[发明专利]一种获取古代动物遗传信息的方法无效
申请号: | 201010238807.0 | 申请日: | 2010-07-26 |
公开(公告)号: | CN101921743A | 公开(公告)日: | 2010-12-22 |
发明(设计)人: | 赵兴波;方迟 | 申请(专利权)人: | 中国农业大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅;任凤华 |
地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 获取 古代 动物 遗传信息 方法 | ||
1.一种古代动物DNA的提取方法,包括以下步骤:
1)将古代动物样品置于裂解缓冲液中裂解,收集裂解液;
2)向上述步骤1)中得到的裂解液中加入与所述裂解液等体积的助沉缓冲液进行处理,离心得到上清液;所述助沉缓冲液的溶剂是水,溶质是醋酸钾和氯化锂,所述助沉缓冲液中醋酸钾的浓度为1.40-1.45mol/L,氯化锂的浓度为4.25-4.30mol/L;
3)往上述步骤2)中得到的上清液加入异丙醇,离心,得到古代动物DNA沉淀;所述异丙醇的体积是所述上清液体积的0.6-1倍。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:步骤1)中,所述裂解缓冲液是以水为溶剂,以Tris·Cl、NaCl、EDTA和SDS为溶质配制而成,所述Tris·Cl、NaCl、EDTA和SDS的终浓度为如下:Tris·Cl 100mmol/L,NaCl 100mmol/L,EDTA 100mmol/L,SDS 0.5%(质量百分比)。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:步骤1)中,所述古代动物样品为古代动物的骨骼或牙齿;所述古代动物样品在置于裂解缓冲液中裂解之前经过粉碎步骤,所述粉碎步骤得到的粉末与所述裂解缓冲液的体积比是1∶2。
4.根据权利要求1-3中任一所述的方法,其特征在于:步骤1)中,所述裂解液是将所述裂解后的溶液经过离心得到的上清液,所述离心的转速为12000g,离心时间为5分钟。
5.根据权利要求1-4中任一所述的方法,其特征在于:步骤2)中,所述助沉缓冲液中醋酸钾的浓度为1.43mol/L,氯化锂的浓度为4.29mol/L。
6.根据权利要求1-5中任一所述的方法,其特征在于:步骤2)中,所述处理的步骤是在冰上进行的,所述冰上进行的时间为25-35分钟,优选为30分钟;所述离心条件为12000g,15分钟。
7.根据权利要求1-6中任一所述的方法,其特征在于:步骤3)中,所述离心条件为12000g,30分钟;所述离心步骤之前还包括一静置步骤,所述静置的时间为100-150分钟,优选为120分钟,静置的温度条件为-20℃。
8.根据权利要求1-7中任一所述的方法,其特征在于:步骤3)中,所述异丙醇是经-20℃预冷的;所述异丙醇的体积是所述上清液体积的1倍。
9.根据权利要求1-8中任一所述的方法,其特征在于:所述方法还包括步骤3)之后的洗涤步骤;所述洗涤是往上述步骤3)得到的DNA沉淀中加入浓度为70g/100ml的乙醇水溶液,轻弹管壁后离心去上清;所述洗涤次数为1次或2次;所述离心条件为12000g,1分钟。
10.一种获取古代动物遗传信息的方法,是往权利要求1-9中任一所述的方法得到的DNA沉淀中加入水得到DNA提取液,将所述DNA提取液进行PCR扩增测序,得到古代动物遗传信息。
11.根据权利要求10所述的方法,其特征在于:所述PCR扩增测序包括如下步骤:
a)将提取所得的DNA提取液作为模板,进行PCR扩增,测序;
b)将提取所得的DNA提取液作为模板,在常规PCR扩增反应之前加入一个去除受损伤模板的步骤,再进行去除受损伤模板后的PCR扩增,然后测序;
c)将步骤a)和b)的两个结果进行比对分析,得到古代动物遗传信息。
12.根据权利要求11所述的方法,其特征在于:步骤b)中,所述去除受损伤模板的步骤是往所述PCR扩增反应体系中加入尿嘧啶糖苷酶进行处理;所述尿嘧啶糖苷酶的用量是每25μlPCR扩增反应体系中加入1U的尿嘧啶糖苷酶;所述处理的温度是37℃,处理的时间5min。
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