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[发明专利]miRNA海绵模块的识别方法和装置-CN201910684738.7有效
发明人：张俊鹏;饶妮妮 -专利权人：电子科技大学
申请日： 2019-07-26 - 公布日： 2021-06-08 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明提供一种miRNA海绵模块的识别方法和装置，其方法包括：获取匹配样本的海绵基因的表达矩阵和靶基因的表达矩阵。根据海绵基因的表达矩阵和靶基因的表达矩阵，获取多个海绵基因‑靶基因共表达模块。获取每个海绵基因‑靶基因共表达模块中，共享miRNA的显著性值、海绵基因与靶基因之间的典型相关系数以及共享miRNA时的敏感性典型相关系数。并根据以上参数确定每个海绵基因‑靶基因共表达模块是否为miRNA海绵模块。由于本方案可在模块水平下度量海绵基因与靶基因之间的竞争强度，并根据海绵基因与靶基因之间竞争强度的确定海绵基因‑靶基因共表达模块是否为miRNA海绵模块，使得miRNA海绵模块的识别更加准确。
mirna 海绵模块识别方法装置

[发明专利]基因表达或活性增强性元件-CN201480048830.X在审
发明人： T·森杰;J·鲍尔 -专利权人：巴斯夫植物科学有限公司
申请日： 2014-07-03 - 公布日： 2016-04-20 - 主分类号： C12N15/11 文献下载
摘要：本发明提供了重组核酸、表达盒、载体、植物细胞、植物器官和植物，其中包括含有靶基因和增强子的转基因核酸。本发明也提供了用于增加靶基因表达或活性的方法，特别地提供了用于在植物细胞或植物器官中增加靶基因表达或活性的方法，以及提供了重组核酸和表达盒增加靶基因表达或活性的用途或用于制备载体、植物细胞、植物器官或植物的用途所述增强子增加靶基因表达或活性，且靶基因是脂肪酸去饱和酶基因或延伸酶基因。
基因表达活性增强元件

[发明专利]一种果蝇转基因表达水平的调控方法-CN201710366405.0有效
发明人：张徐波;李开霞;董玮;张建珍 -专利权人：山西大学
申请日： 2017-05-23 - 公布日： 2020-07-10 - 主分类号： C12N15/85 文献下载
摘要：本发明涉及一种果蝇转基因表达水平的调控方法，属于生物技术领域。本发明主要解决现有Gal4/UAS对靶基因表达水平操控不够灵活的问题。技术方案是：一种果蝇转基因表达水平的调控方法，包括以下步骤：1)首先将靶基因的过表达转基因序列和RNAi转基因序列进行重组；2)用同一Gal4驱动该品系；3)将子代在16‑18℃低温下培养，控制靶基因温和地过表达；4)在29‑30℃高温下进行培养，抑制靶基因表达；5)低温(16‑18℃)培养后转入高温(29‑30℃)培养，使靶基因的过表达，再抑制表达；6)高温(29‑30℃)培养后转入低温(16‑18℃)，控制靶基因先抑制表达，再转为过表达。
一种果蝇转基因表达水平调控方法

[发明专利]用于癌症治疗的多靶向RNAi-CN201580022432.5在审
发明人：唐纳德·拉奥;约翰·内穆奈蒂斯;贝尔特·W·奥马利;大卫·洛纳尔德 -专利权人：斯特里克生物公司;贝勒医学院
申请日： 2015-04-24 - 公布日： 2017-05-10 - 主分类号： C12N15/113 文献下载
摘要：本发明包括用于制备和使用能够降低两个或更多个基因的表达的RNAi的组合物和方法，其包括降低第一靶基因表达的第一RNAi分子；降低所述第一靶基因或第二靶基因的表达的第二RNAi分子；和任选地降低所述第一靶基因、第二靶基因或第三靶基因的表达的第三RNAi分子，其中所述RNAi分子降低例如突变KRAS、SRC‑3、EGFR、PIK3、NCOA3或ERα1的表达水平，并且可以是例如miRNA、shRNA或双功能shRNA
用于癌症治疗靶向 rnai

[发明专利]基因表达的选择性剪接调控及治疗方法-CN201980064769.0在审
发明人： B·L·戴维森;A·M·莫内斯;A·A·亨德利;P·T·拉努姆 -专利权人：费城儿童医院
申请日： 2019-08-07 - 公布日： 2021-05-14 - 主分类号： A61K31/551 文献下载
摘要：本文提供了嵌合反式激活子小基因，其中小基因的选择性剪接决定了反式激活子是否表达。反式激活子的表达导致受设计启动子序列控制下的靶基因转录。或者，本文提供嵌合靶基因小基因，其中小基因的选择性剪接直接决定靶基因是否表达。靶基因可以编码抑制性RNA、CRISPR‑Cas9蛋白或治疗性蛋白。
基因表达选择性剪接调控治疗方法

[发明专利]一种构建植物转录因子对靶基因遗传调控网络的方法-CN202010690681.4有效
发明人：张德强;权明洋;肖亮;卢文杰 -专利权人：北京林业大学
申请日： 2020-07-17 - 公布日： 2023-06-16 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本发明涉及一种构建植物转录因子对靶基因遗传调控网络的方法，属于分子遗传学技术领域。获得植物待测转录因子在群体中每一个体的SNP基因型数据、植物待测转录因子在群体中每一个体的特定组织的表达量数据和植物待测候选靶基因在群体中每一个体的相同组织的表达量数据后；确定与候选靶基因表达量显著关联的SNP；确定与待测转录因子表达量高度相关的候选靶基因；当同时满足确定条件时，表明待测转录因子调控了候选靶基因表达，可依此构建转录因子对靶基因的遗传调控网络。本发明所述方法可高通量、精准鉴定植物转录因子与下游靶基因的调控关系，构建转录因子对靶基因的遗传调控网络。
一种构建植物转录因子基因遗传调控网络方法

[发明专利]反义lncRNA介导顺式调控抑制靶基因表达的方法-CN201810460165.5在审
发明人：文雪;胡继繁;孙京男;崔久嵬;李赵志 -专利权人：吉林大学
申请日： 2018-05-15 - 公布日： 2018-09-18 - 主分类号： C12N15/90 文献下载
摘要：本发明公开了一种反义lncRNA介导顺式调控抑制靶基因表达的方法，利用lncRNA具有竞争内源靶RNA的作用，通过CRISPR Cas9基因编辑方法以RNA作为基因组定位工具在靶基因上插入强启动子，通过大量合成一条与靶基因互补的反义lncRNA，实现原位顺式竞争抑制内源靶基因的表达，为一种反义lncRNA介导顺式(cis)调控抑制基因表达的方法。首先构建靶向载体和同源模板链供体载体，将构建的载体同时转染入宿主细胞，通过嘌呤霉素和更昔洛韦共筛选目标克隆，最后对靶基因表达进行检测及功能研究。
反义介导抑制靶基因顺式调控靶基因构建顺式调控抑制基因内源靶基因靶向载体定位工具更昔洛韦功能研究供体载体基因表达目标克隆强启动子宿主细胞嘌呤霉素基因组模板链靶RNA 对靶内源转染合成筛选基因检测

[发明专利]一种多基因干扰的shRNA质粒表达载体及其构建方法与应用-CN200710048473.9无效
发明人：马义才;顾敏;马灵 -专利权人：马义才
申请日： 2007-02-13 - 公布日： 2008-08-20 - 主分类号： C12N15/63 文献下载
摘要：本发明公开一种可同时用于表达多个shRNA的质粒载体pSilencer－U6/H1－(shRNA)n及其构建方法与应用。所述载体由两组多克隆位点序列(MCS)、多个靶基因shRNA转录单位和质粒序列组成。载体的两组多克隆位点序列之间可串联多个不同或相同靶基因的shRNA转录单位，转染细胞或动物后，其上的多个shRNA转录单位可多次表达一个靶基因，或表达一个靶基因的多个不同位点，或表达不同靶基因，因而可特异抑制两个或多个靶基因的表达所述载体可方便用于基因功能研究和疾病基因治疗药物的研究与开发。
一种多基因干扰 shrna 质粒表达载体及其构建方法应用

[发明专利]一种向动物细胞中转移外源基因的方法-CN01120685.3无效
发明人：张靖溥;李光三;杜淼 -专利权人：中国科学院发育生物学研究所
申请日： 2001-07-27 - 公布日： 2004-02-11 - 主分类号： C12N15/63 文献下载
摘要：本发明提供了一种向动物细胞中转移外源基因的方法，包括使用靶基因构建靶基因表达载体；使用核定位蛋白基因构建核定位蛋白基因表达载体；以及将得到的靶基因表达载体和核定位蛋白基因表达载体共转染或共注射或电穿孔到培养细胞的细胞质中或动物受精卵细胞质中的步骤
一种动物细胞转移基因方法

[发明专利]一种鉴定miRNA靶基因的试剂盒及其应用-CN201110031828.X有效
发明人：李军锋;周育森;鲍春旸;于虹;郭彦 -专利权人：中国人民解放军军事医学科学院微生物流行病研究所
申请日： 2011-01-28 - 公布日： 2011-08-31 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明公开了一种鉴定miRNA靶基因的试剂盒及其应用。本发明报告载体在鉴定miRNA靶基因和/或检测miRNA表达中的应用；试剂盒在鉴定miRNA靶基因和/或检测miRNA表达中的应用；载体在鉴定miRNA靶基因和/或检测miRNA表达中的应用；所述报告载体，包括报告基因和分别位于所述报告基因上下游的启动子及多克隆位点；所述报告基因为萤火虫荧光素酶的编码基因。本发明的实验证明，本研究设计了miRNA靶基因鉴定的双报告基因载体系统，用于miRNA研究中的调控靶基因快速鉴定和对miRNA表达调控进行评价。
一种鉴定 mirna 基因试剂盒及其应用

[发明专利]Ti质粒黑曲霉基因置换表达载体及其应用-CN201310066124.5有效
发明人：李杰;张会;张莹莹;刘君;邓晨旭;王泽芸;陈璐璐;何勇;薛立新 -专利权人：东北农业大学;肇东市日成酶制剂有限公司
申请日： 2013-03-01 - 公布日： 2013-11-27 - 主分类号： C12N15/80 文献下载
摘要：Ti质粒黑曲霉基因置换表达载体及其应用，属于分子生物学技术领域。其T-DNA区域元件排列次序如下：黑曲霉靶基因启动子、多克隆位点、黑曲霉靶基因终止子、构巢曲霉3-磷酸甘油醛脱氢酶基因启动子PgpdA、黑曲霉筛选标记基因、黑曲霉靶基因终止子。本发明通过目的基因同源重组整合在黑曲霉靶基因位点，目的基因由高表达的靶基因启动子调控，消除转基因的位置效应，提高表达水平。
ti 质粒曲霉基因置换表达载体及其应用

[发明专利]利用种子序列检测山羊组织或器官中microRNA靶基因的方法-CN201210038354.6无效
发明人：付绍印;赵德超;张文广;李金泉 -专利权人：内蒙古农业大学
申请日： 2012-02-13 - 公布日： 2012-08-22 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明涉及一种利用种子序列检测山羊组织或器官中microRNA靶基因的分子方法。具体而言，提供了种子序列介导的可控遗传操作，用于在基因表达检测中筛选与特定microRNA相关的靶基因。在设定上游种子序列的互补序列和下游锚定序列的基础上添加特殊接头，通过反转录和特殊二步PCR将microRNA的靶基因扩增；扩增后的microRNA靶基因在聚丙烯酰胺凝胶电泳中检测其片段大小和表达丰度，用于筛选在不同生理状态或实验条件下特异表达的基因；特定的靶基因序列通过DNA回收和测序方法得到。此法可用于评估microRNA调节的基因或遗传途径，也可用表达谱来评估基因表达特征，在系统生物学研究中具有重要价值。
利用种子序列检测山羊组织器官 microrna 基因方法

[发明专利]单样本ceRNA竞争模块识别方法、装置、电子设备及存储介质-CN202210640908.3在审
发明人：张俊鹏;孙少平;赵春文;李司婧;杨燕婷 -专利权人：大理大学;玉溪市人民医院
申请日： 2022-06-07 - 公布日： 2022-10-04 - 主分类号： G16B40/00 文献下载
摘要：本发明提供一种单样本ceRNA竞争模块识别方法、装置、电子设备及存储介质，涉及基因识别技术领域。该单样本ceRNA竞争模块识别方法包括：根据匹配样本的miRNA表达谱数据、靶基因表达谱数据和先验的miRNA‑靶基因的调控关系，识别得到多个第一ceRNA竞争模块。敲除匹配样本的miRNA表达谱数据、靶基因表达谱数据和先验的miRNA‑靶基因的调控关系中的目标样本。根据敲除目标样本的匹配样本的miRNA表达谱数据、靶基因表达谱数据和先验的miRNA‑靶基因的调控关系，识别得到多个第二ceRNA竞争模块。
样本 cerna 竞争模块识别方法装置电子设备存储介质

[发明专利]单细胞miRNA海绵网络推理方法、装置、设备及存储介质-CN202310240915.9在审
发明人：张俊鹏;孙少平;魏雪梅;赵春文;李司婧;罗艳碧 -专利权人：大理大学;玉溪市人民医院
申请日： 2023-03-13 - 公布日： 2023-07-25 - 主分类号： G16B25/10 文献下载
摘要：本发明提供一种单细胞miRNA海绵网络推理方法、装置、设备及存储介质，涉及基因识别技术领域。具体实现方案包括：获取多个细胞中每个细胞各自对应的多个第一靶基因的表达谱数据、多个第二靶基因的表达谱数据、以及miRNA的表达谱数据；根据预设的miRNA‑靶基因调控关系数据和每个细胞各自对应的多个第一靶基因的表达谱数据、多个第二靶基因的表达谱数据、以及miRNA的表达谱数据，确定每个细胞中的miRNA海绵竞争关系对；根据每个细胞中的miRNA海绵竞争关系对，确定每个细胞的miRNA海绵网络。
单细胞 mirna 海绵网络推理方法装置设备存储介质

[发明专利]对细胞中的靶位点进行基因编辑的方法-CN202010949701.5在审
发明人：张楫钦;杨佳璇;杜冰;刘明耀;席在喜 -专利权人：华东师范大学;上海邦耀生物科技有限公司
申请日： 2020-09-10 - 公布日： 2022-03-11 - 主分类号： C12N15/85 文献下载
摘要：本发明提供了对细胞中的靶位点进行基因编辑的方法，具体地，本发明公开了一种对细胞基因组的靶位点进行基因编辑的方法，包括：(a)提供一待基因编辑的细胞；(b)将(i)基因编辑酶或其编码核酸或表达所述基因编辑酶的第一表达载体；和(ii)gRNA或表达所述gRNA的第二表达载体导入所述细胞中，对所述细胞基因组的靶位点进行基因编辑，所述gRNA引导基因编辑酶对靶位点进行定点切割；其中，所述gRNA靶向的靶向序列包含SEQ ID本发明的方法可对靶位点进行高效基因编辑。
细胞中的靶位点进行基因编辑方法

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