[发明专利]一种SNP位点序列特征提取方法在审

专利信息
申请号: 202110234830.0 申请日: 2021-03-03
公开(公告)号: CN112992268A 公开(公告)日: 2021-06-18
发明(设计)人: 宋晓宇;冯小蓓;邱泽阳;冯兰庆;吴鸿阳 申请(专利权)人: 兰州蓝鲸信息技术有限公司
主分类号: G16B20/20 分类号: G16B20/20
代理公司: 兰州锦知源专利代理事务所(普通合伙) 62204 代理人: 勾昌羽
地址: 730030 甘肃省兰州市*** 国省代码: 甘肃;62
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摘要: 一种SNP位点序列特征提取方法,将长串序列S任意分解为连续的、长度为k子序列,计算每一个子序列的出现频率,并对应记录为与k相关的特征向量x;通过变分自编码器对特征向量x的特征进行学习,得到特征向量x的隐变量向量z;解码隐变量向量z并构造损失函数;将采样到的隐变量向量z输入到变分自编码器的解码器中进行重构,生成新的特征向量达到降维。本发明提供的SNP位点序列特征提取方法,将字符串的SNP位点序列通过数值化表征,从而得到的SNP位点特征向量能够被计算机处理;然后,对得到的SNP位点特征向量,使用变分自编码器来对其进行降维,解决了数值化后的特征向量存在信息冗余和噪声问题,能够有效的提升预测精度,提高运行效率。
搜索关键词: 一种 snp 序列 特征 提取 方法
【主权项】:
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