[发明专利]一种碱基序列的识别方法、装置和存储介质有效
| 申请号： | 202010026283.2 | 申请日： | 2020-01-08 |
| 公开（公告）号： | CN111243674B | 公开（公告）日： | 2023-07-04 |
| 发明（设计）人： | 蔡宏民;曾静文 | 申请（专利权）人： | 华南理工大学 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10;G16B40/00;G06N3/0464;G06N3/048;G06N3/047;G06N3/0455;G06N3/049;G06N3/08 |
| 代理公司： | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人： | 郭浩辉;麦小婵 |
| 地址： | 510000*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种碱基序列的识别方法，包括步骤：读取牛津纳米孔测序仪输出的数据文件并提取出待测的DNA/RNA分子对应的电流信号；将所述电流信号按预设的重叠率截取出若干个预设长度的电流信号片段；将每一所述电流信号片段输入预设的时序卷积网络模型中进行时序建模，以针对每一电流信号片段生成对应的碱基概率矩阵；其中，所述碱基概率矩阵为所述电流信号片段在每一采样时间点上出现碱基的概率分布；根据每一所述碱基概率矩阵解码出对应的碱基序列片段，并根据每一碱基序列片段生成所述碱基序列。本发明实施例还提供了碱基序列的识别装置和存储介质。采用本发明实施例，通过时序卷积网络对电流信号进行时序建模，加快了神经网络推理速度，提高了碱基序列识别的效率。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 碱基 序列 识别 方法 装置 存储 介质 | ||
【主权项】：
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