[发明专利]一种转录组数据的表达定量方法及系统有效
申请号: | 201810551976.6 | 申请日: | 2018-05-31 |
公开(公告)号: | CN108715891B | 公开(公告)日: | 2021-09-24 |
发明(设计)人: | 何玮毅;詹东亮;尤民生 | 申请(专利权)人: | 福建农林大学 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;G16B30/10;G16B40/30 |
代理公司: | 北京知呱呱知识产权代理有限公司 11577 | 代理人: | 李芙蓉;冯建基 |
地址: | 350002 福建省福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | 本发明公开了一种转录组数据的表达定量方法及系统,该转录组数据的表达定量方法包括:将转录组样品进行测序,获得数据,以及将数据比对上参考基因组,获得比对结果;处理比对结果,得到单碱基的测序深度;根据单碱基的测序深度和外显子长度计算外显子平均测序深度;根据外显子平均测序深度进行聚类,确定内参基因;根据外显子平均测序深度和内参基因的外显子平均测序深度,将转录组数据进行归一化定量。 | ||
搜索关键词: | 一种 转录 数据 表达 定量 方法 系统 | ||
【主权项】:
1.一种转录组数据的表达定量方法,其特征在于,所述方法,包括:将转录组样品进行测序,获得数据,以及将所述数据比对上参考基因组,获得比对结果;处理所述比对结果,得到单碱基的测序深度;根据所述单碱基的测序深度和外显子长度计算外显子平均测序深度;根据所述外显子平均测序深度进行聚类,确定内参基因;根据外显子平均测序深度和内参基因的外显子平均测序深度,将转录组数据进行归一化定量。
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