本发明提供一种腺相关病毒衣壳蛋白保守区多克隆抗体的制备方法及应用,通过DNAMAN软件分析,将AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10衣壳蛋白氨基酸序列中连续7个及以上氨基酸同源的序列依次拼接,获得的序列即为AAV衣壳蛋白保守区序列,与保守区氨基酸序列对应可确定编码衣壳蛋白保守区的DNA序列,根据宿主菌的特性,对获得的DNA序列进行密码子优化,将优化后的DNA序列合成并构建到pET‑30a原核表达载体,得到pET‑30a‑AAV‑RC保守区蛋白质粒,DNA序列如SEQ ID NO.1,氨基酸序列如SEQ ID NO.2。成功制备了抗AAV衣壳保守区蛋白的多克隆抗体,识别所有血清型AAV,特异性识别和结合人真核细胞中转染表达的AAV衣壳蛋白。