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[发明专利]菌株基因组注释查询方法、装置、电子设备及存储介质-CN202010813204.2在审
发明人：孙清岚;史文聿;范国梅;吴林寰;马俊才 -专利权人：中国科学院微生物研究所
申请日： 2020-08-13 - 公布日： 2020-12-04 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本公开提供了菌株基因组注释查询方法、装置、电子设备及存储介质。该方法的一具体实施方式包括：接收终端设备发送的菌株基因组注释查询请求，其中，菌株基因组注释查询请求包括待查询菌株测序项目标识，在菌株基因组注释数据库中查询菌株测序项目标识与待查询菌株测序项目标识匹配的菌株基因组测序信息，其中，菌株基因组测序信息包括菌株编号、菌株测序项目标识以及基因组注释，菌株基因组注释数据库存储至少一个菌株基因组测序信息，将查询到的菌株基因组测序信息中的基因组注释发送至终端设备。该实施方式实现了菌株基因组注释的准确查询。
菌株基因组注释查询方法装置电子设备存储介质

[发明专利]一种积累大黄素-8-甲醚的工程菌株及其构建方法和应用-CN201911267463.3在审
发明人：吕雪峰;齐飞飞;黄雪年;薛莹莹;张伟 -专利权人：中国科学院青岛生物能源与过程研究所
申请日： 2019-12-11 - 公布日： 2020-04-07 - 主分类号： C12N1/15 文献下载
摘要：本发明公开了一种能够积累大黄素‑8‑甲醚的基因工程菌株，所述基因工程菌株的出发菌株为能够产生大黄素‑8‑甲醚或其下游衍生物的土曲霉，所述基因工程菌株为将土曲霉中的gedK基因进行突变而制备得到的基因工程菌株，相对于出发菌株和gedD基因突变菌株，所述基因工程菌株能够用于积累大黄素‑8‑甲醚。
一种积累黄素甲醚工程菌株及其构建方法应用

[发明专利]一种积累大黄素的基因工程菌株及其构建方法和应用-CN201910650149.7有效
发明人：吕雪峰;黄雪年;齐飞飞;张伟 -专利权人：中国科学院青岛生物能源与过程研究所
申请日： 2019-07-18 - 公布日： 2021-07-23 - 主分类号： C12N1/15 文献下载
摘要：本发明公开了一种能够积累大黄素的基因工程菌株，所述基因工程菌株的出发菌株为能够产生大黄素或其下游衍生物的土曲霉，所述基因工程菌株为将土曲霉中的O‑甲基转移酶基因(gedA)进行突变而制备得到的基因工程菌株，相对于出发菌株，所述基因工程菌株能够用于积累大黄素。
一种积累黄素基因工程菌株及其构建方法应用

[发明专利]酿酒酵母基因缺失菌株在清除环境中重金属镍方面的应用-CN201610192250.9在审
发明人：蒋伶活 -专利权人：江南大学
申请日： 2016-03-30 - 公布日： 2016-07-06 - 主分类号： C12N1/18 文献下载
摘要：本发明涉及酿酒酵母基因缺失菌株在清除环境中重金属镍方面的应用。所述酿酒酵母基因缺失菌株为酿酒酵母基因缺失菌株vps38、酿酒酵母基因缺失菌株vps25和酿酒酵母基因缺失菌株vps30。本发明提供的三株酿酒酵母基因缺失菌株可作为清除环境中重金属镍污染的原始菌株，还可对其进行进一步的基因改造，开发新型具有更高性能的菌株，以有效对重金属镍污染的环境进行治理。
酿酒酵母基因缺失菌株清除环境重金属方面应用

[发明专利]一种产大黄素的基因工程菌株及其构建方法与应用-CN201910649852.6有效
发明人：吕雪峰;黄雪年;张伟;齐飞飞 -专利权人：中国科学院青岛生物能源与过程研究所
申请日： 2019-07-18 - 公布日： 2021-03-02 - 主分类号： C12N1/15 文献下载
摘要：本发明公开了一种产大黄素和其下游衍生物的基因工程菌株，所述基因工程菌株的出发菌株为土曲霉，所述基因工程菌株为将土曲霉中的转录调控因子ATEG_08453进行过表达而制备得到的基因工程菌株。相对于出发菌株，所述基因工程菌株能够用于合成大黄素。
一种黄素基因工程菌株及其构建方法应用

[发明专利]提高菌株抗逆性的方法及基因在提高菌株抗逆性中的应用-CN202210567854.2在审
发明人：李春;秦磊;刘夏 -专利权人：清华大学
申请日： 2022-05-24 - 公布日： 2022-08-12 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明提供一种提高菌株抗逆性的方法以及通过该方法筛选得到的基因在提高菌株抗逆性中的应用。本发明第一方面提供一种提高菌株抗逆性的方法，包括如下步骤：将具备抗逆性的菌株和不具备抗逆性的菌株在胁迫条件下培养，培养结束后进行转录组测序，分析得到显著上调基因；将所述显著上调基因转入目标菌株，得到能够表达所述显著上调基因的目标菌株本发明通过分析抗逆菌株的转录组数据，挖掘相关的抗逆基因，并通过基因工程手段将抗逆基因转入菌株中，有助于提高菌株的抗胁迫能力，实现菌株在胁迫条件下的快速生长与代谢，并且所获得的菌株遗传性能稳定，适合发酵产业工业化应用
提高菌株抗逆性方法基因中的应用

[发明专利]一种基于LAC4基因实现基因编辑筛选的方法-CN201811433336.1有效
发明人：郭敏;姜灵轩;李海洋;占魁;娄旭;邓蜜妮;范万巧;杨旭;许乃庆;于雪 -专利权人：康码（上海）生物科技有限公司;康码（上海）海洋科技有限公司
申请日： 2018-11-28 - 公布日： 2023-03-28 - 主分类号： C12N15/90 文献下载
摘要：本发明公开一种基于LAC4基因实现基因编辑筛选的方法，该方法为：步骤1，基因改造：通过基因改造使出发菌株染色体上LAC4基因无法表达正常功能的LAC4蛋白，得到LAC4基因缺陷的菌株，该LAC4基因缺陷的菌株在以乳糖为唯一碳源的培养基上无法正常生长；步骤2，基因恢复：将目标基因与正常的LAC4基因连接构成供体片段，将此供体片段转入前述LAC4基因缺陷的菌株，使LAC4基因恢复正常的表达功能；步骤3，基因恢复后的菌株在以乳糖为唯一碳源的培养基上进行培养，能够正常生长的菌株为LAC4基因恢复的菌株，也是目标基因正常插入的菌株。相比无筛选功能的CRISPR/Cas9系统，本系统通过筛选可剔除绝大部分基因编辑阴性的菌株，大大提高筛选阳性率，可基本无需PCR筛选，节省时间和成本。
一种基于 lac4 基因实现编辑筛选方法

[发明专利]里氏木霉QM6A及其衍生株中与交配损伤相关的基因/遗传元件及其鉴定方法-CN201380068881.4在审
发明人： C·P·库比切克;R·林克;B·赛博斯;T·哈曼;P·劳伦茨 -专利权人： AB酶有限公司
申请日： 2013-12-23 - 公布日： 2016-09-28 - 主分类号： C12N15/80 文献下载
摘要：本发明涉及鉴定里氏木霉QM6a菌株或其衍生菌株中与交配损伤相关的基因/遗传元件的方法，所述方法包括：a)提供第一菌株，所述菌株是具有MAT1‑2基因座的里氏木霉QM6a菌株或其衍生菌株；b)使所述菌株与第二菌株进行有性杂交，所述第二菌株是具有补充的基因座(即MAT1‑1基因座)的里氏木霉(红褐肉座菌)菌株的能交配菌株；c)使来自b)中的杂交或其回交中的MAT1‑1子代与a)中的第一菌株进行反复回交，直到获得与所述第一里氏木霉)杂交的子代；以及e)通过将步骤d)中所选的子代的基因组和a)中第一菌株的基因组序列进行比较，来鉴定与交配损伤相关的基因/遗传元件，其中在第一菌株中所述基因/遗传元件完全或部分缺失，或者以突变形式或具有缺失和/或插入的形式存在，因此是里氏木霉QM6a菌株或其衍生菌株中与交配损伤直接或间接相关的基因或遗传元件；本发明还涉及修正里氏木霉QM6a菌株或其衍生菌株的交配损伤的方法，所述菌株具有MAT1‑1基因座并且不能与具有MAT1‑2基因座的里氏木霉QM6a菌株或其衍生菌株交配，其中如上鉴定的一个或多个突变的或者完全或部分缺失的基因和/或遗传元件是被相应的功能性基因和/或遗传元件替代或补充。
里氏 qm6a 及其衍生交配损伤相关基因遗传元件鉴定方法

[发明专利]提高L-精氨酸菌株生产能力的方法-CN201810569947.2在审
发明人：杨晟;蒋宇;杨俊杰;董枫;刘映淼 -专利权人：中国科学院上海生命科学研究院
申请日： 2018-06-05 - 公布日： 2019-12-13 - 主分类号： C12N1/21 文献下载
摘要：本发明公开了一种通过基因工程提高L‑精氨酸菌株生产能力的方法，包括下述步骤：敲除谷氨酸棒杆菌ATCC13032基因组中的argR基因，获得基因敲除菌株ATCC13032(ΔargR)；对基因敲除菌株的基因组中argB基因进行A26V和M31V突变，获得基因突变菌株ATCC13032(ΔargR,argBmut(A26V M31V))；对基因突变菌株的基因组中多聚磷酸盐激酶基因(NCgl2620)起始密码子上游调控区的碱基序列进行突变，获得基因工程菌株ATCC13032(ΔargR,argBmut(A26V M31V),NCgl2620mut6)。本发明的方法能够将菌株的L‑精氨酸生产能力提高至少15倍。
菌株基因组基因敲除菌株基因突变精氨酸突变生产能力谷氨酸棒杆菌基因工程菌株多聚磷酸盐起始密码子基因工程激酶基因碱基序列调控区敲除基因上游

[发明专利]一种裂殖壶菌基因工程菌株、其构建方法及其应用-CN202111578373.3有效
发明人：孙小曼;马旺;向罗平;许莹霜;汪庆卓 -专利权人：南京脂禾生物科技有限公司
申请日： 2021-12-22 - 公布日： 2023-07-25 - 主分类号： C12N1/15 文献下载
摘要：本发明公开了一种裂殖壶菌基因工程菌株及其构建方法，该裂殖壶菌基因工程菌株以Schizochytrium sp.HX‑308菌株为出发菌株，在出发菌株中多拷贝表达二十碳五烯酸合成途径中的酰基‑ACP硫脂酶基因TE；本发明也公开了上述裂殖壶菌基因工程菌株的一种应用，通过发酵生产二十碳五烯酸本发明通过过表达酰基‑ACP硫脂酶基因TE，实现了提高基因工程菌株中二十碳五烯酸产量的目的，适用于构建裂殖壶菌基因工程菌株，构建出的裂殖壶菌基因工程菌株可用于二十碳五烯酸的生物合成。
一种裂殖壶菌基因工程菌株构建方法及其应用

[发明专利]一种实验室标准菌株的质量控制评估方法及系统-CN202310595228.9在审
发明人：夏涵;官远林;魏康飞;杨军波;段美林;胡龙;刘欢;骆晨 -专利权人：予果生物科技（北京）有限公司;予果智造科技（北京）有限公司;西咸新区予果微码生物科技有限公司
申请日： 2023-05-25 - 公布日： 2023-07-28 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明属于质量控制技术领域，涉及一种实验室标准菌株的质量控制评估方法及系统。本方法从标准菌株污染评估、标准菌株基因覆盖评估、标准菌株基因组组装质量评估、标准菌株耐药基因差异评估和标准菌株基因组变异评估这5个方面对标准菌株进行打分，辅助进化关系评估验证标准菌株的可用性，并可选地辅助生化鉴定检测，从而快速准确地实现菌株质量评估，完善标准菌株管理体系。
一种实验室标准菌株质量控制评估方法系统

[发明专利]可改善菌株以提升生产重组蛋白质的方法-CN202010105052.0在审
发明人：姜中人;陈立 -专利权人：杭州立丞生物科技有限公司
申请日： 2020-02-20 - 公布日： 2021-08-20 - 主分类号： C12N1/21 文献下载
摘要：本发明提供一种可提升重组蛋白质表现的菌株，属于大肠杆菌，所述的菌株是透过将glf基因、zwf基因、pgl基因、alaA基因及alaC基因整合至缺少ptsG基因、araABD基因操纵组、araFGH基因、及ppc基因操纵组的大肠杆菌菌株中。
改善菌株提升生产重组蛋白质方法

[发明专利]一种多倍体工业啤酒酵母菌株URA3基因缺陷型的回复方法-CN201810216970.3在审
发明人：魏磊;朱秋艳;魏文天;葛永斌 -专利权人：亳州学院
申请日： 2018-03-16 - 公布日： 2018-08-10 - 主分类号： C12N15/87 文献下载
摘要：本发明提供了一种多倍体工业啤酒酵母菌株URA3基因缺陷型的回复方法，属于啤酒酵母基因工程技术领域，所述方法包括以下步骤：1)将URA3基因的高表达组件转化到URA3基因缺陷型菌株中，获得过表达URA3基因的菌株；2)驯化培养所述过表达URA3基因的菌株获得生长性能、发酵性能与原始菌株一致的原养型菌株。本发明所述方法获得的原养型菌株无外源基因残留，安全性高。利用本发明所述的方法能够快速获得生长性能与发酵性能与原始菌株一致的原养型菌株。本发明为多倍体工业啤酒酵母菌株提供了一种简单的、可实现的基因操作途径。
菌株多倍体啤酒酵母菌株发酵性能生长性能原始菌株缺陷型回复基因工程技术缺陷型菌株基因操作啤酒酵母驯化培养高表达无外源残留基因转化

[发明专利]一种积累麦角新碱的菌株及其构建方法和应用-CN202210934532.7有效
发明人：吕雪峰;陈少欣;杨勇;张璇;杜思雨;周宇;冯磊;吴磊;黄雪年 -专利权人：中国科学院青岛生物能源与过程研究所;浙江博崤生物制药有限公司;上海医药工业研究院有限公司
申请日： 2022-08-04 - 公布日： 2023-09-22 - 主分类号： C12N1/15 文献下载
摘要：本发明公开了一种能够积累麦角新碱的基因工程菌株，所述基因工程菌株的出发菌株为能够产生麦角新碱和lysergic acidα‑hydroxyethylamide(缩写为LAH)的雀稗麦角菌，所述基因工程菌株为将雀稗麦角菌中的FAD依赖的单加氧酶(g5173)进行突变而制备得到的基因工程菌株，相对于出发菌株，所述基因工程菌株只积累麦角新碱而不积累LAH。
一种积累麦角菌株及其构建方法应用

[发明专利]迟缓爱德华氏菌基因工程弱毒株及其应用-CN201310674468.4有效
发明人：黄倢;谢国驷;莫照兰;王秀华;许华;张庆利;隋虎辰;杨春志;李晨 -专利权人：中国水产科学研究院黄海水产研究所
申请日： 2013-12-11 - 公布日： 2017-07-14 - 主分类号： C12N1/20 文献下载
摘要：本发明提供野生迟缓爱德华氏菌的4株基因缺失突变株及其衍生菌株，分别为EvpC基因丧失功能的E.tardaΔEvpC菌株及其衍生菌株，包括有EsrB基因丧失功能的E.tardaΔEvpCΔEsrB菌株及其衍生菌株，PstB基因丧失功能的E.tardaΔEvpCΔEsrBΔPstB菌株及其衍生菌株，PstC基因丧失功能的E.tardaΔEvpCΔEsrBΔPstC菌株及其衍生菌株。上述弱毒株的EvpC、EsrB、PstB和PstC等1—3个基因存在引起其功能丧失的部分或全部缺失、点突变、移位或插入。较野生1101菌株或其他强毒株，E.tarda△EvpC、E.tarda△EvpCΔEsrB、E.tardaΔEvpCΔEsrBΔPstB和E.tardaΔEvpCΔEsrBΔPstC菌株的毒力分别不超过野生迟缓爱德华氏菌上述的迟缓爱德华氏菌基因工程弱毒株可作为爱德华氏菌的弱毒疫苗株、基因工程载体或益生菌得到应用。
迟缓爱德华基因工程弱毒株及其应用

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