[发明专利]一种新药创制方法无效
申请号: | 201210029955.0 | 申请日: | 2012-02-10 |
公开(公告)号: | CN102609586A | 公开(公告)日: | 2012-07-25 |
发明(设计)人: | 王世范 | 申请(专利权)人: | 王世范 |
主分类号: | G06F17/50 | 分类号: | G06F17/50 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 570228 海南省*** | 国省代码: | 海南;66 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 新药 创制 方法 | ||
1.一种新药创制方法,其特征在于,包括以下七步:(1)构建中医单方或复方化合物数据库:中医单方或复方的选择可以是历代经方、古方、偏方、秘方、验方、效方或民间方,方剂里各药味的化学成分是通过已有的各类期刊文献和各种网络资源来获得,化学成分2D或3D结构式的绘制是利用已有的各种免费或商用软件来绘制,使用数据库软件将这些化合物的2D或3D结构式导入到数据库中构建中医单方或复方化合物数据库;(2)构建中医单方或复方分子杂交数据库:利用中医单方或复方化合物数据库中的化合物分子为模板,利用遗传算法中的“交叉重组”思想,使用各种免费或商用软件,通过对中医单方或复方化合物数据库中的化合物分子杂交,产生大量的新化合物分子,用以模拟中医方剂在炮制过程中可能产生的新化合物,然后将分子杂交操作产生的新化合物和中医单方或复方化合物数据库中的化合物合并,来构建中医单方或复方分子杂交数据库;(3)构建中医单方或复方分子切割和重组数据库:使用各种免费或商用软件,按照逆合成分析方法和理论,以中医单方或复方分子杂交数据库里面的所有化合物为模板,将分子杂交数据库里面的所有化合物分别切割成许许多多的合成子,再将这些合成子按照有机合成方法和原理重新进行相互组装,即可获得数量庞大的新化合物,用以模拟中药在体内发生物理、化学或生物转化而产生的新化合物,将这些化合物和中医单方或复方分子杂交数据库中的化合物合并,删除掉重复的化合物,构建中医单方或复方分子切割和重组数据库,该数据库里面的化合物群具有类聚性、多样性、新颖性和导向性等特点;(4)构建海量化合物数据库:重复上述(1)、(2)、(3)三步,按照一个方剂组成一个化合物数据库,然后将每一个化合物数据库里面的化合物分别导出为SDF格式文件,或SMI格式文件,或MDB格式文件等任何可被数据库软件读写的格式文件,全部写入到一个数据库中,构建海量化合物数据库,为了方便检索和查找,该数据库按照年代时间顺序分为战国、秦汉、三晋、南北、隋唐、五代、宋朝、辽金、元朝、明朝、清朝、民国和当代共十三个大类,每一个大类中又按照方剂的来源分成小类,每一个小类中又按照方剂名称的笔画顺序或拼音顺序或方剂编码顺序排列;(5)计算机虚拟筛选:使用各种免费或商用软件,对(1)、(2)、(3)、(4)中构建的化合物数据库依次进行ADMET筛选、类药5规则筛选、分子对接(Dock)筛选,分子对接靶标依据该方剂或中药在临床中治疗疾病的类型并结合疾病的中西医病理来选择,确保有的放矢;(6)体外活性筛选:计算机虚拟筛选获得的先导化合物,如果商业可以获得,采用购买方式获得,如果商业不可获得,采用人工合成或半合成方式获得,体外筛选靶标是结合虚拟筛选的靶标以及该方剂或中药在临床中治疗疾病的类型和病理有目标地进行选择,筛选靶标可以是细胞、酶、蛋白质或核酸等生物大分子;(7)体内活性评价:体外筛选获得的高活性化合物将经历毒性和体内活性评价,体内活性评价以市售的药物作为阳性对照,获得毒性低、活性高的候选药物作为新药进入新药临床前研究。
2.根据权利要求1所述的一种新药创制方法,其特征在于,步骤(1)构建中医单方或复方化合物数据库时,使用的医方可以是单方,亦可是复方;单方或复方的来源可以是经方、古方、秘方、偏方、验方、效方、或民间方,亦可是根据上述方剂通过药味的加减而产生的加减方。
3.根据权利要求1所述的一种新药创制方法,其特征在于,步骤(2)构建中医单方或复方分子杂交数据库,是以中医单方或复方里面的化合物分子为模板,使用可获得的免费或商用软件,利用遗传算法中的“交叉重组”的思想,采用分子杂交技术,通过对中医单方或复方化合物数据库中的化合物分子之间的化学键进行比较和互换来实现的。
4.根据权利要求1所述的一种新药创制方法,其特征在于,步骤(3)构建中医单方或复方分子切割和重组数据库,是以步骤(1)、(2)中的数据库里面的化合物为基础,使用可获得的免费或商用软件,采用逆合成分析法,按照逆合成方法和原理,把步骤(1)或步骤(2)中数据库里面的化合物切割成许许多多的合成子,然后再将这些合成子按照有机合成方法和原理重新进行相互组装来实现的。
5.根据权利要求1所述的一种新药创制方法,其特征在于,步骤(3)构建中医单方或复方分子切割和重组数据库,该数据库里面的化合物群具有类聚性、多样性、新颖性和导向性等特点。
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