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[发明专利]一种石油分子层次分离过程模拟的方法及其装置-CN201810077071.X有效
发明人：张霖宙;李凯宇;史权;赵锁奇 -专利权人：中国石油大学(北京)
申请日： 2018-01-26 - 公布日： 2019-08-02 - 主分类号： G01N25/08 文献下载
摘要：本发明提供了一种石油分子层次分离过程模拟的方法及其装置，该方法包括：(1)制定包含石油样品全馏分段分子的分子库，并预测分子库中分子的性质；(2)对分子库中分子的含量进行计算和优化，建立起可代表石油样品分子组成的组成模型；(3)依据组成石油样品的分子在分离过程中的性质，将组成模型中石油样品的分子组成划分为若干虚拟组分；并保存相互转化的映射规则；(4)依据虚拟组分的分子组成，计算虚拟组分的性质；并将各虚拟组分作为纯组分进行热力学计算；(5)通过倒推所述映射规则，得到分离过程中分离产物的分子组成。本发明提供的方案可以提供石油样品及其馏分的分子层次信息，在流程模拟计算中描述的是分子真实的行为。
石油样品分子组成分子库虚拟层次分离分离过程过程模拟映射规则热力学计算层次信息分离产物流程模拟石油分段保存预测转化优化制定

[发明专利]一种自动化的小分子药物筛选方法和计算设备-CN202010967994.X在审
发明人：马松龄;徐贺;马文志;段新丽;赖力鹏;温书豪;马健 -专利权人：北京晶派科技有限公司
申请日： 2020-09-15 - 公布日： 2021-01-08 - 主分类号： G16C20/50 文献下载
摘要：本发明公开了一种自动化的小分子药物筛选方法，在计算设备中执行，包括步骤：采集针对目标靶点的多个分子的结构数据和活性数据，并构建针对该目标靶点的第一候选分子库；生成每个结构数据所对应的矢量特征，并以该矢量特征为样本输入，以活性值为样本输出，以对应的活性数据为样本标签，训练第一预测模型；分别将第一候选分子库中的各分子输入到第一预测模型，并从中选取输出的活性值靠前的多个分子构成第二候选分子库。
一种自动化分子药物筛选方法计算设备

[发明专利]基于环形模板的DNA编码分子库及其合成方法和应用-CN201811250352.7在审
发明人：周海鹏;熊峰;李笑宇 -专利权人：深圳劲宇生物科技有限公司
申请日： 2018-10-25 - 公布日： 2019-02-15 - 主分类号： C40B40/08 文献下载
摘要：本发明涉及DNA编码分子库技术领域，具体提供一种基于环形模板的DNA编码分子库及其合成方法和应用。结构单元的B链；含有n3序列和R₃结构单元的C链；含有n4序列和R₄结构单元的D链；将分支环形模板A链与B链、C链、D链混合，合成环形DNA编码分子库本发明首次实现带有分支的环形模板的设计与合成，且首次运用该模板来控制4个结构基团发生化学反应，实现一步或者分步4元结构单元DNA编码分子库的合成，使分子库具有丰富的多样性，为DNA编码分子库的药物筛选提供更便利的可行性
分子库环形模板合成化学反应合成环形结构基团药物筛选应用多样性便利

[发明专利]可调用多种成像算法的在体荧光分子成像建模方法-CN200810105140.X有效
发明人：白净;徐迪;陈颀潇;汪待发 -专利权人：清华大学
申请日： 2008-04-25 - 公布日： 2008-09-24 - 主分类号： A61B5/00 文献下载
摘要：可调用多种成像算法的在体荧光分子成像建模方法属于荧光分子成像技术领域，其特征在于，该方法是通过计算机控制荧光分子成像仪来实现的，在该计算机中设有微软主控制界面程序；硬件控制程序包；软件库实验数据转换及算法参数交互模块，内含C语言库及MATLAB软件的动态链接库格式DLL文件；重建算法程序库，内含有限元分析软件和MATLAB软件的内核。此外，还有开源图像处理库。本发明能自动实现荧光分子成像，而且可实现荧光团密度和位置的重建算法，还能很方便地更新算法内核。
调用多种成像算法荧光分子建模方法

[发明专利]化合物分子成药性改良方法、装置、设备及存储介质-CN202111653681.8在审
发明人：林泓叡;徐旻;杨立君 -专利权人：深圳晶泰科技有限公司
申请日： 2021-12-30 - 公布日： 2022-05-17 - 主分类号： G16C20/50 文献下载
摘要：本申请涉及一种化合物分子成药性的改良方法、装置、设备及存储介质。该方法：获取先导化合物分子，按照预置切片规则对先导化合物分子进行切片，得到基于先导化合物分子对应的所有化学环境和可替换的分子片段组合，基于化学环境匹配出匹配分子对数据库中对应的取代规则，根据取代规则对分子片段进行替换，生成多个候选化合物分子，其中匹配分子对数据库包含多条取代规则，每一取代规则均是关于ADMET成药性的变化方向，按照预置规则对多个候选化合物分子进行筛选，得到多个目标化合物分子。由于匹配分子对数据库包含的取代规则是关于ADMET成药性的变化方向，因此能够模仿药化专家的设计思路，对化合物分子的成药性进行改良优化。
化合物分子成药改良方法装置设备存储介质

[发明专利]基于原油宏观性质确定其分子组成的方法-CN201610949606.9有效
发明人：何恺源 -专利权人：杭州辛孚能源科技有限公司
申请日： 2016-11-02 - 公布日： 2019-04-12 - 主分类号： G01N33/28 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于原油宏观性质确定其分子组成的方法，包括构建包含原油的宏观性质和分子组成数据的数据库、测量待定原油的宏观性质并在数据库中进行相近检索、根据相近原油的分子组成来确定待定原油的详细分子组成等步骤
分子组成宏观性质原油数据库构建检索测量

[发明专利]一种集成药物靶标预测系统的构建和预测方法-CN201210140708.8无效
发明人：杨胜勇;李国菠;李琳丽;魏于全 -专利权人：四川大学
申请日： 2012-05-09 - 公布日： 2012-09-12 - 主分类号： G06F17/50 文献下载
摘要：分析蛋白质晶体结构数据库，选取已与类药性配体小分子结合的蛋白质，或具有与小分子配体结合潜能的蛋白质作为靶点，建立靶标的晶体结构数据库，针对这些靶标，收集其与疾病的相关信息、生物学类别以及活性小分子配体信息，集成由活性位点数据库、药效团数据库、小分子化合物数据库以及靶标基本信息数据库组成的综合型靶标筛选数据库。在综合型靶标筛选数据库基础上，通过脚本程序或PipelinePilot流程实现集成药物靶标预测系统的构建，给出该方法的靶标预测准确度的概率。
一种集成药物靶标预测系统构建方法

[发明专利]一种香蕉种质资源分子鉴定的方法-CN202310588139.1在审
发明人：曾鸿运;吴元立;黄秉智 -专利权人：广东省农业科学院果树研究所
申请日： 2023-05-23 - 公布日： 2023-10-10 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明属于分子生物学技术领域，公开了一种香蕉种质资源分子鉴定的方法，具体公开了一种用于香蕉种质资源分子鉴定的数据库，所述数据库包括特征序列，所述特征序列包括GGKRKDRDNRN、GGKGGDRDNVN本发明首次公开了用于香蕉种质资源分子鉴定的数据库，该数据库是通过对香蕉样品的一代测序峰图进行分析得到的，其更加可靠、稳定、丰富和准确，实现简单、快速、更精准地判定香蕉的类别。
一种香蕉种质资源分子鉴定方法

[发明专利]一种药物靶点预测方法-CN201811554735.3有效
发明人：刘志红;张德康;林永胜;严鑫 -专利权人：广州市爱菩新医药科技有限公司
申请日： 2018-12-18 - 公布日： 2023-05-16 - 主分类号： G16C20/50 文献下载
摘要：本发明公开了一种药物靶点预测方法，S1：建立数据库，并将药物靶点与其对应的配体的数据存储在数据库中；S2：根据分子力场对步骤S1中配体的分子结构生成三维构象；S3：编辑待预测分子的化学结构；S4：根据与步骤S2对应的分子力场对步骤S3待预测分子生成三维构象；S5：将待预测分子的三维构象与数据库中的配体的分子结构的三维构象进行分析利用分子力场生成的三维构象，对待预测分子的化学结构以及数据库中的配体分子的化学结构进行多方面结合后再进行比对，从而进行靶点药物进行对应，三维构象参数对待预测分子和配体分子进行精准表征，所得预测结果准确性高
一种药物预测方法

[发明专利]一种基于es倒排索引的化学分子式检索方法-CN201811584455.7在审
发明人：杨红飞 -专利权人：杭州费尔斯通科技有限公司
申请日： 2018-12-24 - 公布日： 2019-04-26 - 主分类号： G16C20/90 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于es倒排索引的化学分子式检索方法，本发明结合大数据平台对检索过程进行重新设计，首先通过对es数据库中的分子式进行分词得到的子结构建立倒排索引，并对es数据库中的分子式计算哈希表示；检索时对分子式进行分词得到子结构，并计算哈希表示，利用倒排索引得到子结构匹配的分子式集合，再与得到的分子式集合的哈希表示一一比较，得到输入分子式与分子式集合中每个分子式之间的相似度，按照应用需要输出检索结果。本发明的比较范围为分子式集合，而不是数据库中全部的分子式，减少了比较的次数，进一步加快了分子式的检索。
倒排索引检索子结构集合哈希化学分子式数据库分词检索过程检索结果重新设计大数据相似度匹配输出应用

[发明专利]分离丙型肝炎病毒肽的方法-CN200910130605.1无效
发明人： M·比施勒;A·哈贝尔;C·克雷德;F·麦特内尔;O·奥塔瓦;O·维特维斯卡;W·扎内尔;S·津克;H·克拉普斯 -专利权人：英特塞尔股份公司
申请日： 2003-08-27 - 公布日： 2009-09-09 - 主分类号： C07K7/06 文献下载
摘要：描述了一种方法，用于分离具有结合MHC/HLA分子的能力的丙型肝炎病毒肽(HP)，或一种含有该HCV肽与该MHC/HLA分子的复合物，该方法的特征在于下列步骤：提供一个HCV肽库，该库含有可与该MHC/HLA分子结合的HCV肽和不与该MHC/HLA分子结合的HCV肽；使该MHC/HLA分子接触该HCV肽库，从而使具有结合该MHC/HLA分子的能力的HCV肽与该MHC/HLA分子结合，形成含有该HCV肽和该MHC/HLA分子的复合物；检测该复合物，任选地使其与不结合该MHC/HLA分子的HCV肽分离；任选地从该复合物中分离并表征该HCV肽。
分离肝炎病毒方法

[发明专利]分离丙型肝炎病毒肽的方法-CN03809696.X无效
发明人： M·比施勒;A·哈贝尔;C·克雷德;F·麦特内尔;O·奥塔瓦;O·维特维斯卡;W·扎内尔;S·津克;H·克拉普斯 -专利权人：英特塞尔股份公司
申请日： 2003-08-27 - 公布日： 2005-11-09 - 主分类号： G01N33/576 文献下载
摘要：描述了一种方法，用于分离具有结合MHC/HLA分子的能力的丙型肝炎病毒肽(HP)，或一种含有该HCV肽与该MHC/HLA分子的复合物，该方法的特征在于下列步骤：—提供一个HCV肽库，该库含有可与该MHC/HLA分子结合的HCV肽和不与该MHC/HLA分子结合的HCV肽，—使该MHC/HLA分子接触该HCV肽库，从而使具有结合该MHC/HLA分子的能力的HCV肽与该MHC/HLA分子结合，形成含有该HCV肽和该MHC/HLA分子的复合物，—检测该复合物，任选地使其与不结合该MHC/HLA分子的HCV肽分离，—任选地从该复合物中分离并表征该HCV肽。
分离肝炎病毒方法

[发明专利]一种快速匹配的侗医药数据库及数据检索方法-CN202310198026.0在审
发明人：王晓乔;张在其;尹辉明;郑钦方 -专利权人：湖南医药学院
申请日： 2023-03-03 - 公布日： 2023-06-06 - 主分类号： G06F16/2455 文献下载
摘要：本发明涉及用于信息检索的数据库结构技术领域，尤其涉及一种快速匹配的侗医药数据库及数据检索方法。该侗医药数据库包括：数据存储系统，存储有现有药物分子式及其作用靶点；前端数据提取系统，用于获取待检索分子式以及待检索分子式的来源侗药；后端数据提取系统，用于根据来源侗药确定待检索分子式的关联疾病，并根据关联疾病确定治疗关联疾病的作用靶点以组成检索靶点集合，从数据存储系统中筛选出具有检索靶点集合中的作用靶点的现有药物分子式组成中间数据集；数据比较系统，用于将待检索分子式与中间数据集中的现有药物分子式进行比较以获取最为接近的现有药物分子式。本发明提供的侗医药数据库及数据检索方法可以提高检索速度。
一种快速匹配医药数据库数据检索方法

[发明专利]一种利用分子杂交技术进行基于蛋白结构的药物设计方法-CN202111287508.0在审
发明人：季长鸽;王昊;潘肖林 -专利权人：华东师范大学
申请日： 2021-11-02 - 公布日： 2022-03-11 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：本发明公开了一种利用分子杂交技术进行基于蛋白结构的药物设计方法，其特点是通过构建的蛋白配体复合物扩展库和分子杂交算法进行药物设计，构建的蛋白配体复合物扩展库包含809670个复合物结构，蛋白配体复合物扩展库可以为后续的分子杂交算法提供实验数据，提高药物设计分子的合成可行性，通过分子杂交程序，找出满足的匹配键，完成分子的杂交和结合步骤，生成药物设计的新分子。
一种利用分子杂交技术进行基于蛋白结构药物设计方法

[发明专利]一种基于智能相关指数的环境毒物分子活性的预测方法-CN201811393323.6在审
发明人：沈林夏 -专利权人：合肥林夏智能科技有限公司
申请日： 2018-11-21 - 公布日： 2019-03-29 - 主分类号： G16B40/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于智能相关指数的环境毒物分子活性的预测方法，包括以下操作步骤：基于智能相关指数关联获取环境毒物数据库，收集环境毒物活性信息；根据环境毒物活性信息对应的每一毒物活性信息进行分组，即活性反应特征相似的环境毒物归为一个活性反应组；通过环境毒物活性信息对应的毒物活性率给予不同环境毒物数据库来源的毒物活性信息不同的赋分，来自不同数据库的同一活性率即为该毒物活性信息的分子活性确认数值；建立数据库，建立影响毒物分子活性的活性反应危害数据库；预测，预测环境毒物分子与环境信息影响指数可能发生的活性反应；构建机器学习预测模型；确定反应危害，即影响环境毒物分子活性的活性反应信息。
环境毒物活性信息活性反应毒物分子活性数据库预测毒物分子活性率智能建立数据库环境信息机器学习影响环境影响指数预测模型构建分组关联