[发明专利]宿主外周血单个核细胞和T细胞的癌症DNA甲基化标志物有效
申请号: | 201610464441.6 | 申请日: | 2016-06-23 |
公开(公告)号: | CN107541565B | 公开(公告)日: | 2021-07-06 |
发明(设计)人: | 李宁;摩西·斯义夫;苏菲·彼得罗普洛斯;张永宏 | 申请(专利权)人: | 首都医科大学附属北京佑安医院;摩西·斯义夫 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6883 |
代理公司: | 上海市华诚律师事务所 31210 | 代理人: | 王金英 |
地址: | 100069 北京市丰*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明发现了癌症在宿主的T细胞和外周血单个核细胞(PBMC)的DNA中具有DNA甲基化标志物。本发明公开了源自PBMC的DNA的CG IDs,通过上述CG IDs在PBMC或T细胞的DNA中的甲基化水平预测肝细胞癌(HCC)临床进展分期和慢性肝炎。本发明还公开了,一种通过使用本发明所识别的CG IDs来预测HCC的试剂盒,以及焦磷酸测序DNA甲基化实验、受试者工作特征(ROC)实验、惩罚回归实验和层级聚类分析在预测HCC中的应用。本领域任一技术人员均可以使用本发明来获得用于任何癌症和任何癌症临床进展分期的DNA甲基化标志物。本发明描述的DNA甲基化标志物(CG IDs)将用于诊断:a.癌症;b.癌症不同临床进展分期;c.正在接受治疗的患者对治疗的反应;d.慢性乙型肝炎或慢性丙型肝炎。 | ||
搜索关键词: | 宿主 外周血 单个 细胞 癌症 dna 甲基化 标志 | ||
【主权项】:
用于预测癌症的癌症患者外周血单个核细胞(PBMC)的DNA甲基化标志物,所述DNA甲基化标志物是通过全基因组DNA甲基化映射(mapping)的方法而得到的,例如Illumina450K或850K实验、全基因组重亚硫酸盐测序、甲基化DNA免疫共沉淀(MeDIP)测序、或寡核苷酸微阵列杂交。
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