[发明专利]虚拟细胞染色

说明书

相关申请

本申请要求2010年12月7日提交的美国临时申请系列号61/420,708、2011年3月8日提交的美国临时申请系列号61/450,519和2011年9月30日提交的美国临时申请系列号61/541,375在35U.S.C.§119(e)下的权益。上述申请的公开内容通过引用并入本文，如同完整地阐述。

技术领域

本公开内容一般地涉及生物学材料的成像，更具体地涉及用于细胞和有关结构的虚拟染色的系统、方法、软件和计算机可用介质。

背景技术

在成像实验中，使用染料或染色剂来标记生物细胞的不同细胞器或结构。例如，将细胞的这些结构染色，以分析或研究细胞。经常同时将细胞的2个或更多个结构染色。这被称作多路染色。串扰是从多路染色发射的颜色的重叠或混合。如果在从多路染色发射的颜色中存在过多的串扰，那么不可能区分各个结构。所以，也就不可能鉴别或分析细胞的特定结构用于实验。

传统地，在包括多路染色的成像实验中，通过试验和误差已经很大程度上实现了串扰防止。通常，购买试剂，执行方案，将细胞染色，并使用适合的显微镜来确定串扰是否明显。然后反复地执行这些步骤，直到发现不会产生串扰的染色剂组合。这样的方案经常需要购买和使用超过必要的试剂，且也可以显著增加执行成像实验所需的总时间。

发明内容

提供了用于建立虚拟细胞染色的系统和方法。具体地，提供了用于使在多路染色应用中使用的试剂之间的颜色串扰最小化的技术。

在一个方面，提供了用于显示生物细胞的一种或多种细胞结构的系统。所述系统包括存储器、输入装置、显示器和处理器。所述存储器被构造成存储生物细胞的多个细胞结构以及每个细胞结构的一种或多种染色颜色。所述处理器与所述存储器、所述输入装置和所述显示器通信。所述处理器进一步被构造成：从输入装置接收选定的细胞结构，从所述存储器检索所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色，将所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色显示在所述显示器上，从输入装置接收选定的染色颜色，并将具有选定的染色颜色的选定的细胞结构显示在所述显示器上的示例性细胞图像中，所述示例性细胞图像代表具有选定的染色颜色的选定的细胞结构的染色。

在一个方面，提供了一种用于显示生物细胞的细胞结构的方法。使用存储器存储生物细胞的多个细胞结构和每个细胞结构的一种或多种染色颜色。使用处理器，从输入装置接收选定的细胞结构。使用处理器，从所述存储器检索选定的细胞结构的一种或多种染色颜色。使用处理器，将所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色显示在显示器上。使用处理器，从输入装置接收选定的染色颜色。使用处理器，将所述选定的细胞结构以所述选定的染色颜色显示在显示器上的示例性细胞图像中，所述示例性细胞图像代表具有选定的染色颜色的选定的细胞结构的染色。

在一个方面，提供了一种计算机程序产品，其包括非暂时的和实体的计算机可读的存储介质，所述存储介质的内容包括具有指令的程序，所述指令在处理器上执行，从而实现用于显示生物细胞的细胞结构的方法。提供了一种系统，其中所述系统包括一个或多个不同的软件模块，且其中所述不同的软件模块包括存储模块和染色模块。使用存储模块，在存储器中存储生物细胞的多个细胞结构和每个细胞结构的一种或多种染色颜色。使用染色模块，从输入装置接收选定的细胞结构。使用存储模块，从存储器检索选定的细胞结构的一种或多种染色颜色。使用染色模块，在显示器上显示选定的细胞结构的一种或多种染色颜色。使用染色模块，从输入装置接收选定的染色颜色。使用染色模块，将选定的细胞结构以选定的染色颜色显示在显示器上的示例性细胞图像中，所述示例性细胞图像代表具有选定的染色颜色的选定的细胞结构的染色。

在一个方面，提供了用于显示生物细胞的一种或多种细胞结构的系统。所述系统包括存储器和处理器。所述存储器被构造成存储生物细胞的多个细胞结构和每个细胞结构的一种或多种染色颜色。所述处理器与所述存储器和客户端装置通信。所述处理器进一步被构造成：从所述客户端装置接收选定的细胞结构，从所述存储器检索所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色，将所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色传送并显示在所述客户端装置上，从输入装置接收选定的染色颜色，和将具有选定的染色颜色的选定的细胞结构传送并显示在所述客户端装置上的示例性细胞图像中，所述示例性细胞图像代表具有选定的染色颜色的选定的细胞结构的染色。