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[发明专利]一种多重扩增引物组、试剂盒及其用途-CN202310349463.8在审
发明人： 蒋廷亚;刘海涛;黄慧强;王银峰 -专利权人：上海奥根诊断技术有限公司
申请日： 2023-03-31 - 公布日： 2023-08-15 - 主分类号： C12Q1/6883 文献下载
摘要：本发明涉及生物技术领域，具体涉及一种多重扩增引物组、试剂盒及其用途。本发明提供的多重扩增引物组，所述多重扩增引物可以在PCR管中，对NLRP3基因中的甲基化位点cg21991396、甲基化位点cg26112639、甲基化位点cg21919599、SNP位点rs15498746、SNP位点rs45784165进行扩增，以及对NR3C1基因启动子区域位点的甲基化位点扩增，且多重PCR后省去了杂交捕获的这一步骤，节约时间降低了成本，简化了操作，且覆盖区域更广，进行GC耐药的风险分级精度高。
一种多重扩增引物试剂盒及其用途

[发明专利]一种检测妊娠器官移植患者供体cfDNA的SNP分子标记、检测方法及装置-CN202310096461.2在审
发明人： 蒋廷亚;刘海涛;黄慧强;王银峰 -专利权人：上海奥根诊断技术有限公司
申请日： 2023-02-07 - 公布日： 2023-06-23 - 主分类号： C12Q1/6883 文献下载
摘要：本发明涉及基因检测技术领域，具体涉及一种检测妊娠器官移植患者供体cfDNA的SNP分子标记、检测方法及装置。一种检测妊娠器官移植患者供体cfDNA的SNP分子标记，所述SNP分子标记如表10所示。本发明使用孕妇患者外周血中的游离DNA和胎儿生物学父亲外周血基因组DNA作为检测对象，采用液相杂交捕获和高通量测序技术，使用数千个SNP位点，通过夫妻双方的基因型，获得胎儿的基因型，消除胎儿来源cfDNA对移植器官来源cfDNA含量的影响，准确测定移植器官cfDNA的浓度，检测灵敏度要更高，只需患者外周血即可以进行多次检测，实现长期动态监测的目的。
一种检测妊娠器官移植患者供体 cfdna snp 分子标记方法装置

[发明专利]一种用于HLA基因分型的扩增引物组、试剂盒及方法-CN202211530754.9在审
发明人： 蒋廷亚;刘海涛;刘枫;王银锋 -专利权人：上海奥根诊断技术有限公司
申请日： 2022-12-01 - 公布日： 2023-05-30 - 主分类号： C12Q1/6881 文献下载
摘要：本发明属于基因检测领域，具体涉及一种用于HLA基因分型的扩增引物组、试剂盒及方法，提供的HLA基因扩增引物组，包括如下引物组中至少一组引物组组成的混合物：所述引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO.1‑18所示；上述HLA基因扩增引物组，可以进行单管多重PCR扩增，可以在1个PCR管中对HLA‑A、B、C、DRB1、DPB1、DQB1这6个基因同时进行扩增，通量高，降低了成本，简化了操作，且覆盖区域更广，使得后续的HLA基因分型的精确度更高，可达6位或8位。
一种用于 hla 基因扩增引物试剂盒方法

[发明专利]同时检测4种猪内源性逆转录病毒的引物和探针、试剂盒-CN202211537027.5在审
发明人： 蒋廷亚;刘海涛;王银锋;黄楚涵 -专利权人：上海奥根诊断技术有限公司
申请日： 2022-12-02 - 公布日： 2023-05-09 - 主分类号： C12Q1/70 文献下载
摘要：本发明涉及核酸检测领域，具体涉及一种同时检测4种猪内源性逆转录病毒的引物和探针、试剂盒。本发明提供的一种同时检测4种猪内源性逆转录病毒的引物和探针，本发明基于PERV‑A，PERV‑B，PERV‑C和PERV‑A/C基因组上的保守区，设计高特异性引物和探针，可在一次反应中对PERV‑A，PERV‑B，PERV‑C和PERV‑A/C进行有效检测并定量，降低了反应成本，提高了检测通量。本发明的检测方法敏感性高，最低检出可达到500copies/μL，且特异性高，不与其他病毒产生交叉反应。检测速度快，从样本采集到得出结果，可在3个小时内完成。
同时检测种猪内源逆转录病毒引物探针试剂盒

[外观设计]包装盒（医药类）-CN202130414737.9有效
发明人： 蒋廷亚;刘海涛;刘枫;牛海珊 -专利权人：上海奥根诊断技术有限公司
申请日： 2021-07-01 - 公布日： 2022-01-11 - 主分类号： 09-03 文献下载
摘要：1.本外观设计产品的名称：包装盒（医药类）。2.本外观设计产品的用途：包装试剂。3.本外观设计产品的设计要点：在于形状、图案与色彩的结合。4.最能表明设计要点的图片或照片：设计1立体图。5.请求保护的外观设计包含色彩。6.指定设计1为基本设计。
包装医药

[发明专利]一种检测异源cfDNA的多重PCR引物设计、引物组及检测方法及其用途-CN202011524753.4在审
发明人： 蒋廷亚;刘海涛;刘枫;束礼平;梁经天 -专利权人：苏州奥根诊断科技有限公司
申请日： 2020-12-22 - 公布日： 2021-06-25 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本发明公开一种检测异源cfDNA的多重PCR引物设计、引物组及检测方法及其用途包括：基于筛选的SNP位点设计多重PCR引物：使用primer3 NGS‑PrimerPlex设计时考虑成对引物间引物二聚体及发夹结构的因素，自动优化筛选获得最多可用引物对数；文库构建：通过3轮PCR扩增获得测序文库，其中，第1、2轮为特异性引物扩增，并加入接头通用序列和单分子标签(UMI)，第3轮扩增加入测序通用引物；由于接头上标记有单分子标签(UMI)和随机序列index，对于始末位点相同的测序reads，就很容易判断它们来自同一还是多个原始细胞释放出来的cfDNA，从而降低测序duplication，从而保证了对cfDNA中超低频突变的检测能力。本发明的有益效果是：本技术方案耗时短，成本低，准确率高，检测灵敏度高。
一种检测 cfdna 多重 pcr 引物设计方法及其用途

[发明专利]测序接头、测序接头组和超低频突变的检测方法-CN201810564438.0有效
发明人：杨功达;曾丰波;胡秀弟;蒋廷亚;黎小锋 -专利权人：上海奥根诊断技术有限公司
申请日： 2018-06-04 - 公布日： 2021-04-13 - 主分类号： C12N15/11 文献下载
摘要：本发明公开了一种测序接头，包括双链互补区、单链5’‑连接臂和单链3’‑连接臂，双链互补区包括随机标签序列和接头标签序列，单链区与随机标签序列直接相连，移除了传统接头中单链区与随机标签序列之间的互补序列，能最大程度上减少错配接头比例，实现原始模板的完全配对，利用正负链配对关系进行序列校正。本发明公开了一种测序接头组，包括至少两个上述的测序接头，通过设置每组测序接头组中接头标签序列的序列种类和/或随机标签序列的长度，能够区分不同样本的测序结果，排除污染数据。本发明公开了一种超低频突变的检测方法，利用上述的测序接头组，最大化校正高通量测序中的各类低频错误，高效实现血浆循环游离DNA的超低频突变检测。
接头低频突变检测方法

[发明专利]一种尿液保存液及其用途-CN202010670376.9在审
发明人： 蒋廷亚;刘海涛;刘枫;梁经天;牛海珊 -专利权人：上海奥根诊断技术有限公司
申请日： 2020-07-13 - 公布日： 2020-11-03 - 主分类号： A01N1/02 文献下载
摘要：本发明提供的一种尿液保存液，包括：pH缓冲剂6‑10mmol/L、DNA酶抑制剂0.2‑0.4mol/L、防腐剂0.1‑0.3mol/L、细胞固定剂质量分数5％‑15％和甲醛淬灭剂0.3‑1.0mol/L；上述尿液保存液中，避免了各组分之间相互干扰影响各组分的功能，在4℃‑40℃之间仍旧具有各自相应的保护作用，且对尿液中核酸没有直接影响，因此，保存液可在4℃‑40℃下仍然能维持尿液不变质，保证cfDNA的相对含量。
一种尿液保存及其用途

[发明专利]检测异源cfDNA的SNP分子标记及检测方法、用途-CN201710334862.1有效
发明人：杨功达;蒋廷亚;曾丰波;胡秀弟;黎小锋;陈雅文;刘磊;周阳 -专利权人：上海奥根诊断技术有限公司
申请日： 2017-05-12 - 公布日： 2020-03-17 - 主分类号： C12Q1/6883 文献下载
摘要：本发明公开了一种检测异源cfDNA的SNP分子标记，基于SNP分子标记设计的检测探针和芯片，以及异源cfDNA的检测装置、试剂盒和检测方法；利用上述检测芯片和检测装置对肾移植后受体中异源cfDNA的定量，为检测肾移植排斥反应提供依据，实现了针对肾移植的高灵敏度和高特异性的无创早期检测，并可对肾移植患者进行持续性的监测；SNP分子标记中包括药物代谢基因的SNP位点，为肾移植排斥患者提供用药基因的突变信息，实现个体化用药；本发明还提供了一种单分子标记接头，单分子标记接头用于构建测序文库有效去除重复数据和测序、PCR过程中随机引入的错误，降低测序背景噪音，提高了检测的准确性。
检测 cfdna snp 分子标记方法用途

[发明专利]一种cfDNA中超低频突变的检测方法-CN201610599150.8有效
发明人：郑文莉;孔祥生;蒋廷亚;黎小锋 -专利权人：上海奥根诊断技术有限公司
申请日： 2016-07-27 - 公布日： 2020-03-17 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：一种cfDNA中超低频突变的检测方法，其步骤包括文库构建、桥式PCR和测序，文库构建包括末端补平、加A、加接头、PCR扩增，在加接头时，使用1:1的颈环接头和Y字型接头。本发明颈环接头和Y字型接头结合使用，由于Y字型接头上标记有随机序列index，基因组坐标始末位点相同的DNA片段加上完全相同的Y字型接头的概率极低，那么对于始末位点相同的测序reads，就很容易判断它们来自同一还是多个原始细胞释放出来的cfDNA，从而降低测序duplication。同时颈环接头将DNA片段的正负链连成一条链，二者的测序reads自然配对，提高了对假阳性的分辨率，从而保证了对cfDNA中超低频突变的检测能力。
一种 cfdna 低频突变检测方法

[发明专利]用于检测ddcfDNA的产品在制备检测肺部感染引起的移植肾损伤和预后中的用途-CN201910587416.0在审
发明人： 蒋廷亚;刘海涛;葛军;刘枫;王啸晨;黎小锋 -专利权人：上海奥根诊断技术有限公司
申请日： 2019-06-28 - 公布日： 2019-11-15 - 主分类号： C12Q1/6883 文献下载
摘要：本发明提供了一种用于检测ddcfDNA的产品在制备检测肺部感染引起的移植肾损伤和预后的产品中的用途，用于检测肺部感染引起的移植肾损伤和预后效果评估的产品，以及检测肺部感染对移植肾损伤和预后效果评估的方法，所述的用于检测ddcfDNA的产品可以检测肾移植受者血浆中供体游离cfDNA(ddcfDNA)的水平，根据供体游离cfDNA(ddcfDNA)的水平诊断肺部感染对移植肾功能损伤和预后效果评估，能够实现对器官移植受者术后的肺部感染对移植肾损伤和预后早期诊断，具有快速、准确、灵敏度高的优势，且检测方法无创，极大减少患者痛苦。
肺部感染检测肾损伤预后效果移植预后供体评估游离移植肾功能早期诊断器官移植灵敏度肾移植术后无创血浆制备损伤诊断痛苦

[发明专利]用于检测ddcfDNA的产品在制备检测BKVAN产品中的用途及方法-CN201910541022.1在审
发明人： 蒋廷亚;刘海涛;葛军;刘枫;王啸晨;黎小锋 -专利权人：上海奥根诊断技术有限公司
申请日： 2019-06-20 - 公布日： 2019-11-01 - 主分类号： C12Q1/70 文献下载
摘要：本发明属于医学检测技术领域，提供了一种用于检测ddcfDNA的产品在制备检测BKVAN的产品中的用途，用于检测BKNAN的产品，以及检测BKVAN的方法，所述的用于检测ddcfDNA的产品可以检测器官移植受者如肾脏移植受者尿液中供体游离cfDNA(ddcfDNA)的水平，根据供体游离cfDNA(ddcfDNA)的水平诊断器官移植受者是否为BKVAN或BKVAN发病高风险患者，能够实现对器官移植受者术后的BKVAN早期诊断，具有快速、准确、灵敏度高的优势，且检测方法无创，极大减少患者痛苦。
检测器官移植供体制备游离肾脏移植医学检测早期诊断灵敏度尿液术后无创诊断痛苦

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