[发明专利]一种快速提取悬钩子属植物总RNA的方法在审
申请号: | 201110341215.6 | 申请日: | 2011-11-01 |
公开(公告)号: | CN102329792A | 公开(公告)日: | 2012-01-25 |
发明(设计)人: | 汤浩茹;陈清;刘泽静;王小蓉;余昊唯;贾慧峰 | 申请(专利权)人: | 四川农业大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 625014 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 提取 钩子 植物 rna 方法 | ||
1.一种快速提取悬钩子属植物总RNA的方法,其特征在于以下操作:
(1)取2ml离心管,向离心管中加入700~1000μl去糖缓冲液,并加入5~15μl β-巯基乙醇,于-20℃预冷5~10min;
(2)取新鲜植物材料或经液氮速冻后-80℃保存的植物材料0.1~0.15g,加入0.1g交联聚乙烯基吡咯烷酮,在液氮冷冻条件下研磨成粉状,迅速转移至步骤(1)的离心管中,温柔上下颠倒混匀后于冰上静置10min;
(3)在4℃下按照3200×g离心5~10min;
(4)彻底去除步骤(3)离心所得上清液,向沉淀中加入700~1000μl 65℃预热的细胞裂解液,涡旋1min,于55~65℃保温20~30min;
(5)待步骤(4)中的混合液冷却至室温后,按顺序加入细胞裂解液等体积的水饱和酚,1/80-1/50裂解液体积的pH调节剂,1/5裂解缓冲液体积的氯仿,剧烈震荡2min;
(6)在4℃下按照16000×g离心5~10min;
(7)将步骤(6)离心所得上清液转入另一离心管,向管中加入上适量核酸沉淀剂,于-20℃静置30min以上,在4℃下按照16000×g离心10min后弃上清液,保留沉淀;
(8)将步骤(7)离心所得沉淀用体积分数为70~75%乙醇洗涤后室温风干,用DEPC处理水溶解后-80℃保存;
2.根据权利要求1所述步骤(1)、(2)、(3)、(4)可以替代为:
(1)取2ml离心管,向离心管中加入700~1000μl细胞裂解液,并加入5~15μl β-巯基乙醇,于55~65℃预热5~10min;
(2)取新鲜植物材料或液氮速冻后-80℃保存的植物材料0.1~0.15g,加入0.1g交联聚乙烯基吡咯烷酮,在液氮冷冻条件下研磨成粉状,迅速转移至步骤(1)的离心管中,涡旋1min,于55~65℃保温20~30min;
3.根据权利要求1所述总RNA提取方法,其特征在于所述去糖缓冲液为:0.05M氯化钠、50mM pH 8.0的乙二胺四乙酸二钠、200mM pH 8.0的三羟甲基氨基甲烷;
4.根据权利要求1或2所述总RNA提取方法,其主要特征在于使用碱性细胞裂解液裂解细胞,所述细胞裂解液为:30g/L十六烷基三甲基溴化铵、1.4M氯化钠、50~100mM pH 8.0的乙二胺四乙酸二钠、100~200mM pH 8.0的三羟甲基氨基甲烷以及20g/L聚乙烯吡咯烷酮K30;
5.根据权利要求1或2所述总RNA提取方法,其特征在于在细胞彻底裂解后,再使用pH调节剂调节混合液pH,使用的pH调节剂包括但不限于弱酸如冰醋酸、草酸;
6.根据权利要求1或2所述总RNA提取方法,其特征在于使用的核酸沉淀剂包括但不限于无水乙醇、异丙醇;
7.根据权利要求1或2所述总RNA提取方法,核酸沉淀时,使用的无水乙醇体积为上清体积的2~2.5倍;使用异丙醇体积为上清体积的0.8~1倍;
8.根据权利要求1或2所述总RNA提取方法,其适用于悬钩子属下的树莓、黑莓以及其他种或变种;
9.根据权利要求1或2所述总RNA提取方法中植物材料包括但不限于果实、叶片及花。
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