本发明公开了籼稻OsRNR10基因的应用。籼稻OsRNR10基因在增强水稻的根系发育和提高氮肥利用效率与产量中的应用,所述的籼稻OsRNR10基因序列如SEQ ID NO.1及SEQ ID NO.2所示。我们利用华粳籼74背景下的82份携带IRAT261单片段置换系进行QTL分析,并进一步精细定位到一个氮响应的根系发育调节因子OsRNR1O。籼稻单倍型OsRNR10导致其表达水平降低,能使籼稻拥有更优良的根系结构和更高的硝态氮吸收速率。通过将籼稻中OsRNR10的优异等位变异引入到粳稻中,能够增强粳稻的根系发育和提高粳稻的氮肥利用效率与产量。