[发明专利]一种提高基因低频突变检测灵敏度的扩增子文库构建方法在审

专利信息
申请号: 201710382858.2 申请日: 2017-05-26
公开(公告)号: CN107058310A 公开(公告)日: 2017-08-18
发明(设计)人: 易建明;屈武斌;蔡万世;王瑞超;杭兴宜 申请(专利权)人: 艾吉泰康生物科技(北京)有限公司
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/68;C40B50/06
代理公司: 北京汇知杰知识产权代理事务所(普通合伙)11587 代理人: 蔡伦
地址: 102206 北京市昌平区北京市中关*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明涉及一种用于扩增子文库扩增和富集时使用的多重上游发卡结构引物及使用所述多重上游发卡结构引物提高基因低频突变检测灵敏度的扩增子文库构建方法,所述引物从3’端至5’端包括与目标区域序列互补配对的特异性序列A1;发卡结构的稳定序列A2;与5’端A7序列的反向互补序列A3;发卡结构的去稳定序列A4;条码序列A5;接头序列A6;5’端序列A7;A3和A7互补配对,形成所述多重上游发卡结构引物的茎结构;A4、A5和A6形成所述多重上游发卡结构引物的环部分。
搜索关键词: 一种 提高 基因 低频 突变 检测 灵敏度 扩增 文库 构建 方法
【主权项】:
一种用于扩增子文库扩增和富集时使用的多重上游发卡结构引物,所述引物从3’端至5’端包括序列A1‑A7:A1序列为特异性序列,与目标区域序列互补配对,引发扩增子的特异性扩增和富集;A2序列为发卡结构的稳定序列,由两个以上连续的C和G碱基构成;A3序列为5’端A7序列的反向互补序列;A4序列为发卡结构的去稳定序列,碱基个数为2‑8个,碱基序列中A和T多于G和C;A5序列为条码序列,由8‑16个简并碱基构成;A6序列为测序接头序列;A7序列为5’端序列,与A3序列反向互补;A3和A7互补配对,形成所述多重上游发卡结构引物的茎结构;A4、A5和A6形成所述多重上游发卡结构引物的环部分。
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