[发明专利]一种快速检测ALK基因断裂的探针组、试剂盒及方法

摘要

本发明公开了一种使用荧光原位杂交技术快速检测ALK基因断裂的方法，其特征在于每个靶位点的检测需要三种探针，分别为接触探针、扩增探针和荧光探针。其中接触探针的5’端特异性地与ALK基因断裂位点两端结合，3’端有20组20碱基的重复序列，可以特异性地与扩增探针相结合；扩增探针的5’端特异性地与接触探针的3’端结合，3’端有20组20碱基的重复序列，可以特异性地与荧光探针结合；荧光探针的5’末端带有CY3或FITC标记，通过这三种探针的协同作用，将荧光信号放大400倍，实现ALK基因断裂快速、灵敏的检测。本发明还公开了一种快速检测ALK基因断裂的试剂盒及探针组。

主权项

一种快速检测ALK基因断裂的探针组，其特征在于，由接触探针、扩增探针和荧光探针三种探针组成，所述接触探针包括接触探针1和接触探针2，所述扩增探针包括扩增探针1和扩增探针2，所述荧光探针包括荧光探针1和荧光探针2，其中，接触探针1、扩增探针1、荧光探针1、接触探针2、扩增探针2和荧光探针2的碱基序列分别为：接触探针1：5’‑TAGTTGGTAAGGTAACGGCTTACCAAGGCA(GTATJCGCJCTGFTATJCCG)‑3’；扩增探针1：5’‑CGGFATAJCAGFGCGFATAC(TCFACGJCFCTAJGGAFAAFG)‑3’；荧光探针1：5’‑CY3‑JTTJTCCFTAGJGFCGTJGA‑3’；接触探针2：5’‑AGGCGACTTTCTGGTCTGTAACTGACGCTG(AGTFAJCGCFGTAFCAAJTJ)‑3’；扩增探针2：5’‑FAFTTGJTACJGCGFTJACT(GCAFJTTACCGFAJJTACFT)‑3’；荧光探针2：5’‑FITC‑AJGTAFFTJCGGTAAFJTGC‑3’。