[发明专利]一种分析靶向测序Panel估算肿瘤突变负荷可行性的方法和装置在审
申请号: | 202011635223.7 | 申请日: | 2020-12-31 |
公开(公告)号: | CN112786103A | 公开(公告)日: | 2021-05-11 |
发明(设计)人: | 张仕坚;季序我 | 申请(专利权)人: | 普瑞基准生物医药(苏州)有限公司 |
主分类号: | G16B15/30 | 分类号: | G16B15/30;G16B30/00;G16H70/40 |
代理公司: | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人: | 巩克栋 |
地址: | 215011 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明提供了一种分析靶向测序Panel估算肿瘤突变负荷(TMB)可行性的方法和装置,根据全外显子组(WES)和Panel的基因长度及突变数量,计算WES和Panel TMB;按相同的分组规则,分别根据WES及Panel TMB,将样本分为全外显子组及Panel中的不同高低等级组,并据此计算严重错误分组百分比,分析靶向测序Panel估算TMB的可行性。本发明采用多种方法定量评估WES TMB和Panel估算的TMB的一致性,包括相关性系数和严重错误分组百分比,两者的评估结论一致。本发明的特色之处在于:在按照癌种分类的基础上,进一步按性别或年龄分类,并分析性别或年龄因素对TMB一致性的影响,将临床决策进一步细化,提高决策准确率;对现有Panel进行优化及为构建新Panel提供了方法。 | ||
搜索关键词: | 一种 分析 靶向 panel 估算 肿瘤 突变 负荷 可行性 方法 装置 | ||
【主权项】:
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