[发明专利]运用比较基因组学快速鉴定木薯白粉病基因无效
申请号: | 201210095027.4 | 申请日: | 2012-03-31 |
公开(公告)号: | CN102796745A | 公开(公告)日: | 2012-11-28 |
发明(设计)人: | 钱孝英 | 申请(专利权)人: | 常熟市支塘镇新盛技术咨询服务有限公司 |
主分类号: | C12N15/29 | 分类号: | C12N15/29;C07K14/415;C12Q1/68 |
代理公司: | 苏州广正知识产权代理有限公司 32234 | 代理人: | 张利强 |
地址: | 215500 江苏省*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 运用 比较 基因组 快速 鉴定 木薯 白粉病 基因 | ||
1.木薯抗白粉病基因,其特征在于选自下列4个基因或其之一:
1)cassava4.1_023541m.g
氨基酸:
MAGGGGGRSLEETPTWAVAIVCFVLVLISIIIEYIIHLIGKWLKKKHKRALYEALEKIKSELMLLGFISLLLTVGQGLISNICIPEKVGSTWHPCSKKEEEKLNNSPSTDDDDETRRKLLSISDSGGSFRRVLAGSATTDKCGEGKVPFVSSDGIHQLHIFIFVLAVFHVLYSFLTMALGRAKMRRWKSWEKETRTIEYQFSHDPERFRFARETSFGRRHLSFWTKTPVLIWVVCFFRQFVRSVPKVDYLTLRHGFIMAHLAPQSHMKFNFQKYINRSLEEDFKVVVGISPPIWFFAVLFLLFNTHGWYSYLWLPFIPLIIILLVGTKLQVIITKMAIRIQERGEVVKGVPVVQPGDHLFWFNRPSLLLYLINFVLFQNAFQLAFFAWSWKEFGIKSCFHEHLEDIIIRISMGVLIQILCSYVTLPLYALVTQMGSSMKPTIFNERVAAALRNWHQTAKKQIKRNKGSITPMSSKPTTPSHHISPVHLLRYYQNDIHNLQDSPRRSNFGWETDSPSPSHPNYGEGSSSSHYLNRGDDSISHHYSFQQQQIELNNIESDRNVNEPSSSQVASISEHEISVVPKEFSFDRRTSV
核苷酸:
ATGGCTGGCGGTGGCGGAGGAAGATCTCTGGAGGAGACGCCAACCTGGGCAGTCGCCATAGTTTGTTTTGTTTTAGTTTTGATTTCAATAATCATCGAATACATCATCCATCTTATAGGAAAGTGGTTAAAGAAGAAACACAAGAGAGCTCTTTATGAAGCACTTGAAAAGATCAAATCAGAGCTTATGTTGTTAGGTTTTATTTCCTTGCTTCTAACAGTAGGACAAGGTCTGATTTCAAATATATGCATACCAGAAAAAGTTGGATCAACCTGGCATCCATGCAGCAAGAAGGAAGAAGAGAAACTAAACAACTCCCCATCAACAGATGATGATGATGAAACCAGAAGAAAACTTCTCAGCATATCGGACTCCGGTGGAAGTTTCCGGCGTGTCTTGGCTGGCTCGGCAACAACAGACAAATGTGGTGAGGGTAAAGTTCCATTTGTGTCGTCAGATGGGATTCATCAACTCCATATTTTCATATTCGTGCTCGCAGTTTTTCATGTGCTTTACAGTTTCCTCACAATGGCTTTGGGCAGAGCCAAGATGAGGCGTTGGAAATCTTGGGAGAAGGAAACAAGAACTATTGAATACCAGTTTTCACACGATCCGGAAAGGTTCAGGTTTGCAAGAGAAACATCATTTGGAAGGAGACACTTGAGCTTTTGGACAAAGACACCTGTCCTTATTTGGGTTGTTTGCTTCTTTAGGCAATTTGTGAGGTCGGTTCCTAAAGTTGACTATTTAACATTGAGACATGGTTTTATCATGGCACATTTGGCACCTCAAAGCCACATGAAATTTAATTTCCAAAAATATATTAATAGGTCATTAGAAGAGGATTTCAAGGTTGTTGTTGGAATAAGCCCACCAATTTGGTTCTTCGCAGTTCTATTCTTACTCTTTAACACTCATGGGTGGTATTCTTATCTATGGCTTCCATTTATTCCACTTATAATCATCCTGTTGGTGGGGACAAAGCTACAGGTGATAATAACCAAAATGGCGATCAGAATTCAAGAGAGAGGTGAGGTAGTGAAGGGTGTGCCTGTGGTTCAGCCTGGAGATCACCTCTTCTGGTTCAACCGTCCAAGCCTTCTTCTTTATCTTATCAATTTTGTTCTCTTTCAGAATGCCTTCCAGCTTGCTTTTTTTGCATGGAGTTGGAAAGAATTTGGCATAAAATCTTGTTTCCATGAACATTTGGAGGATATAATCATCAGAATTTCAATGGGGGTACTTATACAAATACTTTGCAGCTATGTCACTCTCCCTCTCTATGCCCTTGTCACACAGATGGGTTCATCAATGAAGCCAACAATTTTCAACGAAAGAGTAGCTGCAGCGCTAAGAAACTGGCATCAAACGGCTAAAAAACAAATCAAAAGAAATAAGGGGTCCATCACCCCTATGTCTAGTAAACCAACCACACCATCCCACCATATATCGCCAGTGCACCTTCTCCGATATTACCAAAACGACATTCACAATCTTCAAGATTCTCCTAGAAGATCAAATTTCGGTTGGGAAACAGACTCTCCATCTCCTTCTCATCCTAATTATGGTGAAGGTTCATCGTCCTCACATTATCTGAATCGCGGTGACGATTCAATATCCCATCACTATTCCTTTCAGCAACAACAAATAGAGTTAAATAATATAGAATCCGATAGAAATGTAAATGAACCAAGTTCGAGTCAAGTGGCATCGATCTCAGAACATGAAATTAGTGTAGTGCCAAAGGAGTTTTCATTTGATAGAAGAACAAGTGTTTAA
2)cassava4.1_030963m.g
氨基酸:
MAGGGGGRSLEKTSTWAVAIVCFVLVLISLIIEYIIHLIGKWLKKKQKGALYEALEKIKSELMLLGFISLLLTIGQSPISNICISEKVGSTWHPCSKKKEVNINKVELPAREDENRRKLLKVSDSGGSLRRLLAGGTTDNCGTGKVPFVSSDGIHQLHIFIFVLAVFHVLYCVITMALGRAKMRRWKSWEMETGTAEYQFSHDPERFRFARETSFGRRHLSFPTKAPLLIWIVCFSRQFVRSVPKVDYLTLRHGFIMAHLAPQSHQKFNFQKYINRSLEEDFKVVVGISAPIWLFAIIFLLFNTHGWYTYLWLPFIPLIIILLVGTKLQVIITQMALRIQERGEVVKGVPVVQPGDDLFWFNRPRLILYLINFVLFQNAFQLAFFAWSWKEFGLRSCFHEHLEDIIIRVSMGILVQILCSYVTLPLYALVTQMGSSMKPTIFNERVAAALRKWHQAAKKHIKRKKGPVSITPISSKPATPLHHYMSPLHLLKYYQNEMDSLQNSPKKSNLIRWKSDTPSPSYTNYQGNDSSSTYHPNSGDGSSSQHHHQLQRVELSYGIEYEKKGNNEASSSEVRPISQHENDVEPKEFSFDRRASV
核苷酸:
ATGGCCGGTGGTGGAGGTGGAAGATCTCTGGAGAAAACGTCAACTTGGGCAGTAGCCATAGTTTGTTTTGTTTTGGTTTTGATTTCATTAATCATCGAATACATTATTCATCTTATTGGAAAGTGGTTAAAGAAGAAACAAAAGGGAGCTCTTTATGAAGCACTTGAAAAGATCAAGTCAGAGCTTATGCTATTAGGGTTTATATCCTTGCTTCTAACGATAGGACAAAGTCCAATATCAAACATATGCATATCAGAAAAAGTTGGATCTACTTGGCATCCATGCAGCAAGAAGAAAGAAGTGAATATAAACAAGGTTGAATTACCAGCAAGAGAAGATGAGAATCGCAGGAAACTTCTAAAGGTATCAGATTCCGGTGGAAGTCTCCGACGTTTATTGGCTGGGGGAACCACCGACAATTGTGGCACGGGTAAAGTCCCGTTTGTGTCGTCAGATGGCATTCATCAACTCCACATTTTCATATTCGTATTAGCGGTTTTTCATGTGCTTTACTGTGTCATCACCATGGCTTTGGGCAGAGCCAAGATGAGACGGTGGAAATCTTGGGAAATGGAAACAGGAACAGCCGAGTACCAGTTCTCTCACGATCCAGAAAGGTTCAGATTTGCGAGAGAAACATCATTTGGGAGGAGACACTTGAGCTTTCCGACCAAGGCACCACTCCTTATATGGATTGTTTGCTTCTCTAGGCAATTTGTAAGATCGGTTCCTAAAGTTGACTATTTGACCTTGAGACATGGTTTTATCATGGCACATTTGGCACCTCAAAGCCACCAGAAATTTAATTTCCAAAAATATATTAATAGGTCATTGGAAGAAGATTTCAAAGTCGTTGTGGGAATAAGTGCACCAATTTGGCTTTTCGCGATTATATTCTTACTCTTCAACACTCATGGGTGGTATACTTATCTATGGCTTCCATTTATTCCACTGATTATCATCCTTTTGGTGGGGACGAAGCTACAGGTAATAATAACCCAAATGGCACTTAGAATTCAAGAGAGAGGAGAAGTAGTGAAGGGAGTGCCTGTGGTTCAGCCTGGAGATGATCTCTTCTGGTTCAACCGTCCTCGCCTTATTCTTTACCTTATCAATTTTGTCCTCTTTCAGAATGCCTTCCAGCTTGCGTTCTTTGCATGGAGTTGGAAAGAATTTGGGCTAAGATCTTGTTTCCATGAACATTTGGAGGACATAATCATCAGAGTTTCAATGGGGATCCTTGTACAAATACTCTGCAGCTATGTTACTCTCCCTCTGTATGCCCTAGTAACTCAGATGGGCTCATCGATGAAACCAACCATCTTTAACGAGAGAGTAGCTGCAGCTCTAAGAAAATGGCACCAAGCGGCTAAAAAACACATTAAACGAAAGAAGGGACCTGTCTCTATCACCCCCATATCTAGCAAACCAGCCACACCATTGCATCACTATATGTCTCCGTTGCACCTACTTAAATACTATCAAAATGAAATGGATAGTCTCCAGAATTCTCCTAAAAAATCAAATTTAATTAGATGGAAAAGCGATACTCCGTCACCTTCTTACACTAACTATCAAGGCAATGATTCATCATCGACCTATCATCCTAATTCTGGCGATGGATCATCTTCACAACACCACCACCAACTGCAACGGGTTGAACTAAGTTATGGAATAGAGTATGAAAAGAAAGGCAATAATGAGGCAAGTTCAAGTGAAGTGAGACCAATTTCACAACATGAAAATGATGTAGAGCCAAAGGAATTTTCATTTGATAGAAGAGCAAGTGTTTAA
3)cassava4.1_004402m.g
氨基酸:
MSDTSKARSLEETPTWAVAVVCFVMIVISILIEHVIHMIEKWFKKIHKPALVEALEKIKAELMLMGFISLLLTALQDPISEICISQSVASTWHPCKSQKESKTETDSTDNRRRLLQFLDAGGSTRRYLAGKSEDKCAENGKVAFVSAYGIDQLHYFIFVLAVVHVLYCIITYILGRTKMRKWKAWERETKTLEYQYHNDPERFRFARDTSFGRRHLNLWSRSTVFVWIVCFFRQFFGSVTKIDYLTLRHGFIMAHLAPGSETRFDFQKYINRSLEDDFKVVVGISPVIWFIACLLLLTSTHGWYAYLWLPFIPLIIILVVGAKLQVIITQLGLRIQERGDVVKGAPVVQPGDDLFWFGRPRFILFLIHLVLFQNAFQLAFFAWSVWKIGTDSCYHDRTEDIVIKITMGVIIQFLCSYVTLPLYALVTQMGSSMRSTVFNDRVAAALKNWHQAAKKHAKHSKHSASQTPMSSRPATPTHGMSPIHLLHNYRSSTAPNSLQASPRNHNYNVDNWDPEALSSVHNQEADELEHIESPDIRDHDIEVEEQNSNSIMQLPPAPGSIRTQHELGVSLREFTFRK
核苷酸:
ATGTCTGATACCAGTAAAGCACGCTCTCTTGAAGAAACGCCTACATGGGCTGTTGCTGTGGTGTGCTTTGTGATGATTGTTATTTCAATCTTGATTGAGCATGTGATTCATATGATAGAAAAGTGGTTTAAGAAGATACATAAGCCAGCTCTTGTGGAAGCTCTTGAAAAGATTAAAGCAGAGCTGATGCTTATGGGATTTATATCCTTGCTTCTAACTGCTCTACAAGATCCCATCTCTGAAATTTGCATTTCACAGAGTGTTGCATCCACCTGGCATCCTTGCAAGAGTCAGAAAGAAAGCAAGACAGAAACAGATTCTACTGATAATCGTCGAAGACTTCTTCAGTTCTTAGATGCTGGAGGAAGCACTAGACGTTATTTAGCAGGCAAATCTGAAGATAAATGTGCAGAAAATGGTAAAGTTGCCTTTGTATCAGCATATGGAATTGATCAGCTCCATTATTTCATCTTTGTGCTAGCAGTTGTCCATGTGCTTTACTGCATAATTACATATATTTTGGGTAGAACAAAGATGAGAAAGTGGAAGGCATGGGAGAGAGAGACAAAGACACTTGAGTACCAATACCATAATGATCCAGAGAGGTTCAGGTTTGCAAGGGATACATCATTTGGACGAAGACATCTGAATCTATGGAGTCGATCAACAGTTTTCGTTTGGATCGTTTGTTTCTTTAGACAATTCTTTGGATCAGTCACCAAAATTGATTACCTGACATTGAGACATGGATTTATCATGGCACATTTGGCCCCTGGAAGTGAAACAAGATTTGATTTCCAGAAATACATCAACAGATCACTTGAAGATGACTTTAAAGTTGTAGTGGGAATCAGTCCAGTTATTTGGTTTATTGCCTGTTTGTTGCTGCTGACCAGCACACATGGTTGGTATGCTTATCTATGGTTACCTTTCATCCCACTAATTATAATTTTGGTGGTTGGGGCTAAGCTGCAAGTGATCATAACTCAACTGGGGCTAAGGATTCAAGAGAGAGGAGATGTAGTTAAGGGTGCTCCTGTGGTTCAACCAGGAGATGACCTCTTCTGGTTCGGACGTCCACGCTTTATTCTCTTCCTTATTCACTTGGTTCTCTTTCAGAATGCATTTCAGCTGGCTTTCTTCGCGTGGAGCGTGTGGAAAATTGGAACTGACTCTTGTTACCATGATCGCACTGAGGATATTGTAATCAAAATCACAATGGGGGTCATCATACAGTTCCTTTGCAGTTATGTGACACTGCCTCTATATGCTCTAGTGACACAGATGGGTTCTAGCATGAGATCAACAGTCTTTAATGACAGAGTAGCAGCAGCACTGAAGAACTGGCACCAGGCAGCCAAAAAACATGCTAAACACAGCAAACATTCAGCGTCTCAAACACCAATGTCAAGCAGACCAGCAACTCCAACACACGGCATGTCGCCTATCCATCTCTTGCATAACTACCGTAGCAGCACTGCTCCTAACAGCTTACAGGCTTCTCCAAGAAACCATAACTATAATGTAGACAATTGGGACCCTGAAGCACTAAGTTCTGTACACAATCAGGAGGCTGATGAGCTTGAACACATTGAAAGTCCTGATATTAGGGATCATGATATAGAAGTTGAAGAGCAAAACTCAAACTCAATAATGCAATTGCCTCCAGCACCAGGTTCCATCCGTACACAACATGAACTTGGTGTCAGCTTAAGAGAGTTCACGTTCAGGAAATGA
4)cassava4.1_004823m.g
氨基酸:
MSDTSKERSLGETPTWAVAVVCLVMIAISIFIEKVIHFIEKWFKKIHKPALVEALEKIKEELMLMGFISLLLTVLQGPISGICVSESIASTWHPCNKKKGNSKTETDSSNNRRRLFQFLDSGASNRRVLAAKSGDKCADEGKVTLISAYGIDQLHYFIFVLAVFHVLYCIITYILGRTKMRKWKTWENETRTIEYQYHNDPERFRFARDTSFGKRHLKLWSRSTVFVWIVCFFRQFFGSVTKVDYLTLRHGFIMAHLPPGSETSFDFQKYINRSLEDDFKSVVGIRILTLIRVLCSPLIWFLACLMMLTSTNGWYAYLWLPFIPLVVILVIGAKLQVIITKMGLRIQERGDVVKGAPVVQLGDDLFWFGRPRLILFLIHLVLFQNAFQLAFFIWSVWKIGPDSCYHDRIEDIVIKVTMGVIIQVLCSYVTLPLYALVTQMGSSMRPTIFNDRVATALKNWHHTAKKHAKHSKHSESHTPMSSRTATPTYGMSPVHLLHNYRSSTAPDSLQNSPRNYNYDADNWDPEALNTMQNLESDDSSHDNEHPEVEDQIQSIQVEEPNSNSILQLPQGTQHETGSREFTFRN
核苷酸:
ATGGAAAAAAAAAAGATTGATGAAGGCAAATCTTTGGCCATAACCCCTACATGGGCTTTGGCTACAGTTGTCACTGTTATGGTTTGTTTTGGTTTCTTCTTCCAAGTCCTTTTAGATCAGTTTGGAAAGTGGTTGGATAAGACTAAGAGGAAAGCGCTACTTTCAGCTCTGGAAAAGATCAAAGATGAGCTAATGCTTTTTGGGCTTCTGTCGTTGTTGATGGGTCATTGGGTTGTAATGGTGGCCAAGATTTGTGTCAAAACATCTACGGTGAGCAGCAGATTTTTCCCATGTGCAGTATATGATAATCTAAAACCAGAAGAAGGCAGGTTTGATTCAGCTTCAGGTTATGCAAATCATTCCTCTGATAGACAGGAGACGTACACACTGGTGCATGGACATGATAATTGCCCTGAGGGTCGCGAGTCTTTTGCTTCACAAGAAAGTCTAGAGCAGCTTCACCGTTTGATGTTTGTCCTAGGCGTTATCCATGTCTTGTATAGCTTTATTGCCATTGCCCTGGCAATGATTAAGATTTATAGCTGGAAAATTTGGGAACAACAAGCTAGGAAAATGGCGATTCAGTGCGCTCCTGGTTCTTCTCAAGCTGCATTGTTTAATAGAAGACTCTCTCGATTAACTACTTTCATTTCCAACCGTACATCCCATCCATGGAGCCGGCACAGCGTTCTTGTTTGGCTGCTCTGCTTCAGCCGCCAATTCTGGAGCTCTATAAACTATGCTGATTACATGGCTTTGCGTTACGGATTTGTCAATACACATGAACTTCCCTTGACTTATGATTTCCATAATTTTATGCTTCGAAGCATGGAGGAAGAATTTCGTGATGTTGTTGGCATTAGCTTGCCTCTCTGGATATATGCTATATGTTGCATTTTTCTGGATTTCCATGAAACTAAAATTTACTTTTGGATCTCCTTTCTTCCGGCCATTTTAATACTGCTAATTGGTACAAAACTTCACCGGGTAGTGGTCAAGTTGGCTGTTGAAATTTTAGATGCAGCTCCAAGGATGGGAAATCATCAGTTAAACCTGAGGGATGAGCTTTTTTGGTTTGGGAAGCCTAAACTTCTTTTGTGGTTAATTCAATTAATATCATTTCAAAATTCGTTCGAGATGGCAGCATTTGTATGGTCCCTGTGGGAGATCAGAGATTCTTCTTGTTTCATGAGTAATGAACTGTTTGCTATAATCCGGTTGATATTCGGGGTAGTCACACAGTTCTGGTGCAGCTTCATTACACTCCCACTCTATATAATCATCACACAGATGGATGCAAGGTTCAAGAAAGCTGTAGTATCTGAAAATGTAAGGCAATCTCTACATGGATGGAAAAGGAGAGTGAGGGCCAGGAATAGTTCCTCTTCTCTACACCACACTGGTGCATCATCTAAGTCCTCACTTAGTTCCACTTCTGCACACCTGAAAGGTTTATTATTCAGTTCCTCAAGTTCTGGCAAGCATAAGAACAAAAACAATGATTCTGCCTCGAGCAGCAGGCAAGGAAACAACACATCAGAAGTTCCAGATACACCAATCTCAAGTCAAGAGGCCTGTAATCCACAAGCTAATAAAAATTTTCCTGGGAATGAGCTTGATGATGGTAATGATAACGATCACAGACACAGAAATATCAGAAAGGGATAA。
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