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[发明专利]一种用于监测泛素化蛋白质组学中泛素化肽段富集过程的方法-CN202310852603.3在审
发明人：乔舰;张宝;陈亮宇;李捷 -专利权人：谱天（天津）生物科技有限公司
申请日： 2023-07-12 - 公布日： 2023-10-20 - 主分类号： G01N33/68 文献下载
摘要：本发明公开了一种用于监测泛素化蛋白质组学中泛素化肽段富集过程的方法，包括以下步骤：1)设置至少两组外源肽段参考品，每组外源肽段参考品至少包含一条有泛素化修饰位点的肽段，并且对于每一组中每种肽段，在其他各组中均有序列一致，但是同位素标记不同的对应肽段；2)在样品处理过程中，在不同的时间点加入上述不同的外源肽段参考品，且任意两组外源肽段参考品加入的时间点之间，均包括泛素化肽段富集的步骤；3)进样检测，提取处理数据，定量外源肽段参考品，计算不同泛素化修饰肽段的得率比值，以此评价两个外源肽段参考品加入时间点之间的泛素化富集过程是否合格。该方法能有效评价泛素化肽段富集效率。
一种用于监测泛素化蛋白质组学中泛素化肽段富集过程方法

[发明专利]一种蛋白质类泛素化修饰位点鉴定方法-CN201210398526.0有效
发明人：王立顺;汪彤丹;余韵;韩冰 -专利权人：上海交通大学医学院附属瑞金医院
申请日： 2012-10-18 - 公布日： 2014-05-07 - 主分类号： G01N30/02 文献下载
摘要：本发明涉及一种蛋白质类泛素化修饰位点鉴定方法，该特异性富集标记鉴定方法首先是对纯化后的类泛素化修饰蛋白质进行酶解，通过特异性类泛素化抗体富集类泛素化修饰的酶切肽段，随后利用化学标记对所富集肽段中的非修饰化的赖氨酸氨基残基进行保护，并经去泛素化酶催化反应以裸露出底物肽段序列上被修饰的赖氨酸，经液相色谱串联质谱联用仪分析肽段序列，通过蛋白质质谱数据分析软件匹配得到被化学修饰的肽段序列，其序列中含有游离氨基的赖氨酸位点即为类泛素化修饰位点与目前常用的基因突变方法获得位点方式比较，本发明的优点是无需繁琐的基因突变技术手段即可快速、高效、准确地得到蛋白质类泛素化修饰位点信息。
一种蛋白质类泛素化修饰鉴定方法

[发明专利]缀合物及其在降解β-catenin蛋白中的应用-CN201911166179.7有效
发明人：陈晔光;胡宏岗;刘磊;廖洪蔚;李翔;赵联正 -专利权人：清华大学;上海大学
申请日： 2019-11-25 - 公布日： 2022-04-08 - 主分类号： A61K38/53 文献下载
摘要：本发明提出了E3泛素连接酶VHL在降解β‑catenin蛋白或抑制Wnt/β‑catenin信号通路中的用途及缀合物及其制备方法和用途，所述缀合物包括：第一肽段，所述第一肽段适于与β‑catenin蛋白结合；第二肽段，所述第二肽段适于与E3泛素连接酶VHL结合；连接臂，所述第一肽段与第二肽段通过所述连接臂相连。E3泛素连接酶VHL可以对β‑catenin蛋白进行泛素化修饰，以便蛋白酶降解泛素化的β‑catenin蛋白，从而抑制Wnt/β‑catenin信号通路，起到抑制癌细胞增殖及成瘤能力的作用，具有广泛的科学研究和临床应用前景
缀合物及其降解 catenin 蛋白中的应用

[发明专利]一种蛋白质靶向嵌合体降解MDM2/MDMX蛋白的订书肽缀合物及其用途-CN202111096791.9有效
发明人：李翔;陆五元;胡宏岗;耿晨晨;陈思 -专利权人：中国人民解放军海军军医大学
申请日： 2021-09-18 - 公布日： 2023-06-30 - 主分类号： C07K19/00 文献下载
摘要：本发明涉及多肽药物领域，具体是一种蛋白质靶向嵌合体(PROTACTs)降解MDM2/MDMX蛋白的订书肽缀合物及其制备方法和用途。所述订书肽缀合物由三部分组成：第一肽段，适于与MDM2/MDMX蛋白结合；第二肽段，适于与E3泛素连接酶VHL结合；连接臂，第一肽段与第二肽段通过所述连接臂相连。E3泛素连接酶VHL可以对MDM2/MDMX蛋白进行泛素化修饰，以便蛋白酶降解泛素化的MDM2/MDMX蛋白，从而激活P53因子起到杀死癌细胞以及抑制成瘤能力的作用，具有潜在的应用价值。
一种蛋白质靶向嵌合体降解 mdm2 mdmx 蛋白订书肽缀合物及其用途

[发明专利]非抗体依赖的泛素化修饰富集方法和检测方法-CN202210220908.8在审
发明人：张小飞;孙明伟;张青;邬文峰;黄秋玲 -专利权人：中国科学院广州生物医药与健康研究院;生物岛实验室
申请日： 2022-03-08 - 公布日： 2022-06-10 - 主分类号： G01N30/06 文献下载
摘要：本发明公开了一种非抗体依赖的蛋白质泛素化修饰富集方法，包括全蛋白质提取、蛋白水平自由氨基完全封闭、底物蛋白上泛素链水解、含有可富集标签试剂标记泛素化修饰位点处的自由氨基、蛋白质的酶切、标记的泛素化修饰肽段的富集本发明还涉及检测方法，即对富集后的泛素化修饰肽段通过液相‑质谱检测。本发明不需要利用抗体识别酶切后产生的泛素残留基序，即可实现蛋白质泛素化修饰的无差别富集及鉴定。
抗体依赖泛素化修饰富集方法检测

[发明专利]渗透胁迫泛素化修饰蛋白筛选方法-CN201811538526.X有效
发明人：唐勋;司怀军;张宁 -专利权人：甘肃农业大学
申请日： 2018-12-17 - 公布日： 2021-05-18 - 主分类号： G01N30/08 文献下载
摘要：本发明提供一种马铃薯渗透胁迫下泛素化修饰蛋白筛选方法，包括：（1）茎尖脱毒组培苗繁育及分组与胁迫处理；（2）泛素（Ub）和26S蛋白酶体（26S）表达量测定并确定取样时间；（3）蛋白质样品制备；（4）蛋白样品胰酶酶解；（5）泛素化肽段富集；（6）LC‑MS/MS分析；（7）质谱数据分析。该方法能够准确并最大限度的筛选出马铃薯渗透胁迫下泛素化修饰蛋白，共得渗透胁迫下差异泛素化修饰位点25个，这些显著变化的泛素化修饰蛋白与渗透胁迫响应有关，因此本申请所述筛选泛素化修饰蛋白的方法对发现响应渗透胁迫的基因和阐明泛素化修饰参与渗透胁迫的机制具有重要意义和显著进步
渗透胁迫泛素化修饰蛋白筛选方法

[发明专利]一种用于监测甲基化蛋白质组学中甲基化肽段富集过程的方法-CN202310756177.3在审
发明人：乔舰;张宝;陈亮宇;李捷 -专利权人：谱天（天津）生物科技有限公司
申请日： 2023-06-26 - 公布日： 2023-10-03 - 主分类号： G01N27/62 文献下载
摘要：本发明公开了一种用于监测甲基化蛋白质组学中甲基化肽段富集过程的方法，包括以下步骤：1)设置至少两组外源肽段参考品，每组外源肽段参考品至少包含有三种不同甲基化修饰位点的肽段，并且对于每一组中每种肽段，在其他各组中均有序列一致，但是同位素标记不同的对应肽段；2)在样品处理过程中，在不同的时间点加入上述不同的外源肽段参考品，且任意两组外源肽段参考品加入的时间点之间，均包括甲基化肽段富集的步骤；3)进样检测，提取处理数据，定量外源肽段参考品，计算不同甲基化修饰肽段的得率比值，以此评价两个外源肽段参考品加入时间点之间的甲基化富集过程是否合格。该方法能有效评价甲基化肽段富集效率。
一种用于监测甲基化蛋白质组学中富集过程方法

[发明专利]基于高精度质谱的蛋白类泛素化修饰位点检测方法及应用-CN202110682943.7在审
发明人：夏立;孟丽媛;沈诚频;王晓庆;孟爽;周立 -专利权人：上海交通大学医学院
申请日： 2021-06-18 - 公布日： 2021-12-28 - 主分类号： G01N30/02 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于高精度质谱的蛋白类泛素化修饰位点检测方法及应用，所述蛋白类泛素化修饰位点检测方法包括以下步骤：步骤S1：构建获得体外SUMO化修饰反应体系，以获得目标蛋白；步骤S2：对步骤S1所获得的目标蛋白进行胰蛋白酶酶切，获得酶切后的多肽肽段；步骤S3：将步骤S2获得的多肽通过液相色谱质谱联用分析采集得到多肽质谱数据，经数据解析，得到修饰位点以及核心肽段的序列；步骤S4：化学合成含有SUMO化修饰位点的同位素标记肽段序列，采用PRM方法进行位点确证，确定一套母‑子离子对；步骤S5：用步骤S4建立的母‑子离子对对内源修饰位点进行检测；所述SUMO化修饰是指SUMO1类泛素化修饰。
基于高精度蛋白类泛素化修饰检测方法应用

[发明专利]用于早期糖尿病诊断的多肽标志物-CN201410090215.7无效
发明人：邓玉林;张玫 -专利权人：北京理工大学
申请日： 2014-03-12 - 公布日： 2014-07-02 - 主分类号： C07K7/08 文献下载
摘要：本发明提供了用于早期糖尿病诊断的多肽标志物，首先选择人外周血高丰度蛋白HSA建立体外模拟糖基化模型，优化条件下酶切，将酶切后的空白对照组样品进行¹⁸O标记，与采用¹⁶O平行处理的反应组样品1:1(v/v)混合，进行HPLC/ESI-TOF MS检测。通过对HSA肽段的定量分析，找到最不易被葡萄糖修饰的肽段如SEQ ID NO.1所示，作为内标肽段，将易发生糖基化修饰的肽段与内标肽段峰面积之比用以衡量葡萄糖敏感肽的糖基化修饰程度，通过蛋白质组学方法最终发现3条肽段FKDLGEENFK、LDELRDEGK和KVPQVSTPTLVEVSR可作为生物标志物用于糖尿病的早期诊断。
用于早期糖尿病诊断多肽标志

[发明专利]燕窝特征性肽段、其筛选方法及应用-CN202210628516.5在审
发明人：王东亮;戴建业;郭伟恒;林小仙;苗树 -专利权人：北京小仙炖生物科技有限公司
申请日： 2022-06-06 - 公布日： 2022-10-04 - 主分类号： C07K7/06 文献下载
摘要：本发明涉及一种可用于燕窝真伪鉴定的特征性肽段，其包含21个肽段氨基酸序列。在进行燕窝真伪鉴定时，酶解待检品，再经还原、烷基化后，进行高效液相色谱分离，通过高分辨质谱分析，将得到的蛋白肽段与上述特征性肽段进行对比。本发明还提供上述特征性肽段的筛选方法。本发明从燕窝中鉴定出了21个特征性肽段，大大丰富了燕窝特征性肽段的数目，并且基于蛋白质组学技术，利用胶内酶切方法鉴定了不同分子量的燕窝蛋白和肽段，建立了一种燕窝特征性肽段的筛选方法。
燕窝特征性肽段筛选方法应用

[发明专利]人工构建的杂种泛素结合结构域多肽及其应用-CN201410323921.1有效
发明人：徐平;高媛;李衍常;赵明治;王京伟;常蕾;武军驻;贺福初 -专利权人：中国人民解放军军事医学科学院放射与辐射医学研究所
申请日： 2014-07-08 - 公布日： 2018-04-27 - 主分类号： C07K19/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种人工构建的杂种泛素结合结构域多肽及其应用。本发明所提供的杂种泛素结合结构域多肽，由至少两个泛素结合结构域串联而成；且在组成所述杂种泛素结合结构域多肽的所有泛素结合结构域中，至少有两个泛素结合结构域是不同的。另外，所述杂种泛素结合结构域多肽还可含有标签蛋白。实验证明，本发明提供的杂种泛素结合结构域多肽能够高效、无偏性的结合泛素分子及其携带的不同的泛素链，可以提高大规模泛素化蛋白质的富集效率，用于开发高效的泛素化蛋白质分离介质和生化试剂，也可为体内蛋白质泛素化的调节提供技术手段本发明对于推动人类疾病样本泛素化蛋白质组学研究和健康医学的发展具有重要意义。
人工构建杂种结合结构多肽及其应用

[发明专利]一种异构数据不依赖型蛋白质组学质谱分析系统及方法-CN202011005330.1有效
发明人：钟传奇;陈希;韩强强;尚骏;黄邵鑫;刘宜子;杜博贾;杨勇;周欣 -专利权人：谱度众合（武汉）生命科技有限公司
申请日： 2020-09-23 - 公布日： 2022-07-08 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种异构数据不依赖型蛋白质组学质谱分析系统及方法。所述系统包括本地客户端和云端高性能服务器。所述方法，包括以下步骤：(1)本地客户端读取本地异构数据不依赖型蛋白质组学质谱数据，调用云端高性能服务器，获取数据解释器；(2)本地客户端在本地完成数据解释及谱图提取、伪肽段生成后，将肽段谱图数据、伪肽段以及目标检测肽段，提交给高性能服务器端；(3)所述高性能服务器，根据所述本地客户端提供的肽段谱图数据、伪肽段、以及目标检测肽段进行数据分析，将计算的蛋白质组学分析结果，返回给所述本地客户端。本发明能兼顾原始数据不依赖型蛋白质组学质谱数据的私密性和强大的运算能力。
一种数据不依赖蛋白质组学质谱分析系统方法

[发明专利]一种提高肽段离子化效率的方法-CN200810039698.2无效
发明人：许亚伟;张莉娟;陆豪杰;杨芃原 -专利权人：复旦大学
申请日： 2008-06-26 - 公布日： 2009-02-11 - 主分类号： G01N1/28 文献下载
摘要：本发明属生化分析领域，涉及一种提高肽段离子化效率的方法。本发明利用碱性和疏水性有机化合物对蛋白质或肽段羧基衍生，提高肽段离子化效率，并对所衍生的样品直接进行质谱分析和鉴定。本发明选用的有机化合物能高效率、高特异性地与肽段的羧基形成共价键，从而有效地提高肽段与质子的结合能力和肽段的疏水性，极大地提高肽段的离子化效率，促使低丰度、难电离的肽段得到检测。本发明具有反应特异性高、副反应少、步骤简单、经济和省时等特点，可广泛用于蛋白质组学领域，大大提高了质谱对低丰度及难电离肽段的检测能力。
一种提高离子化效率方法

[发明专利]一种用于监测磷酸化蛋白质组学中磷酸化肽段富集过程的方法-CN202310585540.X在审
发明人：张宝;陈亮宇;李捷 -专利权人：谱天（天津）生物科技有限公司
申请日： 2023-05-23 - 公布日： 2023-08-29 - 主分类号： G16B40/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种用于监测磷酸化蛋白质组学中磷酸化肽段富集过程的方法，包括以下步骤：1)设置至少两组外源肽段参考品，每组外源肽段参考品至少包含三条含有不同磷酸化修饰位点的肽段，并且对于每一组中每种肽段，在其他各组中均有序列一致，但是同位素标记不同的对应肽段；2)在样品处理过程中，在不同的时间点加入上述不同的外源肽段参考品，且任意两组外源肽段参考品加入的时间点之间，均包括磷酸化肽段富集的步骤；3)进样检测，提取处理数据，定量外源肽段参考品，计算不同磷酸化修饰肽段的得率比值，以此评价两个外源肽段参考品加入时间点之间的磷酸化富集过程是否合格。该方法能有效评价磷酸化肽段富集效率。
一种用于监测磷酸化蛋白质组学中富集过程方法

[发明专利]一种特异性分离富集磷酸化肽和糖基化肽的方法-CN201810120355.2有效
发明人：邓春晖;王嘉雯;姚继宗;孙念荣 -专利权人：复旦大学
申请日： 2018-02-07 - 公布日： 2021-11-19 - 主分类号： C07K1/22 文献下载
摘要：本发明提出一种特异性分离富集磷酸化肽和糖基化肽的方法，具体步骤如下，将亲水性磁性介孔二氧化钛材料配置成分散液，和目标糖基化肽段和磷酸化肽段溶液加入上样缓冲液中，37℃下孵育30‑60分钟，用上样缓冲液洗涤材料本发明通过控制富集及洗脱条件实现对低丰度糖基化肽及磷酸化肽的同时富集，结合MALDI‑TOF MS或者nano‑LC‑MS/MS能够实现同时大规模鉴定糖基化蛋白质和磷酸化蛋白质，在翻译后修饰蛋白质组学中具有广阔的应用前景
一种特异性分离富集磷酸化糖基化肽方法

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