[发明专利]一种猪脂肪沉积相关蛋白及其编码基因与应用

说明书

技术领域

本发明涉及一种猪脂肪沉积相关蛋白及其编码基因与应用，特别涉及一种猪脂肪沉积相关蛋白及其编码基因以及利用该蛋白编码基因的单核苷酸多态性来检测猪脂肪沉积性能的方法。

背景技术

现代育种技术使猪的生产性能得到显著提高，然而随着人们生活水平的不断提高，猪肉消费已从以往的脂肪型转变为现在的瘦肉型。与之相适应的，规模化商品猪的生产也发生了从数量型到质量型的改变。在当今的猪肉市场，热胴体重和瘦肉产量决定猪胴体的商业价值。世界养猪发达国家的分级标准也是根据胴体瘦肉率(lean percentage in the carcass，CLP)的不同将猪胴体划分为不同的等级。因此提高瘦肉率减少脂肪含量一直是商品猪生产者、肉品经营者、育种学家们孜孜不倦的追求目标。

在实际工作中，人们试图寻找一种简便的活体评定胴体品质的方法，以减少屠宰带来的经济损失，因此大量研究致力于寻找胴体组成的最佳预测指标。活体性状与胴体瘦肉率的遗传相关分析结果表明，背膘厚与胴体瘦肉率存在极强的负相关(r_A＝-0.5～-0.7)，且活体背膘厚有较高的遗传力(h²＝0.4～0.6)(彭中镇等：《猪的遗传改良》，北京，农业出版社，1991)。而目前DNA分子标记技术的发展和应用，为胴体瘦肉率的直接选择以及胴体品质的快速评定开辟了新途径。

目前已研究的与猪的脂肪沉积或是与背膘厚相关的基因有：(1)Yu等(Yu T P，Tuggle C K，Schmitz C B，Rothschild M F.Association of PIT1 polymorphismswith growth and carcass traits in pigs.J Anim Sci，1995，73：1282-1288.)在一个含中国与美国猪品种“血液”的资源家系中检测到垂体转录因子(Pituitantranscription factor 1，PIT1)与平均背膘厚存在显著相关。(2)激素敏感脂酶(Hormone Lipase，HSL)，作为脂肪降解的限速酶，在脂肪动员过程中负责甘油三脂向甘油二脂的转换。随着它的活性增高，甘油三脂的分解速度增快，脂肪的沉积减少，从而降低胴体的脂肪含量。因此可把它作为标记基因对脂肪含量进行选择。现在已将HSL基因定位在猪6号染色体上6p1.1-1.2上。(3)Jeon等(Jeon J T，Carlborg O，Tornsten A，Giuffra E，Amarger V，Chardon P，Andersson-EklundL，Andersson K，HanssonI，Lundstrom K，Andersson L.A paternally expressedQTL affecting skeletal and muscle mass in pigs maps to the IGF2 locus.NatureGenetics，1992，21：157-158.)用建立的两个家系将类胰岛素生长因子2(Insulinlike growth factor II，IGF-II)定位于猪2号染色体上，并检测到该基因与背膘厚有显著相关。(4)黑素皮质激素受体4(Melanocortin-4 receptor，MC4R)，Kim及其同事将该基因定位于猪1号染色体上(Kim K S，Larsen N J，Rothschild M F.Linkage and physical mapping of the porcine melanocortin-4 receptor(MC4R)gene.J Anim Sci，2000a，78：791-792.)，并在5个猪商品系中检测到MC4R基因遗传变异与背膘厚显著相关(Kim K S，Larsen N，Short T，Plastow G，RothschildM F.A missense variant of the porcine melanocortin-4 receptor(MC4R)geneis association with fatness，growth，and feed intake traits.Mamm Genome，2000b，11：13-135.)。(5)正在研究的与猪生长和胴体性状相关的候选基因还包括：与生长、胴体性状可能有关的瘦素基因(Leptin，LEP)即肥胖基因和生肌因子3(myf3)，与背膘厚有显著相关的组织蛋白酶B(Cathepsin B，CTSB)基因等(RussoV，Fontanesi L，Davoli R，Nanni C L，Cagnazzo M，Buttazzoni L，Virgili R，Yerle M.Investigation of candidate genes for meat quality in dry-curedham production：the porcine cathepsin B(CTSB)and cystatin B(CSTB)genes.Anim Genet，2002，33：123-131.)。(6)Dirk J.de Koning及其同事通过分布于猪18条常染色体及X染色体的共计127个微卫星标记进行全基因组扫描时发现，猪1、2、6、7号染色体上存在影响背膘厚等胴体性状的QTL(Dirk J.de Koning，Luc L.G.Janss，Annemieke P.Rattink，Pieter A.M.van Oers et al.，1999，Detection of quantitative trait loci for backfat thinkness and intramuscularfat content in pigs(sus scrofa).Genetics，152：1679-1690)。另外Andersson等人的研究表明，在4号染色体上也存在影响脂肪沉积的QTL(Andersson L.，C.S.Haley，H.Ellegren，S.A.Knott，M.Johansson et al.，1994，Genetic mappingof quantitative trait loci for growth and fatness in pigs.Science 263：1771-1774)。