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[发明专利]一种水稻核心种质智能管理系统和方法-CN201610035945.6在审
发明人：郑丽敏;黄斌;杨璐;田立军 -专利权人：中国农业大学
申请日： 2016-01-20 - 公布日： 2016-07-06 - 主分类号： G06F17/30 文献下载
摘要：本发明公开了一种水稻核心种质智能管理系统和方法，实本发明公布了一种水稻核心种质智能管理系统和方法。方便、快速完成了对水稻核心种质采样的一系列处理过程。本发明的水稻核心种质智能管理系统和方法，包括：数据库管理、数据转换、信息查询与分析、核心种质取样和结果统计分析。本发明构建种质相关知识库，核心种质取样使用混合性状的k‑均值聚类算法进行取样，本发明构建的核心种质能代表原始资源群体的遗传多样性，能广泛的适用于核心种质取样领域。
一种水稻核心种质智能管理系统方法

[发明专利]一种利用形态学性状构建亚洲百合核心种质的方法及应用-CN202211699468.5在审
发明人：王桢;张永春;杨柳燕;李心 -专利权人：上海市农业科学院
申请日： 2022-12-28 - 公布日： 2023-04-04 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种利用形态学性状构建百合核心种质的方法及应用，涉及种质鉴别技术领域。包括以下步骤：选取百合种质样本；根据花形态将样本分为若干组；采用分组随机抽样，基于多种总体取样规模和不同的组内取样比例方法，构建百合备选核心种质集合；进行核心种质代表性检验；筛选最优总体取样规模和最优组内取样比例方法；比较不同种组内取样方式的构建效果；确定最优组内取样方式；获得最优取样核心种质，并将其与原始种质进行比较，根据表型保留比例，利用人工定向添加的方式补充和完善，获得百合核心种质。本发明构建的核心种质完全符合标准，富有代表性。
一种利用形态学性状构建亚洲百合核心种质方法应用

[发明专利]一种提高作物核心种质取样比例精确度的方法-CN201210341186.8无效
发明人：胡晋;王建成;关亚静 -专利权人：浙江大学
申请日： 2012-09-16 - 公布日： 2013-02-06 - 主分类号： G06F19/24 文献下载
摘要：本发明提供一种提高作物核心种质取样比例精确度的方法，包括：设置取样比例的精确度和核心种质的预期代表性；从初始取样比例开始模拟构建核心种质，计算核心种质代表性评价参数；取样比例按设置的精确度依次累加至设定的最大取样比例，每次均构建核心种质和计算相应的代表性评价参数；将所有代表性评价参数排列成数列，采用最小二乘法进行曲线拟合，获得函数公式；根据核心种质需要达到的代表性标准，将代表性评价参数的值带入公式中求得需要的取样比例本发明与现有技术相比具有以下优点：基于计算机模拟和曲线拟合，能够得到任意代表性的核心种质取样比例，避免了盲目性的同时大大提高了精确度，也避免种质资源动态变化对核心种质的影响。
一种提高作物核心种质取样比例精确度方法

[发明专利]一种利用EST-SSR分子标记构建苎麻核心种质的方法-CN201310636792.7有效
发明人：栾明宝;陈建华;王晓飞;许英;孙志民;邹自征 -专利权人：中国农业科学院麻类研究所
申请日： 2013-12-02 - 公布日： 2014-03-19 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明公开了一种利用EST-SSR分子标记构建苎麻核心种质的方法。首先提取苎麻种质资源的DNA，然后通过EST-SSR引物进行PCR扩增，根据扩增条带记录每份种质资源的带型。对获得的带型进行分析，利用启发式搜索和种质资源DNA扩增带型最大化原则构建苎麻核心种质。本发明方法中，EST-SSR引物形成和实验操作过程简单，易操作，扩增带型清晰稳定，重复性好。基于分子标记构建苎麻核心种质，相对于田间性状构建核心种质，具有省时省力、稳定性好等特点。基于分子标记构建的核心种质，保证了DNA扩增带型种类的最大化，有很好的代表性，对苎麻种质的保存、评价、利用均具有重要意义。
一种利用 est ssr 分子标记构建苎麻核心种质方法

[发明专利]一种植物核心种质的抽样新策略-CN202110167846.4在审
发明人：何祯祥;张良波;王明怀;黄金华;叶代全;练芳松;陈勇 -专利权人：南京大学（苏州）高新技术研究院
申请日： 2021-02-02 - 公布日： 2022-08-02 - 主分类号： G16B40/00 文献下载
摘要：本发明涉及一种以分子标记为手段的植物核心种质的抽样新策略，属于生命科学领域。包括：(1)确定全部种质资源特有多态位点的种类；(2)找出含有特有多态位点的个体并计算拥有多态位点的频率；(3)根据核心种质的数量来确定候选者；(4)依据候选者在群体结构分析软件中的分类以及亲缘关系聚类图去除冗余个体依据种质资源种群遗传结构分类结果、亲缘关系聚类结果和特有多态位点及其比例为取样策略获得核心种质样本。本发明提供的以分子标记为手段的植物核心种质的抽样新策略比目前国内外大多使用的随机抽样方法更科学、种质资源的遗传多样性能够最大化的得到保存并且冗余最低，本发明设计科学、简单、快捷，适合应用于各种植物核心种质资源的保存，对其他物种的核心种质资源保存亦有重要的参考价值。
一种植物核心种质抽样新策略

[发明专利]一种坛紫菜核心种质库的构建方法-CN201610655114.9在审
发明人：谢潮添;陈昌生;徐燕;纪德华 -专利权人：集美大学
申请日： 2016-08-11 - 公布日： 2016-12-14 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：一种坛紫菜核心种质库的构建方法，涉及坛紫菜。包括以下步骤：1)坛紫菜种质的收集和纯化；2)提取坛紫菜各种质品系基因组DNA；3)基于SSR分子标记的坛紫菜种质品系遗传多样性分析；4)计算各种质品系间遗传相似性系数；5)逐步聚类取样构建核心种质库。得到的核心种质库能以最少的样品数量最大程度地保存原种质的遗传多样性，从而简化后续坛紫菜杂交育种时进行亲本组配的环节，提高育种效率和育种成效。
一种紫菜核心种质构建方法

[发明专利]利用形态标构建狗牙根核心种质的方法和装置-CN201710769189.4有效
发明人：黄春琼;刘国道;白昌军 -专利权人：中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所
申请日： 2017-08-31 - 公布日： 2020-10-13 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种利用形态标记构建狗牙根核心种质的方法和装置，所述方法包括：本发明实施例狗牙根原始种质为试验材料，通过形态标记测定11个形态性状，从7种总体取样比例、3种取样方法、5种聚类方法、3种遗传距离和3种组内取样比例的5个层次筛选构建狗牙根核心种质的最佳策略，从而构建核心种质。采用本发明实施例，所构建成的狗牙根核心种质能够有效地保留原始种质的表型遗传多样性、表型性状相关性和群体表型遗传结构，可以作为整体资源的代表性样本。
利用形态构建牙根核心种质方法装置

[发明专利]一种利用SCoT分子标记构建狗牙根核心种质的引物及方法-CN202010694582.3在审
发明人：黄春琼;龙萄;杨虎彪;刘攀道;刘国道;王文强 -专利权人：中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所
申请日： 2020-07-17 - 公布日： 2020-10-16 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明公开了一种利用SCoT分子标记构建狗牙根核心种质的引物及方法，所述引物序列如SEQ ID NO：1～19所示，所述的引物在构建狗牙根核心种质中的应用。本发明公开的19条引物条带清晰、多态性高、重复性好，狗牙根SCoT扩增结果显示具有丰富的遗传多样性，适合构建核心种质；本发明公开的狗牙根SCoTCore总体上保持了原始种群的遗传结构，而且有效地去除了冗余材料，是一个合格的核心种质，对原始种质具有代表。
一种利用 scot 分子标记构建牙根核心种质引物方法

[发明专利]一种基于基因组学构建烟草核心种质的方法及其应用-CN202011283769.0在审
发明人：刘国祥;李洋洋;冯全福;张兴伟;杨佳蒴;李尊强;佟英;周志成;胡日生;杨爱国;戴培刚;向世鹏;李媛 -专利权人：中国农业科学院烟草研究所;中国烟草中南农业试验站
申请日： 2020-11-17 - 公布日： 2021-02-12 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于基因组学构建烟草核心种质的方法及其应用，属于分子生物学、基因组学、种质资源学技术领域。本发明对烟草种质资源群体进行简化基因组测序，采用测序数据质量控制、SNP检测筛选、群体分层分析，并进一步通过IBS和K‑means分析，将整个种质资源大群体分成200个子群，在子群中随机挑选结合背景筛选，构建得到能够代表整个烟草种质资源大群体的核心种质。本发明所述方法能够提高核心种质构建效率，并很好的保留原始群体的遗传结构，对提高种质资源利用效率有重要意义。
一种基于基因组构建烟草核心种质方法及其应用

[发明专利]一种野生烟草SSR指纹图谱及其构建方法和应用-CN201510227440.5有效
发明人：张兴伟;邢丽敏;杨爱国;任民;蒋彩虹;王志德;冯全福;苏建东;杨举田;宗浩 -专利权人：中国农业科学院烟草研究所
申请日： 2015-05-06 - 公布日： 2018-04-24 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：一种野生烟草SSR指纹图谱及其构建方法和应用，包括选取多种核心野生烟草种质；提取核心野生烟草种质的DNA；用烟草核心引物进行核心野生烟草种质DNA的PCR扩增；电泳检测并根据检测结果确定理想引物组合构建指纹图谱其次，从54对烟草核心引物中筛选出了3对适用于野生烟草的特异性强、分辨率高、重复性好的SSR引物，并用这些引物构建了一种适用于野生烟草种质鉴定SSR指纹图谱。仅用3对SSR引物便可完全区分30份核心野生烟草种质，在时间上提高了试验效率，经济上节约了测试成本，与传统检测方法相比，具有快速、准确、经济等优势。
一种野生烟草 ssr 指纹图谱及其构建方法应用

[发明专利]利用微卫星DNA分子标记技术构建杨树核心种质的方法及试剂盒-CN201310298854.8无效
发明人：张德强;杜庆章;巩琛锐 -专利权人：北京林业大学
申请日： 2013-07-16 - 公布日： 2015-01-21 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明公开了一种利用微卫星DNA分子标记技术构建杨树核心种质的方法及试剂盒。该方法包括以下步骤：S1，收集毛白杨种质资源；S2，提取步骤S1中毛白杨的基因组DNA；S3，PCR扩增在毛白杨全基因组区域开发的多态性微卫星DNA标记；S4，利用UPGMA-聚类分析逐次随机取样及STRUCTURE模型重检测联合分析法构建8%～30%不等规模的候选核心种质群体；S5，通过比较候选核心种质群体与原群体在分子遗传多样性及数量性状变异水平上的差异，确定15%的核心种质群体。一方面可以较好的反映该物种表型性状多样性，避免遗漏珍贵的种质资源，另一方面，能够为后期开展分子标记定向选择育种提供较好的种质资源材料。
利用卫星 dna 分子标记技术构建杨树核心种质方法试剂盒

[发明专利]利用EST-SSR分子标记构建荔枝核心种质的方法-CN201110001827.0无效
发明人：向旭;欧良喜;孙清明;袁沛元;邱燕萍;陈洁珍;李志强;蔡长河 -专利权人：广东省农业科学院果树研究所
申请日： 2011-01-06 - 公布日： 2011-09-07 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本发明公开了荔枝核心种质的构建方法，包括以下步骤：选取荔枝的嫩叶，按品种提取其基因组DNA，得到荔枝的基因组DNA样品；根据荔枝的EST序列，搜索荔枝的EST-SSR，设计EST-SSR引物；使用EST-SSR引物进行PCR，扩增基因组DNA；对PCR产物进行电泳分析，得到其等位基因的存在数据；对获得的数据进行分析处理，构建核心种质。本发明方法EST-SSR标记的引物形成和实验操作过程简单，易操作，扩增谱带清晰，结果稳定，适合于分析荔枝资源之间的遗传多样性，在此基础上构建的核心种质几乎代表了原种质全部的遗传多样性，有很好的代表性，对荔枝种质管理、新种质收集及种质繁殖更新具有现实意义，更重要的是促进了荔枝种质资源利用的深入，从而提高荔枝种质资源的利用效率。
利用 est ssr 分子标记构建荔枝核心种质方法

[发明专利]一种提高植物遗传资源核心种质代表性的取样方法-CN201210290569.7无效
发明人：胡晋;王建成;关亚静;朱岩芳;祝水金 -专利权人：浙江大学
申请日： 2012-08-15 - 公布日： 2013-01-23 - 主分类号： G06F19/24 文献下载
摘要：本发明提供一种提高植物遗传资源核心种质代表性的取样方法，包括：搜集遗传资源样品的不同性状数据，确定核心种质取样比例；将全部样品数据进行标准化；计算各个样品间的遗传距离；将全部遗传距离按从大到小的顺序进行排序对剩下的全部样品重新计算各个样品间的遗传距离；将遗传距离按从大到小顺序进行排序，找出其中最小的遗传距离；按照前述方法删减样品；将上述步骤反复进行，群体规模不断缩小，直至达到确定的取样比例规模，剩下的样品构成了核心种质本发明保证核心样品的遗传多样性和核心种质的代表性。
一种提高植物遗传资源核心种质代表性取样方法

[发明专利]一种构建芜菁初级核心种质的多态性SSR引物及方法-CN202011520003.X在审
发明人：余小林;李荣荣;高莹莹;章艺;于淑博;刘楷文;赵坤;宋建伟 -专利权人：浙江大学;无锡迪茉得生物种业科技有限公司
申请日： 2020-12-21 - 公布日： 2021-03-05 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明提出了一种构建芜菁初级核心种质的多态性SSR引物及方法，所述多态性SSR引物包含31对引物，所述引物的序列为SEQ ID No.1～SEQ ID No.62。本发明利用31对多态性SSR引物，对芜菁材料进行扩增，确定遗传相似系数矩阵，将遗传相似系数矩阵通过NTSYS 2.10e及PowerMarker V3.25软件进行聚类分析；采用欧式距离计算聚类分析的原始种质群体的遗传距离，选取芜菁材料的初级核心种质。本发明的芜菁初级核心种质的构建能够排除遗传冗余，使得累积贡献率明显提高。
一种构建芜菁初级核心种质多态性 ssr 引物方法

[发明专利]一种利用SSR标记构建狗牙根核心种质的方法-CN201910883345.9在审
发明人：黄春琼;龙萄;王文强;张瑜;刘国道 -专利权人：中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所
申请日： 2019-09-18 - 公布日： 2019-12-24 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明公开了一种利用SSR标记构建狗牙根核心种质的方法，属于植物种质资源评价技术领域。)在原始群体狗牙根样本分组的情况下，基于SSR分子标记数据，采用多次聚类优先取样法取样，总体取样比例20％，组内取样比例为平方根比例，遗传距离用Nei&Li遗传距离，聚类方法用重心法构建狗牙根核心种质采用本发明所构建成的狗牙根核心种质能够有效地保留原始种质的遗传结构，而且有效去除了冗余材料，可以作为整体资源的代表性样本。
狗牙根核心种质取样遗传距离原始群体构建聚类样本植物种质资源样本基因组遗传结构整体资源平方根取样法有效地重心法冗余种质分组保留

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