[发明专利]一种筛选乳腺癌肿瘤微环境中免疫浸润相关预后基因的方法在审

专利信息
申请号: 202010628297.1 申请日: 2020-07-02
公开(公告)号: CN111883209A 公开(公告)日: 2020-11-03
发明(设计)人: 王俊;王友权;张宇;李敏;郭丽 申请(专利权)人: 南京邮电大学
主分类号: G16B25/00 分类号: G16B25/00;G16B40/20
代理公司: 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 代理人: 刘妍妍
地址: 210003 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明属于医药技术领域,具体涉及一种筛选乳腺癌肿瘤微环境中免疫浸润相关预后基因的方法,对TCGA‑BRCA数据集和经过批次校正的3个GEO转录组数据集通过estimate算法进行肿瘤免疫相关基因分析,将得到的免疫相关基因评分数据按高低评分分组,然后进行差异表达分析;将TCGA‑BRCA数据集和GEO转录组数据集得到的差异表达分析结果取交集;将两者取交集的结果结合临床数据进行单因素cox回归分析,再使用lasso回归分析,接着使用多因素cox回归分析,最后进行生存分析,得到乳腺癌免疫浸润相关预后基因。基于本方法筛选到的可信度较高的乳腺癌免疫浸润预后相关基因,可为乳腺癌的诊断和治疗提供有效信息。
搜索关键词: 一种 筛选 乳腺癌 肿瘤 环境 免疫 浸润 相关 预后 基因 方法
【主权项】:
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