[发明专利]基于细菌群落组成与丰度快速判断杏鲍菇菌种衰退的方法及其应用有效

专利信息
申请号: 202010072685.6 申请日: 2020-01-21
公开(公告)号: CN111424104B 公开(公告)日: 2022-11-04
发明(设计)人: 孙淑静;许欣;柳婷;孔旭强 申请(专利权)人: 福建农林大学
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6869;C12Q1/06;C12Q1/04;C12R1/645
代理公司: 福州元创专利商标代理有限公司 35100 代理人: 饶文君;蔡学俊
地址: 350002 福*** 国省代码: 福建;35
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摘要: 发明公开了一种基于细菌群落组成与丰度快速判断杏鲍菇菌种衰退的方法及其应用,属于食用菌技术领域。该方法包括:1)待测杏鲍菇菌株菌丝通过Illumina HiSeq 2500测序平台进行高通量测序;2)高通量测序数据过滤去杂后根据97%以上相似性进行聚类,以测序所有序列数的0.005%作为阈值过滤OTU,获得菌株菌丝的细菌组成以及菌群丰度;3)通过获得的细菌多样性指数以及菌群丰度快速判断杏鲍菇菌种是否衰退。全面了解杏鲍菇菌种的细菌组成以及结构情况,基于多样性指数以及菌群丰度判断杏鲍菇菌种是否衰退,为工厂快速判断杏鲍菇菌种是否衰退提供一种新的判断指标。
搜索关键词: 基于 细菌 群落 组成 快速 判断 杏鲍菇 菌种 衰退 方法 及其 应用
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