[发明专利]测序接头、测序接头组和超低频突变的检测方法有效

专利信息
申请号: 201810564438.0 申请日: 2018-06-04
公开(公告)号: CN108893466B 公开(公告)日: 2021-04-13
发明(设计)人: 杨功达;曾丰波;胡秀弟;蒋廷亚;黎小锋 申请(专利权)人: 上海奥根诊断技术有限公司
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/6869;C12Q1/6806;C12N15/10;C40B80/00;C40B50/06
代理公司: 北京三聚阳光知识产权代理有限公司 11250 代理人: 李静
地址: 201100 上海市*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明公开了一种测序接头,包括双链互补区、单链5’‑连接臂和单链3’‑连接臂,双链互补区包括随机标签序列和接头标签序列,单链区与随机标签序列直接相连,移除了传统接头中单链区与随机标签序列之间的互补序列,能最大程度上减少错配接头比例,实现原始模板的完全配对,利用正负链配对关系进行序列校正。本发明公开了一种测序接头组,包括至少两个上述的测序接头,通过设置每组测序接头组中接头标签序列的序列种类和/或随机标签序列的长度,能够区分不同样本的测序结果,排除污染数据。本发明公开了一种超低频突变的检测方法,利用上述的测序接头组,最大化校正高通量测序中的各类低频错误,高效实现血浆循环游离DNA的超低频突变检测。
搜索关键词: 接头 低频 突变 检测 方法
【主权项】:
1.一种测序接头,其特征在于,包括:双链互补区、单链5’‑连接臂和单链3’‑连接臂,所述双链互补区包括随机标签序列和接头标签序列,所述随机标签序列由随机碱基组成,所述接头标签序列为已知核苷酸序列;所述单链5’‑连接臂和所述单链3’‑连接臂连接于所述随机标签序列远离所述接头标签序列的自由端。
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