[发明专利]一种肺癌EGFR L858R位点的ddPCR检测方法及应用在审
| 申请号： | 201711231164.5 | 申请日： | 2017-11-29 |
| 公开（公告）号： | CN109762878A | 公开（公告）日： | 2019-05-17 |
| 发明（设计）人： | 陈苗苗;黄昕;江萤;童慧娟 | 申请（专利权）人： | 铭时基因科技（上海）有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6858 | 分类号： | C12Q1/6858;C12Q1/6886 |
| 代理公司： | 上海申新律师事务所 31272 | 代理人： | 郭春远 |
| 地址： | 200438 上海市杨*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 一种肺癌EGFR L858R位点的ddPCR检测方法及应用，根据EGFR基因序列，设计一对包括上游引物和下游引物的扩增引物，根据L858R(2573T>G,COSM6224)突变序列，设计检测野生型序列的探针和检测突变型序列的探针，采用上述引物和探针进行ddPCR，针对ctDNA中的肺癌靶向用药相关的重要位点进行检测分析，首先对肺癌患者外周血浆进行DNA抽提，再利用ddPCR技术检测其中EGFR突变位点L858R的突变情况，并以此指导患者用药。可用于肿瘤的Ⅰ期、Ⅱ期、ⅢA期等早期肺癌诊断,可检测0.0625％EGFR基因L858R突变，灵敏度可达到常规方法的10倍以上。 | ||
| 搜索关键词： | 肺癌 探针 位点 检测 突变 突变型序列 野生型序列 靶向用药 肺癌诊断 患者用药 技术检测 检测分析 扩增引物 上游引物 突变位点 突变序列 下游引物 可检测 灵敏度 再利用 可用 外周 引物 血浆 应用 肿瘤 | ||
【主权项】：
1.一种肺癌EGFR L858R位点的ddPCR检测方法及应用，其特征在于，根据EGFR基因序列，设计一对包括上游引物和下游引物的扩增引物，根据L858R(2573T>G,COSM6224)突变序列，设计检测野生型序列的探针和检测突变型序列的探针，进一步的，采用上述引物和探针进行ddPCR，并优化出低频突变检出的最佳条件；应用该方法进行病人组织、血液等样本的检测；针对ctDNA中的肺癌靶向用药相关的重要位点进行检测分析，首先对肺癌患者外周血浆进行DNA抽提，再利用ddPCR技术检测其中EGFR突变位点L858R的突变情况，并以此指导患者用药。
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