[发明专利]乳腺肿瘤的激光显微解剖和微阵列分析揭示雌激素受体相关的基因和途径

权利要求书

1. 一种确定雌激素受体表达状态的方法，所述方法包括以下步骤：

a.从乳腺癌患者得到大块肿瘤组织样品；和

b.测量样品中基因的表达水平，所述基因选自编码以下mRNA的基因：

i.对应于表2或表3中所列的各SEQ ID No；或

ii.被探针组识别，所述探针组选自与表2或表3中所列的各SEQ ID No对应的psids，

其中高于或者低于预定截断水平的基因表达水平指示雌激素受体的表达状态。

2. 一种确定雌激素受体表达状态的方法，所述方法包括以下步骤：

a.从乳腺癌患者得到显微分离的肿瘤样品；和

b.测量样品中基因的表达水平，所述基因选自编码以下mRNA的基因：

i.对应于表2或表4中所列的各SEQ ID No；或

ii.被探针组识别，所述探针组选自与表2或表4中所列的各SEQ ID No对应的psids，

其中高于或者低于预定截断水平的基因表达水平指示雌激素受体的表达状态。

3. 一种确定乳腺癌患者治疗方案的方法，所述方法包括以下步骤：

a.从乳腺癌患者得到大块肿瘤组织样品；和

b.测量样品中基因的表达水平，所述基因选自编码以下mRNA的基因：

i.对应于表2或表3中所列的各SEQ ID No；或

ii.被探针组识别，所述探针组选自与表2或表3中所列的各SEQ IDNo对应的psids，

其中高于或者低于预定截断水平的基因表达水平足以指示复发的风险，使得医生能够确定推荐用于预防复发的疗法的程度和类型。

4. 一种确定乳腺癌患者治疗方案的方法，所述方法包括以下步骤

a.从乳腺癌患者得到显微分离的肿瘤样品；和

b.测量样品中基因的表达水平，所述基因选自编码以下mRNA的基因：

i.对应于表2或表4中所列的各SEQ ID No；或

ii.被探针组识别，所述探针组选自与表2或表4中所列的各SEQ ID No对应的psids，

其中高于或者低于预定截断水平的基因表达水平足以指示复发的风险，使得医生能够确定推荐用于预防复发的疗法的程度和类型。

5. 一种治疗乳腺癌患者的方法，所述方法包括以下步骤：

a.从乳腺癌患者得到大块肿瘤组织样品；和

b.测量样品中基因的表达水平，所述基因选自编码以下mRNA的基因：

i.对应于表2或表3中所列的各SEQ ID No；或

ii被探针组识别，所述探针组选自与表2或表3中所列的各SEQ ID No对应的psids，

c.如果患者是高风险患者，则用辅助疗法治疗所述患者。

6. 一种治疗乳腺癌患者的方法，所述方法包括以下步骤：

a.从乳腺癌患者得到显微分离的肿瘤样品；和

b.测量样品中基因的表达水平，所述基因选自编码以下mRNA的基因：

i.对应于表2或表4中所列的各SEQ ID No；或

ii.被探针组识别，所述探针组选自与表2或表4中所列的各SEQ ID No对应的psids，

c.如果患者是高风险患者，则用辅助疗法治疗所述患者。

7. 权利要求1-6中任一项的方法，其中从原发性肿瘤得到样品。

8. 权利要求1、3或5中任一项的方法，其中从活组织检查或者手术样品得到大块组织制备物。

9. 权利要求2、4或6中任一项的方法，其中显微分离采用激光捕获显微解剖进行。

10. 权利要求1-6中任一项的方法，所述方法还包括测量样品中至少一种组成性表达的基因的表达水平。

11. 权利要求1-6中任一项的方法，其中特异性为至少约40％。

12. 权利要求1-6中任一项的方法，其中灵敏度为至少约90％。

13. 权利要求1-6中任一项的方法，其中将基因的表达模式与指示复发患者的表达模式比较。

14. 权利要求13的方法，其中用模式识别方法进行表达模式的比较。