[发明专利]一种转录组数据的表达定量方法及系统有效

专利信息
申请号: 201810551976.6 申请日: 2018-05-31
公开(公告)号: CN108715891B 公开(公告)日: 2021-09-24
发明(设计)人: 何玮毅;詹东亮;尤民生 申请(专利权)人: 福建农林大学
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869;G16B30/10;G16B40/30
代理公司: 北京知呱呱知识产权代理有限公司 11577 代理人: 李芙蓉;冯建基
地址: 350002 福建省福*** 国省代码: 福建;35
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摘要: 发明公开了一种转录组数据的表达定量方法及系统,该转录组数据的表达定量方法包括:将转录组样品进行测序,获得数据,以及将数据比对上参考基因组,获得比对结果;处理比对结果,得到单碱基的测序深度;根据单碱基的测序深度和外显子长度计算外显子平均测序深度;根据外显子平均测序深度进行聚类,确定内参基因;根据外显子平均测序深度和内参基因的外显子平均测序深度,将转录组数据进行归一化定量。
搜索关键词: 一种 转录 数据 表达 定量 方法 系统
【主权项】:
1.一种转录组数据的表达定量方法,其特征在于,所述方法,包括:将转录组样品进行测序,获得数据,以及将所述数据比对上参考基因组,获得比对结果;处理所述比对结果,得到单碱基的测序深度;根据所述单碱基的测序深度和外显子长度计算外显子平均测序深度;根据所述外显子平均测序深度进行聚类,确定内参基因;根据外显子平均测序深度和内参基因的外显子平均测序深度,将转录组数据进行归一化定量。
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