[发明专利]鸡MHC B-G座位全序列测定和SNP检测方法及试剂盒在审

专利信息
申请号: 201610280765.4 申请日: 2016-04-30
公开(公告)号: CN105838798A 公开(公告)日: 2016-08-10
发明(设计)人: 屠云洁;邹剑敏;束婧婷;章明;单艳菊;姬改革;龚建森;张笛 申请(专利权)人: 江苏省家禽科学研究所
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 扬州苏中专利事务所(普通合伙) 32222 代理人: 王玉霞
地址: 225125 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了鸡MHC B‑G座位全序列测定和SNP检测方法及试剂盒,属于生物技术领域。检测方法包括:(1)引物设计:设计鸡MHC B‑G座位全序列测定的特异性引物,特异性引物包括SEQ ID NO 1‑12;(2)DNA提取:从鸡全血中提取DNA;(3)PCR扩增;(4)琼脂糖胶电泳检测;(5)对目的片段进行克隆、测序;(6)SNP分析:所获序列用Clustalw软件进行比对,与Genbank基因序列进行比较,统计单倍型和单核苷酸多态性(SNP)。试剂盒,包括6对特异性引物信息SEQ ID NO 1‑12,灭菌双蒸水,dNTP,Taq酶,PCR扩增缓冲液。本发明为测定鸡MHC B‑G座位基因全序列,分析鸡MHC B‑G座位遗传多样性提供了技术平台。
搜索关键词: mhc 座位 序列 测定 snp 检测 方法 试剂盒
【主权项】:
鸡MHC B‑G座位全序列测定和SNP检测方法,其特征是,包括以下步骤:(1)引物设计:设计鸡MHC B‑G座位全序列测定的特异性引物,特异性引物包括SEQ ID NO 1‑12;(2)DNA提取:从鸡全血中提取DNA;(3)PCR扩增:以步骤(2)提取的DNA通过所述特异性引物SEQ ID NO 1‑6进行PCR扩增,获得目的片段;MHC B‑G座位特异性引物的PCR扩增在梯度PCR仪上进行;(4)琼脂糖胶电泳检测: PCR反应结束后,琼脂糖胶电泳检测反应是否成功,是否是目的片段;(5)对目的片段进行克隆、测序: PCR产物用1.0%的琼脂糖凝胶电泳分离,切胶,使用胶回收试剂盒回收,克隆,挑取单个白色菌落进行培养,挑选鉴定为阳性的克隆,双向测序;(6)SNP分析:将步骤(5)所获序列用Clustalw软件进行比对,与Genbank基因序列进行比较,统计单倍型和单核苷酸多态性SNP。
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