[发明专利]一种多重测序文库的构建方法有效
申请号: | 201610644131.2 | 申请日: | 2016-08-08 |
公开(公告)号: | CN106191037B | 公开(公告)日: | 2018-10-30 |
发明(设计)人: | 刘贵明;王绪敏;赵倍伦;吴双秀;于军 | 申请(专利权)人: | 中国科学院北京基因组研究所 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/6869;C40B50/06 |
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地址: | 101000 北京市朝阳区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明涉及分子生物学技术领域,具体涉及一种ITS序列多重测序文库的构建方法。所述的构建方法包括以下步骤:(1)、扩增PCR:使用引物F1和引物R1构成引物对,PCR扩增样品中的ITS1‑ITS4序列;(2)、建库PCR:使用引物F2和引物R2构成引物对,以步骤(1)获得的PCR产物为模板,进行PCR扩增。本发明提供的构建方法中所使用的40个Index,测序反应得到的数据质量和平衡性更好,测序结果更加准确;能够实现对多达15*15*10个不同文库样品的标记;不仅能够对动物肠道、水体以及大曲等复杂性相对较低的样品类型获得高特异的扩增产物;对土壤和淤泥等高复杂性的样品类型也具有较高的特异性。 | ||
搜索关键词: | 一种 多重 序文 构建 方法 | ||
【主权项】:
1.一种ITS序列多重测序文库的构建方法,其特征在于:所述的构建方法包括以下步骤:(1)、扩增PCR:使用引物F1和引物R1构成引物对,PCR扩增样品中的ITS1‑ITS4序列;(2)、建库PCR:使用引物F2和引物R2构成引物对,以步骤(1)获得的PCR产物为模板,进行PCR扩增;所述的构建方法中,引物F1是含有以下Index1‑30中的任意一个Index的ITS1序列的5’端扩增引物:
所述的ITS1序列的5’端扩增引物的序列为SEQ ID NO:1‑9所示的核苷酸序列中的任意一条序列,其中Index位于ITS1序列的5’端扩增引物的核苷酸序列中的第28和29个核苷酸之间;所述的引物R1是含有以下Index1‑30中的任意一个Index的ITS4序列的3’端扩增引物;
所述的ITS4序列的3’端扩增引物的序列为SEQ ID NO:10‑19中所示的任意一条核苷酸序列,其中Index位于ITS4序列的3’端扩增引物的核苷酸序列中的第29和30个核苷酸之间;所述的引物R2是在SEQ ID NO:20所示的核苷酸序列中包含了以下Index31‑40中的任意一个Index所构成的核苷酸序列,其中Index位于SEQ ID NO:20所示的核苷酸序列中的第24和25个核苷酸之间;
所述的引物F2的序列为SEQ ID NO:21所示的核苷酸序列;所述的引物F1、引物R1和引物R2中包含的Index的序列为不同核苷酸序列。
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