本发明公开了一种类肠道病原菌感染诊断用基因芯片鼠伤寒沙门菌特异性基因探针,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。通过确定候选序列后,设计特异性引物,选用标准和临床分离的野生菌株进行PCR调查和相应的序列分析验证。根据验证的病原菌特异性探针序列,设计合成引物并经PCR扩增相应的特异性核苷酸片段,每个长约200核苷酸,再通过重叠延伸PCR将某种病原菌的3至5个特异性片段扩增链接,以此作为各种病原菌特异性的探针。本发明将多个基因的高度特异区域串联制成的探针,不但有较高的特异性,而且由于可同时与多个特异片段杂交使检测的灵敏度大为提高。
本发明公开了一种类肠道病原菌感染诊断用基因芯片伤寒沙门菌特异性基因探针,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。通过确定候选序列后,设计特异性引物,选用标准和临床分离的野生菌株进行PCR调查和相应的序列分析验证。根据验证的病原菌特异性探针序列,设计合成引物并经PCR扩增相应的特异性核苷酸片段,每个长约200核苷酸,再通过重叠延伸PCR将某种病原菌的3至5个特异性片段扩增链接,以此作为各种病原菌特异性的探针。本发明将多个基因的高度特异区域串联制成的探针,不但有较高的特异性,而且由于可同时与多个特异片段杂交使检测的灵敏度大为提高。
本发明公开了一种类肠道病原菌感染诊断用基因芯片甲型副伤寒沙门菌特异性基因探针,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。通过确定候选序列后,设计特异性引物,选用标准和临床分离的野生菌株进行PCR调查和相应的序列分析验证。根据验证的病原菌特异性探针序列,设计合成引物并经PCR扩增相应的特异性核苷酸片段,每个长约200核苷酸,再通过重叠延伸PCR将某种病原菌的3至5个特异性片段扩增链接,以此作为各种病原菌特异性的探针。本发明将多个基因的高度特异区域串联制成的探针,不但有较高的特异性,而且由于可同时与多个特异片段杂交使检测的灵敏度大为提高。
本发明公开了一种类肠道病原菌感染诊断用基因芯片乙型副伤寒沙门菌特异性基因探针,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。通过确定候选序列后,设计特异性引物,选用标准和临床分离的野生菌株进行PCR调查和相应的序列分析验证。根据验证的病原菌特异性探针序列,设计合成引物并经PCR扩增相应的特异性核苷酸片段,每个长约200核苷酸,再通过重叠延伸PCR将某种病原菌的3至5个特异性片段扩增链接,以此作为各种病原菌特异性的探针。本发明将多个基因的高度特异区域串联制成的探针,不但有较高的特异性,而且由于可同时与多个特异片段杂交使检测的灵敏度大为提高。
本发明公开了一种类肠道病原菌感染诊断用基因芯片丙型副伤寒沙门菌特异性基因探针,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。通过确定候选序列后,设计特异性引物,选用标准和临床分离的野生菌株进行PCR调查和相应的序列分析验证。根据验证的病原菌特异性探针序列,设计合成引物并经PCR扩增相应的特异性核苷酸片段,每个长约200核苷酸,再通过重叠延伸PCR将某种病原菌的3至5个特异性片段扩增链接,以此作为各种病原菌特异性的探针。本发明将多个基因的高度特异区域串联制成的探针,不但有较高的特异性,而且由于可同时与多个特异片段杂交使检测的灵敏度大为提高。
本发明公开了检测链特异性效率的成套试剂与方法。本发明公开的检测链特异性效率的成套试剂由SEQ ID NO:1‑6所示的RNA组成,检测链特异性效率的方法,包括:向待建库的RNA中添加本发明的成套试剂,后进行链特异性转录组文库构建,然后进行高通量测序,将测序数据与成套试剂的序列进行比对,计算成套试剂的正义比对读段数目占成套试剂的总读段数目的比例,该比例即为链特异性系数,根据链特异性系数确定链特异性效率。本发明的检测链特异性效率的方法与成套试剂可以用于指示mRNA或非编码RNA等链特异性转录组测序数据的可信程度,确保分析结果的可靠性。