本发明提出了一种构建芜菁初级核心种质的多态性SSR引物及方法，所述多态性SSR引物包含31对引物，所述引物的序列为SEQ ID No.1～SEQ ID No.62。本发明利用31对多态性SSR引物，对芜菁材料进行扩增，确定遗传相似系数矩阵，将遗传相似系数矩阵通过NTSYS 2.10e及PowerMarker V3.25软件进行聚类分析；采用欧式距离计算聚类分析的原始种质群体的遗传距离，选取芜菁材料的初级核心种质。本发明的芜菁初级核心种质的构建能够排除遗传冗余，使得累积贡献率明显提高。
本发明公开了基于小豆全基因组测序和核心种质重测序开发的SSR核心引物组及其应用。具体地公开了SSR核心引物组，包括230对引物(SEQ ID No.1‑460)中的至少5对。本发明建立了小豆全基因组SSR标记的开发方法，该方法全面准确可靠，解决了现有小豆SSR标记数量少、多态性低、基因组覆盖率低等问题。本发明的SSR核心引物组能最大限度的反映小豆种质资源的遗传多样性，具有多态性高、分布均匀、扩增稳定、重复性好、位点明确、电泳条带清晰易于辨别统计等特点，可准确进行亲缘关系分析和多样性分析，并有助于遗传图谱构建
本发明公开了基于谷子全基因组序列开发的SSR核心引物组及其应用，属于分子生物学技术领域。所述核心引物组，包括30对引物，其核苷酸序列如序列表SEQ ID No.1～60所示。上述引物具有分布均匀、扩增稳定、电泳条带清晰、多态性丰富的优点。本发明还提供了SSR核心引物组在谷子遗传多样性和品种鉴定中的应用。该组引物能准确快速鉴定谷子品种，准确反映谷子品种间的遗传关系。
一套萝卜EST-SSR核心引物组合，所述引物组合包括核苷酸序列如序列表SEQ ID No.1～42所示引物。本发明获得的SSR核心引物组合具有能够最大限度反映萝卜种质材料遗传多样性、标记稳定可靠、重复性好、多态性高、便于统计等优点。利用该套引物组合进行遗传多样性分析，能够以最少的引物数量最大限度反映供试材料的遗传亲缘关系。
