[发明专利]一种快速提取植物根际土中AM真菌环境DNA的方法无效
申请号: | 200710066211.5 | 申请日: | 2007-09-19 |
公开(公告)号: | CN101148677A | 公开(公告)日: | 2008-03-26 |
发明(设计)人: | 李涛;赵之伟 | 申请(专利权)人: | 云南大学 |
主分类号: | C12N15/31 | 分类号: | C12N15/31;C12N15/10 |
代理公司: | 昆明正原专利代理有限责任公司 | 代理人: | 杨宏珍 |
地址: | 650091云*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 提取 植物 根际土中 am 真菌 环境 dna 方法 | ||
1.一种快速提取植物根际土中AM真菌环境DNA的方法,包括根际土中AM真菌相关结构的收集、真菌基因组DNA的提取、用AM真菌特异性引物进行nestedPCR扩增、及扩增片段测序及测序结果分析步骤,其特征在于本方法中所用根际土AM真菌DNA由下列方法得到:
a.称取100g根际土壤样品,经湿筛倾析法收集AMF厚垣孢子及根外菌丝结构,并将其置于无菌的研钵中,用液氮冷却材料,待水份蒸发后,加入少量石英砂,充分研磨材料使之呈粉末状,然后迅速将粉末状的材料转入2ml的离心管中;
b.在装有材料的离心管中加入65℃水浴预热的2×CTAB提取液1ml,使材料完全分散在提取液中,在65℃水浴锅中温浴1小时,期间每20分钟摇匀1次;
c.将温浴的材料取出置于室温下,待冷却至室温后加入300μl等体积的苯酚-氯仿颠倒混匀,然后6500转/分钟离心20min;
d.取上清液10μl转移到另一0.5ml的离心管中,再加入300μl 20%Chelex-100树脂混匀,置于99.9℃的PCR仪上煮沸15min;
e.待样品冷却至室温,瞬时离心30s,取上清液稀释20-100倍置于-20℃冰箱中保存备用或直接作为DNA模板进行PCR扩增。
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