[发明专利]一种基于HPV整合的肿瘤新抗原预测方法在审
申请号: | 202110696080.9 | 申请日: | 2021-06-23 |
公开(公告)号: | CN113362896A | 公开(公告)日: | 2021-09-07 |
发明(设计)人: | 万季;刘鹏;沈一鸣;潘有东;王弈 | 申请(专利权)人: | 深圳市新合生物医疗科技有限公司 |
主分类号: | G16B25/10 | 分类号: | G16B25/10;G16B30/00;C12Q1/6869 |
代理公司: | 北京冠和权律师事务所 11399 | 代理人: | 赵银萍 |
地址: | 518055 广东省深圳市南*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于HPV整合的肿瘤新抗原预测方法,属于生物信息学技术领域。该方法包括以下步骤:S01,组装肿瘤样品转录本;S02,筛选样本HPV整合转录本;S03,翻译HPV整合转录本为多肽;S04,获取多肽短序列片段,并过滤人类正常蛋白质组中多肽;S05,样品人类白细胞抗原基因分型;S06,肽段亲和力预测、新抗原筛选。本发明得到的新抗原是HPV整合的结果,与疾病进展过程密切相关。本发明得到的新抗原来自于RNA测序数据,是细胞转录的结果,有更高的概率翻译产生蛋白质。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 hpv 整合 肿瘤 抗原 预测 方法 | ||
【主权项】:
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