[发明专利]基于PCA降维技术的二硫键连接模式检测方法无效
| 申请号： | 200910045406.0 | 申请日： | 2009-01-15 |
| 公开（公告）号： | CN101477113A | 公开（公告）日： | 2009-07-08 |
| 发明（设计）人： | 杨杰;裔东亮 | 申请（专利权）人： | 上海交通大学 |
| 主分类号： | G01N33/48 | 分类号： | G01N33/48;G06K9/62 |
| 代理公司： | 上海交达专利事务所 | 代理人： | 王锡麟;王桂忠 |
| 地址： | 200240*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 基于 pca 技术 二硫键 连接 模式 检测 方法 | ||
【权利要求书】：
1、一种基于PCA降维技术的二硫键连接模式检测方法，其特征在于，包括如下步骤：
首先，在蛋白质数据库上提取多重序列特征向量以及PSIPRED检测出的二级结构特征向量，一共是623维向量；
其次，使用主分量分析法降维技术将623为特征向量降低到300维；
最后，将300维向量输入到SVR分类器中进行检测，得到检测结果。
2、根据权利要求1所述的基于PCA降维技术的二硫键连接模式检测方法，其特征是，所述623维向量包括：半胱氨酸偶联、20种氨基酸组成成份、半胱氨酸分离距离、半胱氨酸排序、蛋白质分子量、蛋白质序列长度和PSIPRED检测出的二级结构特征向量。
3、根据权利要求1所述的基于PCA降维技术的二硫键连接模式检测方法，其特征是，所述使用主分量分析法降维技术将623为特征向量降低到300维，具体为：
其中X维623维向量，而Y则是300维向量，其中A为变换矩阵，p为输入的向量维度，m为转换后的向量维度。
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