[发明专利]一种检测肉牛KLF8基因CNV标记的方法及其应用

摘要

本发明公开了一种检测肉牛KLF8基因CNV标记的方法及其应用：以肉牛品种郏县牛的血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR方法分别扩增其KLF8基因CNV区域和内参基因BTF3，根据2*log2 2‑ΔΔCt将结果分为插入型、缺失型和正常型，鉴定其KLF8基因的拷贝数变异。与郏县牛生产数据的关联分析显示，KLF8不同拷贝数对郏县牛的生长发育有显著影响，其中缺失型个体的胸宽显著高于插入型和正常型个体。本发明在DNA水平上检测与肉牛生产性状密切相关的CNV，可作为肉牛生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记，快速建立遗传资源优良的肉牛种群。

主权项

一种检测郏县牛KLF8基因CNV标记的方法，其特征在于：包括以下步骤：以郏县牛基因组DNA为模板，以引物对P1以及引物对P2为引物，分别通过QPCR扩增KLF8基因的CNV区域以及作为内参的BTF3基因的部分片段，然后根据定量结果鉴定郏县牛KLF8基因的拷贝数变异类型；所述的引物对P1为：上游引物F1：5’‑TCTTTGTGTGAATGCTGCC‑3’下游引物R1：5’‑CCATAACTCTGCTGCTCAC‑3’；所述的引物对P2为：上游引物F2：5’‑AACCAGGAGAAACTCGCCAA‑3’下游引物R2：5’‑TTCGGTGAAATGCCCTCTCG‑3’。