[发明专利]DNA条形码制备方法及草莓疫霉红心病菌DNA条形码有效

专利信息
申请号: 201610137584.6 申请日: 2016-03-10
公开(公告)号: CN105734049B 公开(公告)日: 2018-12-18
发明(设计)人: 高瑞芳;章桂明;程颖慧;汪莹;王颖 申请(专利权)人: 深圳出入境检验检疫局动植物检验检疫技术中心
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 代理人: 彭家恩
地址: 518045 *** 国省代码: 广东;44
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摘要: 本申请公开了一种DNA条形码制备方法及草莓疫霉红心病菌DNA条形码。本申请的制备方法,包括用高通量测序技术对靶标菌株基因组DNA进行测序,并对测序结果进行生物信息学分析,采用系统进化树分析基因组DNA中各基因片段进化关系,获得靶标菌株与同属菌株的相似度大于或等于95%、小于100%,片段不大于1000bp的单拷贝基因片段,对单拷贝基因片段进行遗传距离分析,能真实反映亲缘关系的即靶标菌株DNA条形码。本申请的制备方法,利用高通量测序技术对基因组DNA进行全面分析,并用系统进化树和遗传距离分析,获得DNA条形码;为DNA条形码制备提供了一种简单、有效途径;获得的DNA条形码能最有效表征靶标菌株。
搜索关键词: dna 条形码 制备 方法 草莓 红心 病菌
【主权项】:
1.草莓疫霉红心病菌的DNA条形码,其特征在于:所述DNA条形码为Seq IDNo.1至SeqIDNo.28所示序列的至少一条。
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