本发明公开了一种增强型VPR蛋白及血浆游离核酸提取的方法。其中,该增强型VPR蛋白的氨基酸序列是由SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列发生突变得到的氨基酸序列,突变至少包括如下突变位点之一:第55位、第102位、第134位和第166位,且第55位的酪氨酸突变为苯丙氨酸;第102位的丝氨酸突变为苏氨酸;第134位的丝氨酸突变为异亮氨酸;第166位的丝氨酸突变为苏氨酸;或者增强型VPR蛋白的氨基酸序列具有发生突变的氨基酸序列中的突变位点,且与发生突变的氨基酸序列具有98%以上同源性的氨基酸序列。本发明的增强型VPR蛋白在常温下就有较高的活性,因而在血浆游离核酸提取中不需要升温,减少核酸降解。