[发明专利]确定微生物种类的方法和装置在审
| 申请号： | 201510053351.3 | 申请日： | 2015-02-02 |
| 公开（公告）号： | CN105986013A | 公开（公告）日： | 2016-10-05 |
| 发明（设计）人： | 周天亮文;张纪斌;杨志凯;叶明芝 | 申请（专利权）人： | 广州华大基因医学检验所有限公司;深圳华大基因科技有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C12Q1/04;C12M1/00 |
| 代理公司： | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人： | 李志东 |
| 地址： | 510006 广东省广州市*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种确定样本中包含的微生物种类的方法，包括步骤：对待测样本中的至少一部分核酸进行测序，获得测序数据；将测序数据与第一参考序列比对，第一参考序列为待测样本来源的个体所属生物类别的已知序列，获得满足以下(1)-(3)至少之一的读段，(1)未比对上第一参考序列，(2)与第一参考序列的相似性低于预定比例，(3)比对上第一参考序列且比对质量低于阈值；将获得的读段与微生物参考序列进行比对，依据获得的比对结果确定所述待测样本中包含的微生物种类，微生物参考序列包括细菌、真菌、病毒和原生生物参考序列中的至少两种。本发明还公开一种确定样本中包含的微生物种类的装置以及一种检测病原微生物的方法。 | ||
| 搜索关键词： | 确定 微生物 种类 方法 装置 | ||
【主权项】：
一种确定样本中包含的微生物种类的方法，其特征在于，包括，对待测样本中的至少一部分核酸进行测序，获得测序数据，所述测序数据包括多个读段；将所述测序数据与第一参考序列比对，获得满足以下(1)‑(3)至少之一的读段，(1)未比对上所述第一参考序列，(2)与所述第一参考序列的相似性低于预定比例，(3)比对上所述第一参考序列且比对质量低于阈值，所述第一参考序列为所述待测样本来源的个体所属生物类别的已知序列；将获得的读段与微生物参考序列进行比对，依据获得的比对结果确定所述待测样本中包含的微生物种类，所述微生物参考序列包括细菌参考序列、真菌参考序列、病毒参考序列和原生生物参考序列中的至少两种。
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