本发明公开了一种生成萜类物质的双功能酶基因CaTPS3及其应用。本发明首次在姜荷花中克隆的到一种可以催化法呢基焦磷酸和成牻牛儿基焦磷酸生成萜类物质β‑法尼烯和β‑月桂烯,具有双功能酶作用的萜类合成酶基因CaTPS3;该基因编码区共1770bp,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,其氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。本发明研究显示,姜荷花基因CaTPS3在花朵中表达量较高,其表达与花发育进程有关;将CaTPS3连接植物转化载体,然后导入植物细胞,可获得表达CaTPS3基因的转基因植株,通过基因工程手段来提高姜荷花萜类花香物质的含量