没有出峰等）。CG杂合型：两条染色体在该位点上具有不同的核苷酸，该核苷酸为胞嘧啶。就峰图而言，CG杂合型表示在标准参考序的相邻两个核苷酸C，G下面分别出现了一个峰。图1中X轴表示PCR产物的退火温度，单位为摄氏度，Y轴表示荧光浓度（RFU）对温度的一阶导数，单位为mmol/L/摄氏度。

如图1所示，对于杂合型，由于两峰同时出现，且峰高相近，因此融合后致使峰型不明显，峰高较纯合型低，因此，箭头10所指的两个峰就表示了杂合型，该SNP3就判为CG型。另外，箭头20所指即为峰谷，注意相应的配对峰抬高，其中箭头20的左箭头所指的SNP4判断为CC纯合型，箭头20的右箭头所指SNP2为CC纯合型，SNP1为TT纯合型。图1中箭头10表示“峰抬高”，箭头20表示“峰缺失”。

通常情况下，我们用肉眼判断的经验是先看“峰缺失”和“峰抬高”，对于纯合型，这两种情况是同时出现的。对于没有出现峰缺失的连续峰，就直接判断为杂合型。其中，峰缺失和峰抬高都是针对原始数据曲线而言的，具体解释如下：峰缺失就是指非常明显不是峰的地方，可以理解为非常明显的波谷；峰抬高就是指非常明显的是峰的地方，可以理解为非常明显的峰。

目前，市面上还没有专门的设备能够对如上所述的溶解峰进行有效分离。发明人在实现本发明的过程中发现，现在技术的不足至少在于：纯合型峰变换后旁边会出现杂峰，从而使分析人员受到干扰；当没有出现明显“峰缺失”和“峰抬高”，而只是总体峰型较低，现有的分析技术不能给出正确的结果；目前的实验人员都是直接通过人眼查看原始数据曲线（如图1中的黑色曲线），然后通过经验来判断哪里出了峰，以及峰的具体位置，从而找到SNP位点，这样非常的消耗时间，并且可能因为经验的不足容易造成误判。

发明内容