[发明专利]一种检测待测样品中微生物的种类和相对含量的方法及其专用引物组合有效

专利信息
申请号: 201710947218.1 申请日: 2017-10-12
公开(公告)号: CN109652567B 公开(公告)日: 2022-05-10
发明(设计)人: 王丽丽;赵明玉;石振奋;赵孟;石太平;宋金良;刘如银 申请(专利权)人: 北京乐土医学检验实验室有限公司
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12Q1/06;C12N15/11
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 关畅
地址: 102206 北京市昌平区回龙观镇中*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明公开了一种检测待测样品中微生物的种类和相对含量的方法及其专用引物组合。实验证明,采用本发明提供的方法可以检测待测样品中微生物种类和/或每一种微生物的相对含量,待测样品可为‑20℃保存的人粪便样品或常温保存1‑7d的人粪便样品。本发明的提供的方法具有方便、快速、准确、成本低的特点,尤其是可以同时检测多个待测样品(理论上为4608个)。本发明具有重大的应用价值。
搜索关键词: 一种 检测 样品 微生物 种类 相对 含量 方法 及其 专用 引物 组合
【主权项】:
1.引物组合,包括引物组和引物对X;所述引物组包括引物对V3和/或引物对V4和/或引物对V6;所述引物对V3由引物V3‑FX和引物V3‑RX组成;所述引物对V4由引物V4‑FX和引物V4‑RX组成;所述引物对V6由引物V6‑FX和引物V6‑RX组成;所述引物对X由引物X‑FX和引物X‑RX组成;所述引物V3‑FX自5’端到3’端依次包括如下两个区段:甲区段和V3‑F区段;所述引物V3‑RX自5’端到3’端依次包括如下两个区段:乙区段和V3‑R区段;所述V3‑F区段和所述V3‑R区段特异靶向细菌16S rDNA中的V3区域;所述引物V4‑FX自5’端到3’端依次包括如下两个区段:所述甲区段和V4‑F区段;所述引物V4‑RX自5’端到3’端依次包括如下两个区段:所述乙区段和V4‑R区段;所述V4‑F区段和所述V4‑R区段特异靶向细菌16S rDNA中的V4区域;所述引物V6‑FX自5’端到3’端依次包括如下两个区段:所述甲区段和V6‑F区段;所述引物V6‑RX自5’端到3’端依次包括如下两个区段:所述乙区段和V6‑R区段;所述V6‑F区段和所述V6‑R区段特异靶向细菌16S rDNA中的V6区域;所述引物X‑FX依次包括如下两个区段:Adapter区段和read1区段;所述引物X‑RX依次包括如下两个区段:Adapter区段和read2区段;所述read1区段中3’末端的15‑20个核苷酸与所述区段甲一致;所述read2区段中3’末端的15‑20个核苷酸与所述区段乙一致;所述引物X‑FX中的Adapter区段和所述引物X‑RX中的Adapter区段,核苷酸序列不同。
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